More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0089 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
207 aa  423  1e-118  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  65.22 
 
 
208 aa  292  2e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  61.65 
 
 
251 aa  284  7e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  58.45 
 
 
209 aa  268  2.9999999999999997e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  61.35 
 
 
209 aa  268  4e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  57.97 
 
 
209 aa  259  2e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  56.52 
 
 
209 aa  254  7e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  53.14 
 
 
210 aa  230  1e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  53.88 
 
 
210 aa  225  4e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  50.25 
 
 
213 aa  207  6e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  51.2 
 
 
207 aa  200  9.999999999999999e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  48.31 
 
 
206 aa  196  2.0000000000000003e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0418  beta-lactamase domain protein  45.5 
 
 
212 aa  189  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  46.15 
 
 
207 aa  187  9e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  45.67 
 
 
205 aa  185  4e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3707  beta-lactamase domain-containing protein  46.38 
 
 
209 aa  184  7e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107683  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  45.67 
 
 
205 aa  182  3e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  42.51 
 
 
214 aa  180  1e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  44.44 
 
 
205 aa  179  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5335  beta-lactamase domain-containing protein  44.83 
 
 
213 aa  174  7e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.311932  normal  0.0822687 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  46.31 
 
 
211 aa  174  9.999999999999999e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5856  beta-lactamase domain protein  44.33 
 
 
213 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.518272  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  41.06 
 
 
209 aa  172  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00776  probable metallo-beta-lactamase  40.58 
 
 
213 aa  168  5e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  44.17 
 
 
212 aa  168  5e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  43.75 
 
 
213 aa  167  9e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2753  beta-lactamase domain protein  45.32 
 
 
217 aa  167  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.254037  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3016  beta-lactamase domain protein  45.32 
 
 
219 aa  167  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0113  beta-lactamase-like  44.33 
 
 
224 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.110968 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0571  beta-lactamase domain protein  40.89 
 
 
221 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.695514  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3479  Beta-lactamase-like  39.81 
 
 
218 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5067  beta-lactamase domain protein  38.94 
 
 
212 aa  162  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.533186  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0715  Beta-lactamase-like  41.38 
 
 
222 aa  162  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2240  beta-lactamase domain-containing protein  44.39 
 
 
213 aa  162  3e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3563  beta-lactamase domain protein  39.81 
 
 
218 aa  162  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  40.76 
 
 
215 aa  161  7e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0772  beta-lactamase domain protein  40.78 
 
 
214 aa  161  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1662  beta-lactamase domain-containing protein  38.65 
 
 
223 aa  161  8.000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.220652  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0811  beta-lactamase domain-containing protein  40.29 
 
 
214 aa  160  9e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2799  beta-lactamase domain protein  41.38 
 
 
214 aa  160  9e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.130329  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0233  beta-lactamase-like  42.36 
 
 
230 aa  160  9e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2184  beta-lactamase domain-containing protein  40.21 
 
 
215 aa  160  9e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0861591  normal  0.0986326 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2576  beta-lactamase domain-containing protein  41.38 
 
 
214 aa  160  9e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.835238  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1975  metallo-beta-lactamase superfamily protein  37.5 
 
 
215 aa  160  1e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0642346  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2652  beta-lactamase domain-containing protein  37.02 
 
 
215 aa  159  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0560187  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2261  beta-lactamase-like protein  38.05 
 
 
219 aa  160  2e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4688  hypothetical protein  40.29 
 
 
207 aa  159  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42598  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2561  metallo-beta-lactamase family protein  37.02 
 
 
215 aa  159  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000219407  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0797  beta-lactamase domain-containing protein  40.29 
 
 
238 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.16357 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2508  beta-lactamase domain protein  40.89 
 
 
214 aa  159  3e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.523411 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0215  beta-lactamase domain-containing protein  37.44 
 
 
215 aa  159  3e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.755925 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0786  metallo-beta-lactamase family protein  42.03 
 
 
208 aa  158  4e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0221878  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1522  Beta-lactamase-like  41.87 
 
 
214 aa  159  4e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53510  hypothetical protein  40.29 
 
 
213 aa  158  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000645977 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1634  beta-lactamase domain protein  39.13 
 
 
211 aa  158  7e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0717617  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3413  beta-lactamase domain protein  41.58 
 
 
209 aa  157  7e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0134  beta-lactamase-like  38.92 
 
 
222 aa  158  7e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4417  beta-lactamase domain-containing protein  39.32 
 
 
214 aa  157  7e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.834565  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0890  glyoxylase II family protein  36.41 
 
 
218 aa  157  9e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000389063  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3054  metallo-beta-lactamase family protein  37.32 
 
 
214 aa  157  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1713  metallo-beta-lactamase family protein  40.58 
 
 
212 aa  157  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4317  putative metallo-beta-lactamase family protein  39.11 
 
 
214 aa  157  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0451  beta-lactamase domain protein  41 
 
 
213 aa  157  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1662  beta-lactamase domain protein  39.61 
 
 
212 aa  157  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4704  Beta-lactamase-like  38.35 
 
 
214 aa  156  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0551492 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4155  beta-lactamase domain protein  38.16 
 
 
212 aa  156  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000681201 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0167  beta-lactamase-like  40.49 
 
 
212 aa  156  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003129  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.54 
 
 
216 aa  156  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000730462  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1500  beta-lactamase domain-containing protein  36.23 
 
 
214 aa  156  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.903392  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3651  beta-lactamase domain-containing protein  39.61 
 
 
215 aa  156  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0630  hypothetical protein  40 
 
 
214 aa  155  3e-37  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0317  beta-lactamase domain-containing protein  39.9 
 
 
214 aa  155  4e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.605621  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41150  metallo beta-lactamase-like protein  40.29 
 
 
213 aa  155  4e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0479  beta-lactamase domain protein  38.05 
 
 
212 aa  155  5.0000000000000005e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0549  beta-lactamase domain-containing protein  39.51 
 
 
216 aa  155  5.0000000000000005e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141512  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02708  hypothetical protein  34.47 
 
 
218 aa  155  5.0000000000000005e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0267  beta-lactamase domain-containing protein  38.61 
 
 
214 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3151  metallo-beta-lactamase family protein  38.61 
 
 
214 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2428  beta-lactamase domain-containing protein  38.76 
 
 
214 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1435  beta-lactamase domain-containing protein  36.23 
 
 
214 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1732  beta-lactamase domain-containing protein  36.67 
 
 
214 aa  155  5.0000000000000005e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37479  normal  0.0747191 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1493  beta-lactamase domain-containing protein  36.23 
 
 
214 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0872  beta-lactamase domain protein  39.71 
 
 
209 aa  155  6e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.172924  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0402  beta-lactamase domain protein  38.61 
 
 
214 aa  154  6e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2375  beta-lactamase domain protein  40.87 
 
 
210 aa  154  6e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2821  beta-lactamase-like  38.61 
 
 
237 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3235  metallo-beta-lactamase family protein  37.68 
 
 
213 aa  154  6e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0285  beta-lactamase domain-containing protein  38.61 
 
 
214 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394027  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0243  beta-lactamase domain protein  42.86 
 
 
215 aa  155  6e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  41.35 
 
 
210 aa  154  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1030  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.54 
 
 
215 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  hitchhiker  0.00661846 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1095  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.54 
 
 
215 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1112  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.54 
 
 
215 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347617  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0228  beta-lactamase domain-containing protein  37.68 
 
 
212 aa  154  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3631  beta-lactamase domain protein  39.81 
 
 
218 aa  154  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1003  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.54 
 
 
215 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105674  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1062  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.54 
 
 
215 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0374  beta-lactamase-like  39.49 
 
 
222 aa  153  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.834872 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2191  metallo-beta-lactamase family protein  38.46 
 
 
206 aa  152  2e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7673  metallo-hydrolase/oxidoreductase domain-containing protein  41.29 
 
 
222 aa  153  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>