More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0469 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
215 aa  433  1e-121  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  43 
 
 
205 aa  181  8.000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  45.24 
 
 
210 aa  180  1e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  40.38 
 
 
206 aa  177  1e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  43.41 
 
 
209 aa  177  1e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  41.83 
 
 
209 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  41.78 
 
 
214 aa  170  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  42.92 
 
 
209 aa  169  4e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  39.61 
 
 
205 aa  169  4e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  42.11 
 
 
208 aa  169  4e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  41.35 
 
 
209 aa  168  5e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  44.12 
 
 
212 aa  165  4e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4704  Beta-lactamase-like  39.07 
 
 
214 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0551492 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  42.58 
 
 
213 aa  162  4.0000000000000004e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2184  beta-lactamase domain-containing protein  42.72 
 
 
215 aa  162  5.0000000000000005e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0861591  normal  0.0986326 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  42.51 
 
 
205 aa  161  6e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3413  beta-lactamase domain protein  45.54 
 
 
209 aa  161  7e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0198  beta-lactamase domain protein  41.58 
 
 
210 aa  161  7e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  40.76 
 
 
207 aa  161  8.000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  39.05 
 
 
251 aa  161  9e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  44.71 
 
 
207 aa  160  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4688  hypothetical protein  40.87 
 
 
207 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42598  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4417  beta-lactamase domain-containing protein  39.07 
 
 
214 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.834565  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53510  hypothetical protein  39.9 
 
 
213 aa  158  6e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000645977 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  40.38 
 
 
210 aa  158  7e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  39.02 
 
 
213 aa  157  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0167  beta-lactamase-like  41.67 
 
 
212 aa  157  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1435  beta-lactamase domain-containing protein  42.08 
 
 
214 aa  157  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1500  beta-lactamase domain-containing protein  42.08 
 
 
214 aa  157  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.903392  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  39.23 
 
 
211 aa  156  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2375  beta-lactamase domain protein  40.19 
 
 
210 aa  155  3e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0811  beta-lactamase domain-containing protein  38.14 
 
 
214 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0215  beta-lactamase domain-containing protein  36.87 
 
 
215 aa  154  1e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.755925 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3651  beta-lactamase domain-containing protein  38.46 
 
 
215 aa  153  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0772  beta-lactamase domain protein  38.94 
 
 
214 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  37.5 
 
 
209 aa  153  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0549  beta-lactamase domain-containing protein  37.2 
 
 
216 aa  153  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141512  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0451  beta-lactamase domain protein  43.75 
 
 
213 aa  153  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  37.98 
 
 
207 aa  153  2e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1493  beta-lactamase domain-containing protein  41.09 
 
 
214 aa  153  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02708  hypothetical protein  40.89 
 
 
218 aa  152  2.9999999999999998e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2989  beta-lactamase domain-containing protein  37.38 
 
 
209 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.86043  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0797  beta-lactamase domain-containing protein  38.94 
 
 
238 aa  152  4e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.16357 
 
 
-
 
NC_004310  BR1517  metallo-beta-lactamase family protein  43.14 
 
 
218 aa  152  4e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1902  metallo-beta-lactamase family protein  37.5 
 
 
206 aa  152  4e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1467  metallo-beta-lactamase family protein  43.14 
 
 
218 aa  152  5e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0890  glyoxylase II family protein  39.05 
 
 
218 aa  152  5e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000389063  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2191  metallo-beta-lactamase family protein  37.5 
 
 
206 aa  152  5e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1648  beta-lactamase domain-containing protein  43.41 
 
 
218 aa  152  5e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4003  metallo-beta-lactamase family protein  36.41 
 
 
209 aa  151  7e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003129  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.38 
 
 
216 aa  151  8e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000730462  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1713  metallo-beta-lactamase family protein  42.18 
 
 
212 aa  151  8.999999999999999e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1782  Metallo-beta-lactamase  38.28 
 
 
217 aa  150  1e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.111003  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2240  beta-lactamase domain-containing protein  44.76 
 
 
213 aa  150  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4013  metallo-beta-lactamase family protein  35.92 
 
 
209 aa  149  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.098472  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4281  metallo-beta-lactamase family protein  35.92 
 
 
209 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0194  beta-lactamase domain-containing protein  43.35 
 
 
214 aa  150  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113604  hitchhiker  0.00000000306881 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2827  beta-lactamase domain-containing protein  39.6 
 
 
214 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0208272 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00776  probable metallo-beta-lactamase  38.54 
 
 
213 aa  149  3e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4053  beta-lactamase domain-containing protein  42.31 
 
 
212 aa  149  3e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000967513 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2142  metallo-beta-lactamase family protein  42.57 
 
 
214 aa  149  3e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.84321  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4114  beta-lactamase domain-containing protein  35.44 
 
 
209 aa  149  4e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2734  beta-lactamase domain-containing protein  39.6 
 
 
214 aa  148  5e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4341  metallo-beta-lactamase family protein  35.44 
 
 
209 aa  148  6e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4394  metallo-beta-lactamase family protein  35.44 
 
 
209 aa  148  6e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2954  beta-lactamase domain-containing protein  40.1 
 
 
214 aa  148  6e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2428  beta-lactamase domain-containing protein  39.6 
 
 
214 aa  147  8e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2508  beta-lactamase domain protein  40.69 
 
 
214 aa  147  9e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.523411 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2751  beta-lactamase domain-containing protein  39.11 
 
 
214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4163  metallo-beta-lactamase family protein  36.41 
 
 
208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00575624  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2186  beta-lactamase domain protein  41.75 
 
 
210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.704345 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0786  metallo-beta-lactamase family protein  39.61 
 
 
208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0221878  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4485  metallo-beta-lactamase family protein  36.41 
 
 
208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.859552  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5335  beta-lactamase domain-containing protein  42.65 
 
 
213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.311932  normal  0.0822687 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3563  beta-lactamase domain protein  39.34 
 
 
218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3433  beta-lactamase-like protein  40 
 
 
222 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111848  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0334  beta-lactamase domain-containing protein  41.09 
 
 
212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1625  beta-lactamase domain protein  39.11 
 
 
214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.224285  normal  0.185558 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0859  metallo-beta-lactamase family protein  35.44 
 
 
209 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  36.89 
 
 
210 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2087  hydrolase  37.39 
 
 
224 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0068  metallo-beta-lactamase superfamily protein  40.1 
 
 
212 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0554126  normal  0.354369 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3388  Beta-lactamase-like  41.38 
 
 
241 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0715  Beta-lactamase-like  42.16 
 
 
222 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0267  beta-lactamase domain-containing protein  41.38 
 
 
214 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12170  beta-lactamase domain protein  37.88 
 
 
210 aa  146  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000265397  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4375  metallo-beta-lactamase family protein  35.44 
 
 
209 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41150  metallo beta-lactamase-like protein  39.42 
 
 
213 aa  147  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0228  beta-lactamase domain-containing protein  41.09 
 
 
212 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3586  metallo-beta-lactamase family protein  40.28 
 
 
219 aa  146  3e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1088  metallo-beta-lactamase family protein  37.8 
 
 
215 aa  145  3e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153658  normal  0.346644 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2821  beta-lactamase-like  41.38 
 
 
237 aa  146  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5856  beta-lactamase domain protein  42.16 
 
 
213 aa  146  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.518272  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0285  beta-lactamase domain-containing protein  41.38 
 
 
214 aa  146  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394027  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1949  beta-lactamase domain protein  35.93 
 
 
245 aa  146  3e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0479  beta-lactamase domain protein  38.1 
 
 
212 aa  146  3e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3091  hydrolase  40.54 
 
 
225 aa  145  4.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513985  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3054  metallo-beta-lactamase family protein  39.11 
 
 
214 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3479  Beta-lactamase-like  38.39 
 
 
218 aa  145  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0220  beta-lactamase domain protein  40.59 
 
 
212 aa  144  7.0000000000000006e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>