More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0539 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_0539  Zn-dependent hydrolase, including glyoxylase  100 
 
 
210 aa  435  1e-121  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0442594  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0860  metallo-beta-lactamase family protein  51.17 
 
 
211 aa  223  1e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0522  metallo-beta-lactamase superfamily protein  46.51 
 
 
232 aa  186  2e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0198  beta-lactamase domain protein  44.71 
 
 
210 aa  159  4e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2989  beta-lactamase domain-containing protein  42.58 
 
 
209 aa  157  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.86043  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2375  beta-lactamase domain protein  44.17 
 
 
210 aa  155  6e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4114  beta-lactamase domain-containing protein  41.29 
 
 
209 aa  154  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4013  metallo-beta-lactamase family protein  40.8 
 
 
209 aa  153  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.098472  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4281  metallo-beta-lactamase family protein  40.8 
 
 
209 aa  153  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4375  metallo-beta-lactamase family protein  41.29 
 
 
209 aa  153  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0859  metallo-beta-lactamase family protein  41.29 
 
 
209 aa  152  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4341  metallo-beta-lactamase family protein  40.8 
 
 
209 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4394  metallo-beta-lactamase family protein  40.8 
 
 
209 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4003  metallo-beta-lactamase family protein  40.3 
 
 
209 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4163  metallo-beta-lactamase family protein  40.8 
 
 
208 aa  149  4e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00575624  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4485  metallo-beta-lactamase family protein  40.8 
 
 
208 aa  149  4e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.859552  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  38.68 
 
 
206 aa  141  6e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  35.07 
 
 
208 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1110  metallo-beta-lactamase family protein  37.91 
 
 
207 aa  138  4.999999999999999e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1637  beta-lactamase domain-containing protein  37.09 
 
 
207 aa  138  7e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.084203  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1603  beta-lactamase domain-containing protein  37.09 
 
 
207 aa  138  7e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0599073  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0549  beta-lactamase domain-containing protein  38.69 
 
 
216 aa  138  7.999999999999999e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141512  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1211  beta-lactamase domain protein  40.44 
 
 
211 aa  137  1e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000331215  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1949  beta-lactamase domain protein  40.74 
 
 
198 aa  134  7.000000000000001e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.857141  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  36.02 
 
 
205 aa  133  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1731  beta-lactamase domain protein  37.62 
 
 
208 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00010066  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1902  metallo-beta-lactamase family protein  36.79 
 
 
206 aa  131  9e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2191  metallo-beta-lactamase family protein  36.32 
 
 
206 aa  130  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  36.68 
 
 
207 aa  129  3e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  35.02 
 
 
207 aa  129  4.0000000000000003e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  34.58 
 
 
214 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0872  beta-lactamase domain protein  33.65 
 
 
209 aa  128  5.0000000000000004e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.172924  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2310  beta-lactamase domain protein  36.17 
 
 
246 aa  128  6e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.1865  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  34.91 
 
 
210 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  33.81 
 
 
217 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  39.39 
 
 
212 aa  125  5e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  32.35 
 
 
201 aa  124  7e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  33.33 
 
 
211 aa  124  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  34.6 
 
 
207 aa  124  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1817  beta-lactamase domain protein  37.57 
 
 
208 aa  123  2e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000015217  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2186  beta-lactamase domain protein  37.19 
 
 
210 aa  123  2e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.704345 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2261  beta-lactamase-like protein  35.15 
 
 
219 aa  124  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5067  beta-lactamase domain protein  37.93 
 
 
212 aa  123  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.533186  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  37.19 
 
 
205 aa  122  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  33.65 
 
 
205 aa  121  8e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1700  beta-lactamase domain protein  33.64 
 
 
234 aa  121  9e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153973  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  32.7 
 
 
209 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1949  beta-lactamase domain protein  34.48 
 
 
245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3818  beta-lactamase domain-containing protein  37.5 
 
 
231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.419873  normal  0.0855026 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  33.02 
 
 
213 aa  119  3e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3413  beta-lactamase domain protein  37.24 
 
 
209 aa  118  4.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0443  beta-lactamase domain protein  37.11 
 
 
208 aa  118  4.9999999999999996e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1608  beta-lactamase domain-containing protein  35.24 
 
 
206 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.130416  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2640  beta-lactamase domain protein  37.5 
 
 
206 aa  118  6e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3707  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
209 aa  117  7.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107683  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  33.81 
 
 
210 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0786  metallo-beta-lactamase family protein  35.89 
 
 
208 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0221878  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12170  beta-lactamase domain protein  34.16 
 
 
210 aa  117  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000265397  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2120  beta-lactamase domain protein  34.95 
 
 
231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.316298  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  32.55 
 
 
251 aa  115  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3479  Beta-lactamase-like  30.62 
 
 
218 aa  115  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  33.33 
 
 
209 aa  115  3.9999999999999997e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  33.18 
 
 
209 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0317  beta-lactamase domain-containing protein  32.37 
 
 
214 aa  115  6e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.605621  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0673  beta-lactamase domain-containing protein  36.67 
 
 
206 aa  114  7.999999999999999e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.20621  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3563  beta-lactamase domain protein  30.62 
 
 
218 aa  114  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0635  beta-lactamase domain-containing protein  35.07 
 
 
204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.320984  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  31.88 
 
 
215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2364  beta-lactamase domain protein  33.82 
 
 
231 aa  113  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  31.6 
 
 
215 aa  113  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  33.96 
 
 
210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  32.7 
 
 
209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1446  beta-lactamase domain-containing protein  29.13 
 
 
215 aa  112  3e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.746343  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3810  beta-lactamase domain-containing protein  32.89 
 
 
225 aa  112  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2799  beta-lactamase domain protein  31.88 
 
 
214 aa  112  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.130329  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2391  metallo-beta-lactamase family protein  31.4 
 
 
215 aa  112  3e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1088  metallo-beta-lactamase family protein  31.4 
 
 
215 aa  112  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153658  normal  0.346644 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2576  beta-lactamase domain-containing protein  31.88 
 
 
214 aa  112  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.835238  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1062  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.1 
 
 
215 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12601  glyoxalase II (hydroxyacylglutathione hydrolase)  35.81 
 
 
246 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0111807  normal  0.957918 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1171  beta-lactamase domain protein  35 
 
 
303 aa  112  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.361402  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1095  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.1 
 
 
215 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1112  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.1 
 
 
215 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347617  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1030  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.1 
 
 
215 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  hitchhiker  0.00661846 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1003  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.1 
 
 
215 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105674  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5856  beta-lactamase domain protein  35.47 
 
 
213 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.518272  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0418  beta-lactamase domain protein  37.56 
 
 
212 aa  112  5e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  31.4 
 
 
215 aa  112  6e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  31.4 
 
 
215 aa  112  6e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  31.4 
 
 
215 aa  112  6e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0711  beta-lactamase domain-containing protein  35.07 
 
 
217 aa  111  8.000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_691  metallo-beta-lactamase  36.02 
 
 
217 aa  111  9e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.664332  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00931  predicted metal-binding enzyme  31.4 
 
 
215 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  31.4 
 
 
215 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  29.72 
 
 
209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  31.4 
 
 
215 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1074  glyoxalase II family protein  34.45 
 
 
210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.905224  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0068  metallo-beta-lactamase superfamily protein  33.33 
 
 
212 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0554126  normal  0.354369 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1082  beta-lactamase domain protein  33.49 
 
 
222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3159  hydrolase  33.83 
 
 
215 aa  109  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>