More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3342 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
208 aa  421  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  66.18 
 
 
251 aa  301  3.0000000000000004e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  65.22 
 
 
207 aa  292  2e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  62.8 
 
 
209 aa  280  1e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  61.06 
 
 
209 aa  271  5.000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  60.58 
 
 
209 aa  268  4e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  59.62 
 
 
209 aa  266  2e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  53.62 
 
 
210 aa  231  6e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  50.97 
 
 
210 aa  225  4e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  52.4 
 
 
207 aa  212  3.9999999999999995e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  50.49 
 
 
213 aa  211  7.999999999999999e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  47.83 
 
 
205 aa  199  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  50 
 
 
205 aa  198  3.9999999999999996e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  46.86 
 
 
206 aa  197  7e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  47.34 
 
 
214 aa  194  1e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  47.6 
 
 
213 aa  190  1e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3479  Beta-lactamase-like  46.86 
 
 
218 aa  189  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3563  beta-lactamase domain protein  46.86 
 
 
218 aa  188  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  45.89 
 
 
209 aa  187  7e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0418  beta-lactamase domain protein  44.44 
 
 
212 aa  179  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3631  beta-lactamase domain protein  46.86 
 
 
218 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  45.24 
 
 
207 aa  179  2.9999999999999997e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0549  beta-lactamase domain-containing protein  43.48 
 
 
216 aa  179  2.9999999999999997e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141512  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3707  beta-lactamase domain-containing protein  44.93 
 
 
209 aa  179  2.9999999999999997e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107683  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  43.96 
 
 
211 aa  177  8e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5856  beta-lactamase domain protein  45.64 
 
 
213 aa  174  7e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.518272  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5335  beta-lactamase domain-containing protein  45.13 
 
 
213 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.311932  normal  0.0822687 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  43.48 
 
 
217 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  44.44 
 
 
205 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2184  beta-lactamase domain-containing protein  43.54 
 
 
215 aa  172  2.9999999999999996e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0861591  normal  0.0986326 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0772  beta-lactamase domain protein  43.48 
 
 
214 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0451  beta-lactamase domain protein  43.06 
 
 
213 aa  172  5e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0028  beta-lactamase domain-containing protein  43.6 
 
 
220 aa  170  1e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0137537  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0811  beta-lactamase domain-containing protein  43 
 
 
214 aa  170  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0797  beta-lactamase domain-containing protein  43.48 
 
 
238 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.16357 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4704  Beta-lactamase-like  42.03 
 
 
214 aa  169  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0551492 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  42.11 
 
 
215 aa  169  4e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1975  metallo-beta-lactamase superfamily protein  40.67 
 
 
215 aa  168  5e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0642346  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2652  beta-lactamase domain-containing protein  40.19 
 
 
215 aa  167  7e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0560187  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2561  metallo-beta-lactamase family protein  40.19 
 
 
215 aa  167  7e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000219407  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4417  beta-lactamase domain-containing protein  42.51 
 
 
214 aa  167  7e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.834565  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3016  beta-lactamase domain protein  46.15 
 
 
219 aa  168  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1435  beta-lactamase domain-containing protein  40.19 
 
 
214 aa  167  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1500  beta-lactamase domain-containing protein  40.19 
 
 
214 aa  167  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.903392  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3054  metallo-beta-lactamase family protein  38.46 
 
 
214 aa  166  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5067  beta-lactamase domain protein  40.58 
 
 
212 aa  166  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.533186  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0890  glyoxylase II family protein  40.1 
 
 
218 aa  166  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000389063  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4155  beta-lactamase domain protein  41.92 
 
 
212 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000681201 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1493  beta-lactamase domain-containing protein  38.94 
 
 
214 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1095  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.38 
 
 
215 aa  165  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2753  beta-lactamase domain protein  45.13 
 
 
217 aa  165  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.254037  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  40.87 
 
 
215 aa  165  4e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1062  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.38 
 
 
215 aa  165  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1030  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.38 
 
 
215 aa  165  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  hitchhiker  0.00661846 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1625  beta-lactamase domain protein  38.94 
 
 
214 aa  165  4e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.224285  normal  0.185558 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1003  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.38 
 
 
215 aa  165  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105674  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1112  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.38 
 
 
215 aa  165  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347617  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2240  beta-lactamase domain-containing protein  44.9 
 
 
213 aa  165  4e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2751  beta-lactamase domain-containing protein  38.94 
 
 
214 aa  165  4e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  40.38 
 
 
215 aa  164  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  40.38 
 
 
215 aa  164  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  40.38 
 
 
215 aa  164  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0479  beta-lactamase domain protein  40.2 
 
 
212 aa  164  6.9999999999999995e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2734  beta-lactamase domain-containing protein  38.94 
 
 
214 aa  164  8e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1088  metallo-beta-lactamase family protein  40.38 
 
 
215 aa  164  8e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153658  normal  0.346644 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00931  predicted metal-binding enzyme  40.38 
 
 
215 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  40.38 
 
 
215 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2391  metallo-beta-lactamase family protein  40.38 
 
 
215 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  40.38 
 
 
215 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1782  Metallo-beta-lactamase  37.38 
 
 
217 aa  164  1.0000000000000001e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.111003  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2428  beta-lactamase domain-containing protein  38.46 
 
 
214 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3651  beta-lactamase domain-containing protein  40.58 
 
 
215 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00776  probable metallo-beta-lactamase  38.46 
 
 
213 aa  162  3e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0113  beta-lactamase-like  45.64 
 
 
224 aa  162  3e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.110968 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3171  beta-lactamase domain protein  43.56 
 
 
211 aa  162  4.0000000000000004e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.343145 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  41.55 
 
 
212 aa  161  5.0000000000000005e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0715  Beta-lactamase-like  43.59 
 
 
222 aa  161  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0194  beta-lactamase domain-containing protein  40 
 
 
214 aa  161  6e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113604  hitchhiker  0.00000000306881 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2827  beta-lactamase domain-containing protein  38.46 
 
 
214 aa  161  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0208272 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1411  beta-lactamase domain-containing protein  38.46 
 
 
214 aa  160  9e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.557584  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0215  beta-lactamase domain-containing protein  42.56 
 
 
215 aa  160  9e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.755925 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0092  putative metallo-beta-lactamase family protein  41.55 
 
 
215 aa  160  1e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.76232 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0394  putative metallo-beta-lactamase family protein  41.03 
 
 
215 aa  160  1e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0267  beta-lactamase domain-containing protein  40 
 
 
214 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02708  hypothetical protein  38.16 
 
 
218 aa  159  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0374  beta-lactamase-like  42.56 
 
 
222 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.834872 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0233  beta-lactamase-like  43.59 
 
 
230 aa  160  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1662  beta-lactamase domain-containing protein  39.42 
 
 
223 aa  160  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.220652  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0285  beta-lactamase domain-containing protein  40 
 
 
214 aa  159  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394027  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1732  beta-lactamase domain-containing protein  37.86 
 
 
214 aa  160  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37479  normal  0.0747191 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4688  hypothetical protein  39.61 
 
 
207 aa  159  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42598  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0841  Beta-lactamase-like  40.67 
 
 
213 aa  159  3e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0225813 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3388  Beta-lactamase-like  40 
 
 
241 aa  159  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2821  beta-lactamase-like  40 
 
 
237 aa  159  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2191  metallo-beta-lactamase family protein  37.98 
 
 
206 aa  159  3e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2269  beta-lactamase domain-containing protein  39.42 
 
 
214 aa  159  4e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.289735 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1662  beta-lactamase domain protein  41.35 
 
 
212 aa  159  4e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3151  metallo-beta-lactamase family protein  38.46 
 
 
214 aa  158  4e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0334  beta-lactamase domain-containing protein  38.35 
 
 
212 aa  159  4e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0571  beta-lactamase domain protein  43.08 
 
 
221 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.695514  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>