More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1949 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1949  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 245 aa  483  1e-135  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2310  beta-lactamase domain protein  67.47 
 
 		 246 aa  317  7.999999999999999e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.1865  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2323  beta-lactamase domain-containing protein  56.03 
 
 		 222 aa  254  6e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.420202  normal  0.0208731 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2284  beta-lactamase-like protein  56.03 
 
 		 222 aa  254  6e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.459653  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2331  beta-lactamase domain-containing protein  56.03 
 
 		 222 aa  254  6e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.995633  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12601  glyoxalase II (hydroxyacylglutathione hydrolase)  55.17 
 
 		 246 aa  254  7e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0111807  normal  0.957918 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1818  beta-lactamase domain-containing protein  55.51 
 
 		 238 aa  249  2e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.52487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3810  beta-lactamase domain-containing protein  54.89 
 
 		 225 aa  246  3e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6103  beta-lactamase-like protein  55.26 
 
 		 231 aa  244  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1808  beta-lactamase domain-containing protein  55.51 
 
 		 238 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000181534 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2396  beta-lactamase domain-containing protein  52.4 
 
 		 237 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.668368  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2120  beta-lactamase domain protein  53.14 
 
 		 231 aa  241  7e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.316298  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2589  beta-lactamase domain-containing protein  54.66 
 
 		 225 aa  239  2e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0687061  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2055  beta-lactamase domain-containing protein  52.54 
 
 		 229 aa  239  4e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3167  beta-lactamase domain protein  53.72 
 
 		 231 aa  236  3e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0163096  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2087  hydrolase  51.71 
 
 		 224 aa  231  1e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1700  beta-lactamase domain protein  51.95 
 
 		 234 aa  229  3e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153973  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3091  hydrolase  50.85 
 
 		 225 aa  228  5e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1336  beta-lactamase domain-containing protein  52.96 
 
 		 256 aa  228  1e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.542543 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2364  beta-lactamase domain protein  50.86 
 
 		 231 aa  224  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3045  beta-lactamase domain protein  48.73 
 
 		 238 aa  211  5.999999999999999e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0136984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3818  beta-lactamase domain-containing protein  49.56 
 
 		 231 aa  209  3e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.419873  normal  0.0855026 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3357  beta-lactamase domain protein  51.48 
 
 		 233 aa  206  3e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0111217  normal  0.160448 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15170  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  52.42 
 
 		 226 aa  194  1e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.112325 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15250  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  44.73 
 
 		 232 aa  187  2e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00905017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4114  beta-lactamase domain-containing protein  41.67 
 
 		 209 aa  155  8e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  40.97 
 
 		 209 aa  154  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2508  beta-lactamase domain protein  41.41 
 
 		 214 aa  154  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.523411 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  42.42 
 
 		 211 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4375  metallo-beta-lactamase family protein  41.67 
 
 		 209 aa  152  5e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0859  metallo-beta-lactamase family protein  41.67 
 
 		 209 aa  152  5e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2799  beta-lactamase domain protein  41.33 
 
 		 214 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.130329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2576  beta-lactamase domain-containing protein  41.33 
 
 		 214 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.835238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2989  beta-lactamase domain-containing protein  40.17 
 
 		 209 aa  152  7e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.86043  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4341  metallo-beta-lactamase family protein  41.67 
 
 		 209 aa  151  8e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4394  metallo-beta-lactamase family protein  41.67 
 
 		 209 aa  151  8e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4281  metallo-beta-lactamase family protein  41.67 
 
 		 209 aa  151  8e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4013  metallo-beta-lactamase family protein  41.67 
 
 		 209 aa  151  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.098472  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2375  beta-lactamase domain protein  41.07 
 
 		 210 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  39.65 
 
 		 205 aa  150  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4003  metallo-beta-lactamase family protein  41.23 
 
 		 209 aa  149  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  39.47 
 
 		 214 aa  149  6e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0549  beta-lactamase domain-containing protein  38.91 
 
 		 216 aa  148  6e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141512  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4163  metallo-beta-lactamase family protein  41.67 
 
 		 208 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00575624  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4485  metallo-beta-lactamase family protein  41.67 
 
 		 208 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.859552  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1902  metallo-beta-lactamase family protein  37.39 
 
 		 206 aa  146  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  37.89 
 
 		 205 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2191  metallo-beta-lactamase family protein  36.96 
 
 		 206 aa  146  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  35.93 
 
 		 215 aa  146  4.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5856  beta-lactamase domain protein  41.07 
 
 		 213 aa  145  5e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.518272  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0198  beta-lactamase domain protein  39.66 
 
 		 210 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0317  beta-lactamase domain-containing protein  38.67 
 
 		 214 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.605621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0571  beta-lactamase domain protein  40.36 
 
 		 221 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.695514  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2261  beta-lactamase-like protein  41.07 
 
 		 219 aa  143  2e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  39.21 
 
 		 207 aa  143  3e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5335  beta-lactamase domain-containing protein  40.62 
 
 		 213 aa  142  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.311932  normal  0.0822687 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  35.93 
 
 		 212 aa  142  5e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  34.35 
 
 		 210 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0233  beta-lactamase-like  40.71 
 
 		 230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7673  metallo-hydrolase/oxidoreductase domain-containing protein  38.22 
 
 		 222 aa  139  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0715  Beta-lactamase-like  39.73 
 
 		 222 aa  139  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  38.6 
 
 		 213 aa  139  3.9999999999999997e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3119  beta-lactamase domain-containing protein  41.41 
 
 		 216 aa  139  3.9999999999999997e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.603346  normal  0.30493 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2240  beta-lactamase domain-containing protein  39.57 
 
 		 213 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  35.09 
 
 		 209 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3159  hydrolase  40.89 
 
 		 215 aa  138  6e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1949  beta-lactamase domain protein  36.82 
 
 		 198 aa  138  7.999999999999999e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.857141  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  37.99 
 
 		 208 aa  137  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  35.53 
 
 		 206 aa  137  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  35.09 
 
 		 209 aa  138  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  34.21 
 
 		 207 aa  137  1e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0374  beta-lactamase-like  37.44 
 
 		 222 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.834872 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3014  beta-lactamase domain protein  41.56 
 
 		 213 aa  136  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.309827  normal  0.0865031 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1082  beta-lactamase domain protein  43.4 
 
 		 222 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3151  metallo-beta-lactamase family protein  38.33 
 
 		 214 aa  135  5e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3552  beta-lactamase domain-containing protein  40.27 
 
 		 483 aa  135  9e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0134  beta-lactamase-like  38.12 
 
 		 222 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0418  beta-lactamase domain protein  38.53 
 
 		 212 aa  134  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0243  beta-lactamase domain protein  41.38 
 
 		 215 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0228  beta-lactamase domain-containing protein  39.56 
 
 		 212 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  36.12 
 
 		 205 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00931  predicted metal-binding enzyme  37.22 
 
 		 215 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  37.22 
 
 		 215 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1112  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.38 
 
 		 215 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1030  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.38 
 
 		 215 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  hitchhiker  0.00661846 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1095  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.38 
 
 		 215 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1003  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.38 
 
 		 215 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105674  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  37.22 
 
 		 215 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1062  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.38 
 
 		 215 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0285  beta-lactamase domain-containing protein  37 
 
 		 214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394027  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0194  beta-lactamase domain-containing protein  37.44 
 
 		 214 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113604  hitchhiker  0.00000000306881 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0267  beta-lactamase domain-containing protein  37 
 
 		 214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0334  beta-lactamase domain-containing protein  37.95 
 
 		 212 aa  133  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  37.22 
 
 		 215 aa  133  3e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  37.22 
 
 		 215 aa  133  3e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2821  beta-lactamase-like  37 
 
 		 237 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  37.67 
 
 		 215 aa  133  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  37.22 
 
 		 215 aa  133  3e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0113  beta-lactamase-like  39.56 
 
 		 224 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.110968 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  34.65 
 
 		 210 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>