More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2087 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2087  hydrolase  100 
 
 		 224 aa  449  1e-125  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2120  beta-lactamase domain protein  63.84 
 
 		 231 aa  288  4e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.316298  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3091  hydrolase  65.77 
 
 		 225 aa  285  4e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6103  beta-lactamase-like protein  61.09 
 
 		 231 aa  268  4e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2055  beta-lactamase domain-containing protein  61.71 
 
 		 229 aa  267  1e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2364  beta-lactamase domain protein  57.4 
 
 		 231 aa  253  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1700  beta-lactamase domain protein  57.66 
 
 		 234 aa  246  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153973  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2396  beta-lactamase domain-containing protein  54.98 
 
 		 237 aa  236  2e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.668368  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3810  beta-lactamase domain-containing protein  53.33 
 
 		 225 aa  231  7.000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1949  beta-lactamase domain protein  51.71 
 
 		 245 aa  231  8.000000000000001e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1818  beta-lactamase domain-containing protein  54.67 
 
 		 238 aa  230  1e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.52487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1808  beta-lactamase domain-containing protein  55.56 
 
 		 238 aa  229  2e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000181534 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2310  beta-lactamase domain protein  51.91 
 
 		 246 aa  230  2e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.1865  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2323  beta-lactamase domain-containing protein  54.63 
 
 		 222 aa  228  7e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.420202  normal  0.0208731 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2284  beta-lactamase-like protein  54.63 
 
 		 222 aa  228  7e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.459653  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2331  beta-lactamase domain-containing protein  54.63 
 
 		 222 aa  228  7e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.995633  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1336  beta-lactamase domain-containing protein  51.85 
 
 		 256 aa  223  2e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.542543 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3045  beta-lactamase domain protein  55.11 
 
 		 238 aa  221  9.999999999999999e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0136984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3167  beta-lactamase domain protein  55.16 
 
 		 231 aa  218  3.9999999999999997e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0163096  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12601  glyoxalase II (hydroxyacylglutathione hydrolase)  51.77 
 
 		 246 aa  218  5e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0111807  normal  0.957918 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3357  beta-lactamase domain protein  52.94 
 
 		 233 aa  218  6e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0111217  normal  0.160448 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3818  beta-lactamase domain-containing protein  52.7 
 
 		 231 aa  213  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.419873  normal  0.0855026 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2589  beta-lactamase domain-containing protein  51.56 
 
 		 225 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0687061  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15170  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  58.37 
 
 		 226 aa  202  4e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.112325 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15250  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  47.21 
 
 		 232 aa  192  3e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00905017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1902  metallo-beta-lactamase family protein  39.29 
 
 		 206 aa  160  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  37.1 
 
 		 205 aa  159  4e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2375  beta-lactamase domain protein  39.29 
 
 		 210 aa  157  9e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2191  metallo-beta-lactamase family protein  38.39 
 
 		 206 aa  157  2e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  38.18 
 
 		 210 aa  149  3e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0549  beta-lactamase domain-containing protein  37.21 
 
 		 216 aa  149  4e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141512  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0198  beta-lactamase domain protein  37.95 
 
 		 210 aa  147  9e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  34.82 
 
 		 210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  37.39 
 
 		 215 aa  146  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  35.71 
 
 		 212 aa  145  7.0000000000000006e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  36.65 
 
 		 205 aa  144  7.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  32.88 
 
 		 206 aa  144  9e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  37.38 
 
 		 205 aa  144  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3707  beta-lactamase domain-containing protein  38.71 
 
 		 209 aa  142  3e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  36.49 
 
 		 214 aa  142  6e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  39.56 
 
 		 211 aa  140  9.999999999999999e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  36.73 
 
 		 209 aa  139  4.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  32.43 
 
 		 207 aa  137  8.999999999999999e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  38.91 
 
 		 209 aa  137  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00931  predicted metal-binding enzyme  34.72 
 
 		 215 aa  135  4e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  34.72 
 
 		 215 aa  135  4e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1728  beta-lactamase domain-containing protein  36.07 
 
 		 215 aa  135  4e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  34.72 
 
 		 215 aa  135  4e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0479  beta-lactamase domain protein  33.93 
 
 		 212 aa  135  5e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2561  metallo-beta-lactamase family protein  34.68 
 
 		 215 aa  134  9e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000219407  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4003  metallo-beta-lactamase family protein  34.98 
 
 		 209 aa  134  9e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1975  metallo-beta-lactamase superfamily protein  34.68 
 
 		 215 aa  134  9e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0642346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2652  beta-lactamase domain-containing protein  34.68 
 
 		 215 aa  134  9e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0560187  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  34.72 
 
 		 215 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3014  beta-lactamase domain protein  39.09 
 
 		 213 aa  134  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.309827  normal  0.0865031 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  37.84 
 
 		 213 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2989  beta-lactamase domain-containing protein  35.14 
 
 		 209 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.86043  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  34.72 
 
 		 215 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  34.72 
 
 		 215 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4341  metallo-beta-lactamase family protein  34.98 
 
 		 209 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4013  metallo-beta-lactamase family protein  34.98 
 
 		 209 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.098472  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2391  metallo-beta-lactamase family protein  34.26 
 
 		 215 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1088  metallo-beta-lactamase family protein  34.72 
 
 		 215 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153658  normal  0.346644 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4281  metallo-beta-lactamase family protein  34.98 
 
 		 209 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  34.39 
 
 		 207 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4394  metallo-beta-lactamase family protein  34.98 
 
 		 209 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0571  beta-lactamase domain protein  36.36 
 
 		 221 aa  133  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.695514  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4114  beta-lactamase domain-containing protein  33.78 
 
 		 209 aa  132  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2512  beta-lactamase domain protein  39.01 
 
 		 214 aa  133  3e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.738891  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2261  beta-lactamase-like protein  39.63 
 
 		 219 aa  132  3e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4375  metallo-beta-lactamase family protein  34.53 
 
 		 209 aa  132  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1949  beta-lactamase domain protein  37.85 
 
 		 198 aa  133  3e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.857141  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0841  Beta-lactamase-like  35.27 
 
 		 213 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0225813 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  35.59 
 
 		 209 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5335  beta-lactamase domain-containing protein  38.57 
 
 		 213 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.311932  normal  0.0822687 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0859  metallo-beta-lactamase family protein  34.53 
 
 		 209 aa  132  5e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5856  beta-lactamase domain protein  40.27 
 
 		 213 aa  132  6e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.518272  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4163  metallo-beta-lactamase family protein  34.98 
 
 		 208 aa  131  7.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00575624  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4485  metallo-beta-lactamase family protein  34.98 
 
 		 208 aa  131  7.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.859552  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  35.14 
 
 		 209 aa  131  9e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  36.65 
 
 		 217 aa  131  9e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  34.38 
 
 		 251 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  34.26 
 
 		 215 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  36.94 
 
 		 213 aa  130  1.0000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2184  beta-lactamase domain-containing protein  37.05 
 
 		 215 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0861591  normal  0.0986326 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  35.43 
 
 		 208 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1030  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.64 
 
 		 215 aa  129  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  hitchhiker  0.00661846 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1062  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.64 
 
 		 215 aa  129  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1095  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.64 
 
 		 215 aa  129  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3014  beta-lactamase domain protein  34.65 
 
 		 213 aa  129  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1112  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.64 
 
 		 215 aa  129  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1003  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.64 
 
 		 215 aa  129  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105674  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1782  beta-lactamase domain protein  35.65 
 
 		 215 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00356762  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  37.17 
 
 		 209 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1082  beta-lactamase domain protein  41.12 
 
 		 222 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  35.59 
 
 		 207 aa  128  7.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0374  beta-lactamase-like  35.43 
 
 		 222 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.834872 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1679  beta-lactamase domain protein  43.06 
 
 		 265 aa  127  1.0000000000000001e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.132867  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1634  beta-lactamase domain protein  35 
 
 		 211 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0717617  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3563  beta-lactamase domain protein  37.85 
 
 		 218 aa  126  3e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>