More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3413 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_3413  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
209 aa  423  1e-117  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2853  beta-lactamase domain protein  62.44 
 
 
210 aa  261  4.999999999999999e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0786  metallo-beta-lactamase family protein  55.77 
 
 
208 aa  247  1e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0221878  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2186  beta-lactamase domain protein  56.8 
 
 
210 aa  240  1e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.704345 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0544  beta-lactamase domain-containing protein  55.34 
 
 
208 aa  219  3e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.591388  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1731  beta-lactamase domain protein  51.46 
 
 
208 aa  216  1e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00010066  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4163  metallo-beta-lactamase family protein  42.03 
 
 
208 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00575624  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4485  metallo-beta-lactamase family protein  42.03 
 
 
208 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.859552  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  42.57 
 
 
209 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  45.54 
 
 
215 aa  161  6e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  40.7 
 
 
251 aa  160  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4003  metallo-beta-lactamase family protein  41.83 
 
 
209 aa  159  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4281  metallo-beta-lactamase family protein  41.83 
 
 
209 aa  159  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4114  beta-lactamase domain-containing protein  41.35 
 
 
209 aa  159  4e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4013  metallo-beta-lactamase family protein  41.83 
 
 
209 aa  159  4e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.098472  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4375  metallo-beta-lactamase family protein  41.35 
 
 
209 aa  158  6e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0859  metallo-beta-lactamase family protein  41.35 
 
 
209 aa  157  7e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  41.58 
 
 
207 aa  157  7e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2989  beta-lactamase domain-containing protein  42.31 
 
 
209 aa  157  8e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.86043  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4341  metallo-beta-lactamase family protein  40.87 
 
 
209 aa  156  3e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4394  metallo-beta-lactamase family protein  40.87 
 
 
209 aa  156  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  41 
 
 
208 aa  154  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  41.58 
 
 
207 aa  151  5.9999999999999996e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  41.58 
 
 
210 aa  150  1e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0772  beta-lactamase domain protein  40.5 
 
 
214 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  38.24 
 
 
207 aa  148  5e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  40 
 
 
210 aa  148  5e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  39.51 
 
 
209 aa  148  6e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4417  beta-lactamase domain-containing protein  39.5 
 
 
214 aa  147  8e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.834565  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0418  beta-lactamase domain protein  38.86 
 
 
212 aa  147  8e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2375  beta-lactamase domain protein  40.49 
 
 
210 aa  147  9e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0811  beta-lactamase domain-containing protein  39.11 
 
 
214 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0797  beta-lactamase domain-containing protein  40 
 
 
238 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.16357 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4704  Beta-lactamase-like  39 
 
 
214 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0551492 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  40.09 
 
 
212 aa  143  1e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  41.06 
 
 
213 aa  144  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0198  beta-lactamase domain protein  39.25 
 
 
210 aa  144  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0549  beta-lactamase domain-containing protein  38.65 
 
 
216 aa  143  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141512  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41150  metallo beta-lactamase-like protein  41.5 
 
 
213 aa  142  4e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  41.9 
 
 
211 aa  141  6e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0571  beta-lactamase domain protein  38.94 
 
 
221 aa  141  9e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.695514  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0215  beta-lactamase domain-containing protein  36.54 
 
 
215 aa  140  9e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.755925 
 
 
-
 
NC_002950  PG1306  metallo-beta-lactamase family protein  39.34 
 
 
214 aa  140  9.999999999999999e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  39.61 
 
 
205 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3655  beta-lactamase domain-containing protein  41.43 
 
 
211 aa  140  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.658752  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  38.73 
 
 
214 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0334  beta-lactamase domain-containing protein  37.02 
 
 
212 aa  139  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53510  hypothetical protein  38.5 
 
 
213 aa  139  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000645977 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3707  beta-lactamase domain-containing protein  36.89 
 
 
209 aa  139  3e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107683  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2142  metallo-beta-lactamase family protein  38.1 
 
 
214 aa  139  3e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.84321  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0451  beta-lactamase domain protein  37.02 
 
 
213 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1411  beta-lactamase domain-containing protein  36.19 
 
 
214 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.557584  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3651  beta-lactamase domain-containing protein  37.81 
 
 
215 aa  138  4.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1732  beta-lactamase domain-containing protein  37.67 
 
 
214 aa  138  7e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37479  normal  0.0747191 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0394  putative metallo-beta-lactamase family protein  35.85 
 
 
215 aa  137  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0673  beta-lactamase domain-containing protein  43.14 
 
 
206 aa  136  2e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.20621  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4688  hypothetical protein  37.2 
 
 
207 aa  136  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42598  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1493  beta-lactamase domain-containing protein  34.29 
 
 
214 aa  137  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0228  beta-lactamase domain-containing protein  35.58 
 
 
212 aa  135  4e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0890  glyoxylase II family protein  35.55 
 
 
218 aa  135  5e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000389063  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12170  beta-lactamase domain protein  38.89 
 
 
210 aa  135  6.0000000000000005e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000265397  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2269  beta-lactamase domain-containing protein  36.79 
 
 
214 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.289735 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2428  beta-lactamase domain-containing protein  33.81 
 
 
214 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2954  beta-lactamase domain-containing protein  35.71 
 
 
214 aa  134  7.000000000000001e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  35.96 
 
 
209 aa  134  8e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7673  metallo-hydrolase/oxidoreductase domain-containing protein  37.2 
 
 
222 aa  134  8e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2524  beta-lactamase domain-containing protein  37.26 
 
 
215 aa  134  9e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0841  Beta-lactamase-like  38.28 
 
 
213 aa  134  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0225813 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3563  beta-lactamase domain protein  37.56 
 
 
218 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0715  Beta-lactamase-like  36.59 
 
 
222 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1782  Metallo-beta-lactamase  35.24 
 
 
217 aa  133  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.111003  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02708  hypothetical protein  36.49 
 
 
218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1662  beta-lactamase domain-containing protein  36.79 
 
 
223 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.220652  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1435  beta-lactamase domain-containing protein  34.29 
 
 
214 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1500  beta-lactamase domain-containing protein  34.29 
 
 
214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.903392  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003129  hydroxyacylglutathione hydrolase  35.07 
 
 
216 aa  133  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000730462  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00776  probable metallo-beta-lactamase  33.18 
 
 
213 aa  132  3e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0167  beta-lactamase-like  36.49 
 
 
212 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0282  beta-lactamase domain-containing protein  36.06 
 
 
240 aa  132  3.9999999999999996e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0630  hypothetical protein  36.57 
 
 
214 aa  132  3.9999999999999996e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3479  Beta-lactamase-like  38.5 
 
 
218 aa  131  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0233  beta-lactamase-like  38.1 
 
 
230 aa  131  6.999999999999999e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4053  beta-lactamase domain-containing protein  36.71 
 
 
212 aa  130  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000967513 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3054  metallo-beta-lactamase family protein  34.76 
 
 
214 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  38.5 
 
 
217 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0243  beta-lactamase domain protein  41.43 
 
 
215 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0068  metallo-beta-lactamase superfamily protein  35.1 
 
 
212 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0554126  normal  0.354369 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  35.64 
 
 
209 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  35.64 
 
 
209 aa  129  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1588  beta-lactamase domain-containing protein  35.07 
 
 
237 aa  129  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0220  beta-lactamase domain protein  34.76 
 
 
212 aa  129  3e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2508  beta-lactamase domain protein  35.89 
 
 
214 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.523411 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1635  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
214 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.702342  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2799  beta-lactamase domain protein  36.84 
 
 
214 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.130329  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2576  beta-lactamase domain-containing protein  36.84 
 
 
214 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.835238  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1755  beta-lactamase domain-containing protein  37.14 
 
 
235 aa  128  5.0000000000000004e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.622383  normal  0.422321 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4155  beta-lactamase domain protein  34.6 
 
 
212 aa  128  6e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000681201 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0092  putative metallo-beta-lactamase family protein  34.11 
 
 
215 aa  128  6e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.76232 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0134  beta-lactamase-like  36.71 
 
 
222 aa  128  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1637  beta-lactamase domain-containing protein  37.02 
 
 
207 aa  128  8.000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.084203  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>