More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0811 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_0811  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 214 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0797  beta-lactamase domain-containing protein  95.79 
 
 		 238 aa  420  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.16357 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4417  beta-lactamase domain-containing protein  95.33 
 
 		 214 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.834565  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0772  beta-lactamase domain protein  94.86 
 
 		 214 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3651  beta-lactamase domain-containing protein  86.05 
 
 		 215 aa  386  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4704  Beta-lactamase-like  83.64 
 
 		 214 aa  381  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551492 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41150  metallo beta-lactamase-like protein  83.02 
 
 		 213 aa  377  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4688  hypothetical protein  83.09 
 
 		 207 aa  363  1e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42598  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53510  hypothetical protein  81.78 
 
 		 213 aa  360  8e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000645977 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  45.45 
 
 		 209 aa  177  1e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  43 
 
 		 208 aa  170  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2524  beta-lactamase domain-containing protein  43.06 
 
 		 215 aa  161  8.000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  40.29 
 
 		 207 aa  160  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0451  beta-lactamase domain protein  41.67 
 
 		 213 aa  158  6e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  40.58 
 
 		 210 aa  157  9e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1648  beta-lactamase domain-containing protein  43.63 
 
 		 218 aa  157  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2142  metallo-beta-lactamase family protein  42.44 
 
 		 214 aa  157  1e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.84321  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  40.87 
 
 		 209 aa  154  7e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  38.76 
 
 		 251 aa  154  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5335  beta-lactamase domain-containing protein  39.15 
 
 		 213 aa  154  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.311932  normal  0.0822687 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  38.14 
 
 		 215 aa  154  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  39.61 
 
 		 209 aa  153  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2799  beta-lactamase domain protein  39.72 
 
 		 214 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.130329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2576  beta-lactamase domain-containing protein  39.72 
 
 		 214 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.835238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5856  beta-lactamase domain protein  40.09 
 
 		 213 aa  151  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.518272  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  39.42 
 
 		 209 aa  151  5.9999999999999996e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  38.46 
 
 		 210 aa  151  7e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1500  beta-lactamase domain-containing protein  40.49 
 
 		 214 aa  151  8e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.903392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1435  beta-lactamase domain-containing protein  40.49 
 
 		 214 aa  151  8.999999999999999e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3138  beta-lactamase domain protein  42.86 
 
 		 218 aa  150  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3016  beta-lactamase domain protein  40.2 
 
 		 219 aa  150  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1517  metallo-beta-lactamase family protein  40.39 
 
 		 218 aa  150  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0317  beta-lactamase domain-containing protein  39.44 
 
 		 214 aa  150  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.605621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1731  beta-lactamase domain protein  40.2 
 
 		 208 aa  150  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00010066  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  40.1 
 
 		 205 aa  149  3e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1713  metallo-beta-lactamase family protein  40.49 
 
 		 212 aa  149  3e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  40.58 
 
 		 207 aa  149  3e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  37.98 
 
 		 214 aa  149  3e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1467  metallo-beta-lactamase family protein  40.39 
 
 		 218 aa  149  3e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3268  Beta-lactamase-like  41.09 
 
 		 216 aa  148  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  37.8 
 
 		 209 aa  148  5e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1493  beta-lactamase domain-containing protein  40.49 
 
 		 214 aa  149  5e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0068  metallo-beta-lactamase superfamily protein  39.9 
 
 		 212 aa  148  7e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0554126  normal  0.354369 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2508  beta-lactamase domain protein  39.25 
 
 		 214 aa  147  8e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.523411 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3433  beta-lactamase-like protein  39.6 
 
 		 222 aa  147  8e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  38.94 
 
 		 213 aa  147  9e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0786  metallo-beta-lactamase family protein  39.8 
 
 		 208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0221878  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0167  beta-lactamase-like  40 
 
 		 212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02708  hypothetical protein  37.8 
 
 		 218 aa  146  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1782  Metallo-beta-lactamase  39.23 
 
 		 217 aa  147  2.0000000000000003e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.111003  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3413  beta-lactamase domain protein  39.11 
 
 		 209 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3054  metallo-beta-lactamase family protein  39.02 
 
 		 214 aa  146  3e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0536  beta-lactamase domain protein  40.2 
 
 		 226 aa  145  3e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0161694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2753  beta-lactamase domain protein  38.54 
 
 		 217 aa  146  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.254037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3119  beta-lactamase domain-containing protein  42.16 
 
 		 216 aa  145  4.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.603346  normal  0.30493 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  39.34 
 
 		 213 aa  145  6e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2821  beta-lactamase-like  39.11 
 
 		 237 aa  145  6e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1625  beta-lactamase domain protein  40.49 
 
 		 214 aa  145  6e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.224285  normal  0.185558 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0285  beta-lactamase domain-containing protein  39.11 
 
 		 214 aa  145  6e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394027  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2186  beta-lactamase domain protein  38.39 
 
 		 210 aa  145  6e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.704345 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0267  beta-lactamase domain-containing protein  39.11 
 
 		 214 aa  145  6e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003129  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.38 
 
 		 216 aa  144  7.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000730462  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2184  beta-lactamase domain-containing protein  39.02 
 
 		 215 aa  144  7.0000000000000006e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0861591  normal  0.0986326 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1088  metallo-beta-lactamase family protein  39.71 
 
 		 215 aa  144  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153658  normal  0.346644 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1634  beta-lactamase domain protein  39.32 
 
 		 211 aa  144  8.000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0717617  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3563  beta-lactamase domain protein  42.5 
 
 		 218 aa  144  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  39.9 
 
 		 205 aa  144  8.000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00931  predicted metal-binding enzyme  39.22 
 
 		 215 aa  144  9e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  39.22 
 
 		 215 aa  144  9e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  39.22 
 
 		 215 aa  144  9e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3479  Beta-lactamase-like  42 
 
 		 218 aa  144  9e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0549  beta-lactamase domain-containing protein  36.5 
 
 		 216 aa  144  9e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141512  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  39.22 
 
 		 215 aa  144  9e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1632  metallo-beta-lactamase family protein  39.11 
 
 		 214 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1588  beta-lactamase domain-containing protein  40.1 
 
 		 237 aa  144  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2909  metallo-beta-lactamase family protein  39.11 
 
 		 214 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.457315  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0044  metallo-beta-lactamase superfamily protein  39.6 
 
 		 214 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2734  beta-lactamase domain-containing protein  40 
 
 		 214 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0213  beta-lactamase domain-containing protein  39.6 
 
 		 214 aa  144  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.325973 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2969  metallo-beta-lactamase family protein  39.11 
 
 		 214 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3903  metallo-beta-lactamase family protein  39.11 
 
 		 214 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3822  metallo-beta-lactamase family protein  39.6 
 
 		 214 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0215  beta-lactamase domain-containing protein  40.49 
 
 		 215 aa  144  1e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.755925 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3400  metallo-beta-lactamase family protein  39.11 
 
 		 214 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00696268  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2751  beta-lactamase domain-containing protein  40 
 
 		 214 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0660  metallo-beta-lactamase family protein  41.98 
 
 		 234 aa  143  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.548963  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1446  beta-lactamase domain-containing protein  39.22 
 
 		 215 aa  143  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.746343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3388  Beta-lactamase-like  38.61 
 
 		 241 aa  143  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3466  beta-lactamase domain protein  41.38 
 
 		 218 aa  143  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3151  metallo-beta-lactamase family protein  39.11 
 
 		 214 aa  143  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0715  Beta-lactamase-like  37.16 
 
 		 222 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2391  metallo-beta-lactamase family protein  39.22 
 
 		 215 aa  143  2e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2428  beta-lactamase domain-containing protein  40 
 
 		 214 aa  143  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0228  beta-lactamase domain-containing protein  40.65 
 
 		 212 aa  143  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0841  Beta-lactamase-like  39.11 
 
 		 213 aa  142  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0225813 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  39.13 
 
 		 217 aa  142  3e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  37.5 
 
 		 206 aa  142  3e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3586  metallo-beta-lactamase family protein  41.43 
 
 		 219 aa  142  4e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1662  beta-lactamase domain protein  38.83 
 
 		 212 aa  142  4e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  38.73 
 
 		 215 aa  142  4e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>