More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2310 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2310  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 246 aa  492  9.999999999999999e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.1865  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1949  beta-lactamase domain protein  67.47 
 
 		 245 aa  317  7.999999999999999e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2120  beta-lactamase domain protein  57.69 
 
 		 231 aa  249  2e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.316298  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6103  beta-lactamase-like protein  53.68 
 
 		 231 aa  238  5.999999999999999e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1818  beta-lactamase domain-containing protein  53.85 
 
 		 238 aa  234  9e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.52487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1808  beta-lactamase domain-containing protein  53.42 
 
 		 238 aa  231  6e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000181534 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2087  hydrolase  51.91 
 
 		 224 aa  230  2e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2323  beta-lactamase domain-containing protein  54.35 
 
 		 222 aa  228  5e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.420202  normal  0.0208731 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2284  beta-lactamase-like protein  54.35 
 
 		 222 aa  228  5e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.459653  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2331  beta-lactamase domain-containing protein  54.35 
 
 		 222 aa  228  5e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.995633  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2055  beta-lactamase domain-containing protein  52.81 
 
 		 229 aa  225  5.0000000000000005e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2364  beta-lactamase domain protein  51.08 
 
 		 231 aa  223  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1700  beta-lactamase domain protein  51.72 
 
 		 234 aa  222  4e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153973  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3810  beta-lactamase domain-containing protein  50.64 
 
 		 225 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2396  beta-lactamase domain-containing protein  49.79 
 
 		 237 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.668368  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12601  glyoxalase II (hydroxyacylglutathione hydrolase)  48.47 
 
 		 246 aa  214  7e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0111807  normal  0.957918 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2589  beta-lactamase domain-containing protein  49.58 
 
 		 225 aa  214  9e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0687061  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3045  beta-lactamase domain protein  49.17 
 
 		 238 aa  214  9.999999999999999e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0136984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3167  beta-lactamase domain protein  48.95 
 
 		 231 aa  212  2.9999999999999995e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0163096  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3818  beta-lactamase domain-containing protein  51.75 
 
 		 231 aa  212  3.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.419873  normal  0.0855026 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1336  beta-lactamase domain-containing protein  50.62 
 
 		 256 aa  212  5.999999999999999e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.542543 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3091  hydrolase  47.26 
 
 		 225 aa  211  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3357  beta-lactamase domain protein  50.86 
 
 		 233 aa  204  1e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0111217  normal  0.160448 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15250  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  45.99 
 
 		 232 aa  189  2.9999999999999997e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00905017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15170  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  48.54 
 
 		 226 aa  185  7e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.112325 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  39.04 
 
 		 205 aa  152  4e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  38.16 
 
 		 205 aa  149  6e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  40.35 
 
 		 211 aa  146  3e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  38.16 
 
 		 208 aa  144  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  38.33 
 
 		 205 aa  144  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  39.57 
 
 		 214 aa  142  5e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2191  metallo-beta-lactamase family protein  35.9 
 
 		 206 aa  141  9e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1902  metallo-beta-lactamase family protein  35.9 
 
 		 206 aa  140  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  38.2 
 
 		 213 aa  140  9.999999999999999e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2375  beta-lactamase domain protein  41.44 
 
 		 210 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0549  beta-lactamase domain-containing protein  37.27 
 
 		 216 aa  139  3.9999999999999997e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141512  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  38.84 
 
 		 215 aa  139  4.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0198  beta-lactamase domain protein  39.83 
 
 		 210 aa  138  6e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0233  beta-lactamase-like  41.18 
 
 		 230 aa  137  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0571  beta-lactamase domain protein  40.27 
 
 		 221 aa  136  4e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.695514  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  35.53 
 
 		 206 aa  135  5e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4114  beta-lactamase domain-containing protein  39.09 
 
 		 209 aa  135  9e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4281  metallo-beta-lactamase family protein  40 
 
 		 209 aa  134  9e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1805  beta-lactamase domain protein  39.44 
 
 		 238 aa  135  9e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0524123  normal  0.122686 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4013  metallo-beta-lactamase family protein  40 
 
 		 209 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.098472  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4375  metallo-beta-lactamase family protein  39.55 
 
 		 209 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1949  beta-lactamase domain protein  36.77 
 
 		 198 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.857141  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  36.09 
 
 		 212 aa  134  9.999999999999999e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0859  metallo-beta-lactamase family protein  39.55 
 
 		 209 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4341  metallo-beta-lactamase family protein  39.55 
 
 		 209 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4003  metallo-beta-lactamase family protein  39.55 
 
 		 209 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4394  metallo-beta-lactamase family protein  39.55 
 
 		 209 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  37.17 
 
 		 209 aa  133  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  35.93 
 
 		 210 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  32.9 
 
 		 210 aa  132  6e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0317  beta-lactamase domain-containing protein  38.01 
 
 		 214 aa  131  7.999999999999999e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.605621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1679  beta-lactamase domain protein  37.04 
 
 		 265 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.132867  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  37.23 
 
 		 207 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4163  metallo-beta-lactamase family protein  40 
 
 		 208 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00575624  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4485  metallo-beta-lactamase family protein  40 
 
 		 208 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.859552  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0715  Beta-lactamase-like  40.27 
 
 		 222 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0113  beta-lactamase-like  40.64 
 
 		 224 aa  130  3e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.110968 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0374  beta-lactamase-like  36.49 
 
 		 222 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.834872 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1082  beta-lactamase domain protein  41.25 
 
 		 222 aa  130  3e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  34.89 
 
 		 207 aa  130  3e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2989  beta-lactamase domain-containing protein  38.74 
 
 		 209 aa  129  3e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.86043  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3014  beta-lactamase domain protein  39.65 
 
 		 213 aa  129  4.0000000000000003e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.309827  normal  0.0865031 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7673  metallo-hydrolase/oxidoreductase domain-containing protein  37.05 
 
 		 222 aa  129  6e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2799  beta-lactamase domain protein  38.36 
 
 		 214 aa  128  7.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.130329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2576  beta-lactamase domain-containing protein  38.36 
 
 		 214 aa  128  7.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.835238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0539  Zn-dependent hydrolase, including glyoxylase  36.17 
 
 		 210 aa  128  8.000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0442594  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  35.06 
 
 		 209 aa  128  9.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5856  beta-lactamase domain protein  41.89 
 
 		 213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.518272  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2261  beta-lactamase-like protein  39.37 
 
 		 219 aa  127  1.0000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2508  beta-lactamase domain protein  38.81 
 
 		 214 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.523411 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  34.63 
 
 		 209 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3707  beta-lactamase domain-containing protein  36.44 
 
 		 209 aa  126  4.0000000000000003e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0134  beta-lactamase-like  38.91 
 
 		 222 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  35.74 
 
 		 213 aa  123  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1648  beta-lactamase domain-containing protein  37.56 
 
 		 218 aa  124  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5335  beta-lactamase domain-containing protein  41.1 
 
 		 213 aa  124  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.311932  normal  0.0822687 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5067  beta-lactamase domain protein  34.5 
 
 		 212 aa  123  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.533186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1588  beta-lactamase domain-containing protein  37.1 
 
 		 237 aa  123  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3235  metallo-beta-lactamase family protein  36.65 
 
 		 213 aa  123  3e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2184  beta-lactamase domain-containing protein  37.44 
 
 		 215 aa  123  3e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0861591  normal  0.0986326 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1467  metallo-beta-lactamase family protein  38.18 
 
 		 218 aa  122  6e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1517  metallo-beta-lactamase family protein  38.18 
 
 		 218 aa  122  7e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2512  beta-lactamase domain protein  35.78 
 
 		 214 aa  121  8e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.738891  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3479  Beta-lactamase-like  37.04 
 
 		 218 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  35.65 
 
 		 209 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3119  beta-lactamase domain-containing protein  37.84 
 
 		 216 aa  120  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.603346  normal  0.30493 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0199  beta-lactamase domain-containing protein  35.22 
 
 		 214 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604325  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0988  metallo-beta-lactamase family protein  34.7 
 
 		 214 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0520901  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2269  beta-lactamase domain-containing protein  34.55 
 
 		 214 aa  119  3e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.289735 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0267  beta-lactamase domain-containing protein  34.35 
 
 		 214 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0213  beta-lactamase domain-containing protein  35.22 
 
 		 214 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.325973 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3655  beta-lactamase domain-containing protein  36.49 
 
 		 211 aa  119  3.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.658752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  33.18 
 
 		 215 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0285  beta-lactamase domain-containing protein  34.35 
 
 		 214 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394027  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  33.18 
 
 		 215 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>