More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3091 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3091  hydrolase  100 
 
 		 225 aa  441  1e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2087  hydrolase  65.77 
 
 		 224 aa  285  4e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2055  beta-lactamase domain-containing protein  56.25 
 
 		 229 aa  236  2e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2120  beta-lactamase domain protein  54.67 
 
 		 231 aa  233  1.0000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.316298  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6103  beta-lactamase-like protein  53.78 
 
 		 231 aa  231  5e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1949  beta-lactamase domain protein  50.85 
 
 		 245 aa  228  4e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3045  beta-lactamase domain protein  51.56 
 
 		 238 aa  218  6e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0136984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1700  beta-lactamase domain protein  51.34 
 
 		 234 aa  217  8.999999999999998e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153973  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2364  beta-lactamase domain protein  49.34 
 
 		 231 aa  214  9e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1818  beta-lactamase domain-containing protein  49.78 
 
 		 238 aa  214  9.999999999999999e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.52487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2396  beta-lactamase domain-containing protein  52.16 
 
 		 237 aa  212  2.9999999999999995e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.668368  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2310  beta-lactamase domain protein  47.26 
 
 		 246 aa  211  7.999999999999999e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.1865  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1808  beta-lactamase domain-containing protein  50.22 
 
 		 238 aa  210  2e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000181534 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3818  beta-lactamase domain-containing protein  48.88 
 
 		 231 aa  208  6e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.419873  normal  0.0855026 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3167  beta-lactamase domain protein  48.9 
 
 		 231 aa  203  2e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0163096  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1336  beta-lactamase domain-containing protein  49.59 
 
 		 256 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.542543 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3810  beta-lactamase domain-containing protein  48.65 
 
 		 225 aa  193  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12601  glyoxalase II (hydroxyacylglutathione hydrolase)  44.93 
 
 		 246 aa  190  2e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0111807  normal  0.957918 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2284  beta-lactamase-like protein  47.75 
 
 		 222 aa  189  4e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.459653  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2323  beta-lactamase domain-containing protein  47.75 
 
 		 222 aa  189  4e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.420202  normal  0.0208731 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2331  beta-lactamase domain-containing protein  47.75 
 
 		 222 aa  189  4e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.995633  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3357  beta-lactamase domain protein  45.29 
 
 		 233 aa  181  6e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0111217  normal  0.160448 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15170  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  51.36 
 
 		 226 aa  179  4e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.112325 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15250  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  45.02 
 
 		 232 aa  177  1e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00905017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2589  beta-lactamase domain-containing protein  46.4 
 
 		 225 aa  177  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0687061  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0198  beta-lactamase domain protein  39.55 
 
 		 210 aa  154  9e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  37.73 
 
 		 205 aa  154  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2375  beta-lactamase domain protein  39.91 
 
 		 210 aa  153  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1902  metallo-beta-lactamase family protein  34.84 
 
 		 206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3014  beta-lactamase domain protein  43.05 
 
 		 213 aa  146  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.309827  normal  0.0865031 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  37.73 
 
 		 205 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2191  metallo-beta-lactamase family protein  34.39 
 
 		 206 aa  146  3e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  40.54 
 
 		 215 aa  145  4.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  36.2 
 
 		 212 aa  142  3e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  40.27 
 
 		 211 aa  142  3e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2989  beta-lactamase domain-containing protein  36.2 
 
 		 209 aa  142  4e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.86043  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4003  metallo-beta-lactamase family protein  36.2 
 
 		 209 aa  142  6e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  39.73 
 
 		 209 aa  141  7e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0859  metallo-beta-lactamase family protein  36.2 
 
 		 209 aa  141  9e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4013  metallo-beta-lactamase family protein  36.2 
 
 		 209 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.098472  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4375  metallo-beta-lactamase family protein  36.2 
 
 		 209 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4281  metallo-beta-lactamase family protein  36.2 
 
 		 209 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4114  beta-lactamase domain-containing protein  36.2 
 
 		 209 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1805  beta-lactamase domain protein  43.61 
 
 		 238 aa  140  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0524123  normal  0.122686 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  38.43 
 
 		 214 aa  139  4.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4341  metallo-beta-lactamase family protein  35.29 
 
 		 209 aa  138  6e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4394  metallo-beta-lactamase family protein  35.29 
 
 		 209 aa  138  6e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1949  beta-lactamase domain protein  35.71 
 
 		 198 aa  138  6e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.857141  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  36.65 
 
 		 209 aa  138  7e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2261  beta-lactamase-like protein  39.73 
 
 		 219 aa  138  7e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  39.91 
 
 		 213 aa  137  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0786  metallo-beta-lactamase family protein  39.73 
 
 		 208 aa  137  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0221878  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2512  beta-lactamase domain protein  41.89 
 
 		 214 aa  137  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.738891  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0549  beta-lactamase domain-containing protein  33.8 
 
 		 216 aa  137  1e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141512  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0479  beta-lactamase domain protein  34.23 
 
 		 212 aa  137  1e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  38.46 
 
 		 213 aa  136  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  38.22 
 
 		 208 aa  136  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4163  metallo-beta-lactamase family protein  36.65 
 
 		 208 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00575624  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4485  metallo-beta-lactamase family protein  36.65 
 
 		 208 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.859552  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2508  beta-lactamase domain protein  38.18 
 
 		 214 aa  135  5e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.523411 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  38.01 
 
 		 209 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  37.78 
 
 		 207 aa  134  9e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  36.49 
 
 		 207 aa  132  3e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5856  beta-lactamase domain protein  40.81 
 
 		 213 aa  132  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.518272  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3707  beta-lactamase domain-containing protein  39.55 
 
 		 209 aa  132  6e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1679  beta-lactamase domain protein  44.71 
 
 		 265 aa  131  7.999999999999999e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.132867  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  35 
 
 		 205 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2799  beta-lactamase domain protein  37.27 
 
 		 214 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.130329  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  35.09 
 
 		 209 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2576  beta-lactamase domain-containing protein  37.27 
 
 		 214 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.835238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  34.55 
 
 		 210 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0194  beta-lactamase domain-containing protein  35.71 
 
 		 214 aa  128  6e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113604  hitchhiker  0.00000000306881 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00776  probable metallo-beta-lactamase  35.75 
 
 		 213 aa  128  6e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  34.67 
 
 		 251 aa  128  7.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0317  beta-lactamase domain-containing protein  36.07 
 
 		 214 aa  128  7.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.605621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3119  beta-lactamase domain-containing protein  38.46 
 
 		 216 aa  128  9.000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.603346  normal  0.30493 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  33.63 
 
 		 209 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  31.39 
 
 		 210 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3413  beta-lactamase domain protein  38.39 
 
 		 209 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0285  beta-lactamase domain-containing protein  33.78 
 
 		 214 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394027  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0267  beta-lactamase domain-containing protein  33.78 
 
 		 214 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  32.88 
 
 		 215 aa  126  3e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  32.88 
 
 		 215 aa  126  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  32.88 
 
 		 215 aa  126  3e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  30.77 
 
 		 206 aa  126  3e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2821  beta-lactamase-like  33.78 
 
 		 237 aa  126  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00931  predicted metal-binding enzyme  32.88 
 
 		 215 aa  125  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  32.88 
 
 		 215 aa  125  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  32.88 
 
 		 215 aa  125  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1201  metallo-beta-lactamase family protein  32.43 
 
 		 198 aa  125  4.0000000000000003e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0900  metallo-beta-lactamase family protein  32.88 
 
 		 198 aa  125  4.0000000000000003e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0830  metallo-beta-lactamase family protein  33.33 
 
 		 198 aa  125  4.0000000000000003e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0389556  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2652  beta-lactamase domain-containing protein  33.78 
 
 		 215 aa  125  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0560187  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1728  beta-lactamase domain-containing protein  34.23 
 
 		 215 aa  125  4.0000000000000003e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2561  metallo-beta-lactamase family protein  33.78 
 
 		 215 aa  125  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000219407  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1975  metallo-beta-lactamase superfamily protein  33.78 
 
 		 215 aa  125  4.0000000000000003e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0642346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0044  metallo-beta-lactamase superfamily protein  36.16 
 
 		 214 aa  125  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0199  beta-lactamase domain-containing protein  35.27 
 
 		 214 aa  125  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604325  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  35.48 
 
 		 201 aa  125  5e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3822  metallo-beta-lactamase family protein  36.16 
 
 		 214 aa  125  5e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>