More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1082 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1082  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 222 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2120  beta-lactamase domain protein  44.65 
 
 		 231 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.316298  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1808  beta-lactamase domain-containing protein  43.64 
 
 		 238 aa  149  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000181534 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1818  beta-lactamase domain-containing protein  43.64 
 
 		 238 aa  149  4e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.52487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6103  beta-lactamase-like protein  46.26 
 
 		 231 aa  148  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  43.13 
 
 		 209 aa  143  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1700  beta-lactamase domain protein  42.79 
 
 		 234 aa  142  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153973  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2989  beta-lactamase domain-containing protein  40.38 
 
 		 209 aa  141  9e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.86043  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  40.19 
 
 		 205 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3167  beta-lactamase domain protein  41.85 
 
 		 231 aa  139  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0163096  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2396  beta-lactamase domain-containing protein  40.79 
 
 		 237 aa  139  3e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.668368  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2055  beta-lactamase domain-containing protein  43.6 
 
 		 229 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  42.06 
 
 		 213 aa  138  6e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3045  beta-lactamase domain protein  42.92 
 
 		 238 aa  137  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0136984  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1949  beta-lactamase domain protein  43.4 
 
 		 245 aa  136  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3707  beta-lactamase domain-containing protein  41.83 
 
 		 209 aa  135  4e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  34.55 
 
 		 207 aa  135  5e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  41.83 
 
 		 211 aa  134  8e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  40 
 
 		 209 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  41.43 
 
 		 207 aa  134  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  40.19 
 
 		 213 aa  132  3e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  38.21 
 
 		 209 aa  132  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4163  metallo-beta-lactamase family protein  38.39 
 
 		 208 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00575624  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  37.74 
 
 		 209 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4485  metallo-beta-lactamase family protein  38.39 
 
 		 208 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.859552  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  36.77 
 
 		 205 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2310  beta-lactamase domain protein  41.25 
 
 		 246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.1865  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  34.55 
 
 		 205 aa  129  3e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2364  beta-lactamase domain protein  43.12 
 
 		 231 aa  129  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  36.24 
 
 		 212 aa  129  3e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2087  hydrolase  41.12 
 
 		 224 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4375  metallo-beta-lactamase family protein  37.5 
 
 		 209 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0859  metallo-beta-lactamase family protein  37.5 
 
 		 209 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  36.82 
 
 		 206 aa  127  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4114  beta-lactamase domain-containing protein  37.02 
 
 		 209 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4003  metallo-beta-lactamase family protein  38.68 
 
 		 209 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  34.4 
 
 		 210 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0549  beta-lactamase domain-containing protein  36.57 
 
 		 216 aa  126  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141512  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0198  beta-lactamase domain protein  38.28 
 
 		 210 aa  126  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  37.95 
 
 		 214 aa  126  3e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3818  beta-lactamase domain-containing protein  38.84 
 
 		 231 aa  126  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.419873  normal  0.0855026 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4281  metallo-beta-lactamase family protein  38.21 
 
 		 209 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4013  metallo-beta-lactamase family protein  37.5 
 
 		 209 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.098472  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  36.62 
 
 		 201 aa  125  4.0000000000000003e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  35.85 
 
 		 210 aa  125  6e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4341  metallo-beta-lactamase family protein  36.06 
 
 		 209 aa  124  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1902  metallo-beta-lactamase family protein  33.03 
 
 		 206 aa  124  1e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  35.87 
 
 		 207 aa  124  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4394  metallo-beta-lactamase family protein  36.06 
 
 		 209 aa  124  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2191  metallo-beta-lactamase family protein  32.58 
 
 		 206 aa  123  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3357  beta-lactamase domain protein  40.09 
 
 		 233 aa  123  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0111217  normal  0.160448 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2375  beta-lactamase domain protein  37.62 
 
 		 210 aa  122  4e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0418  beta-lactamase domain protein  33.48 
 
 		 212 aa  122  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  34.43 
 
 		 251 aa  122  5e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  38.03 
 
 		 208 aa  122  6e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3091  hydrolase  39.38 
 
 		 225 aa  122  6e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0890  glyoxylase II family protein  36.36 
 
 		 218 aa  121  7e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000389063  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  38.32 
 
 		 209 aa  121  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  38.03 
 
 		 215 aa  120  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1336  beta-lactamase domain-containing protein  37.96 
 
 		 256 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.542543 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  37.61 
 
 		 217 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0571  beta-lactamase domain protein  39.09 
 
 		 221 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.695514  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  34.11 
 
 		 210 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0872  beta-lactamase domain protein  35.19 
 
 		 209 aa  118  7.999999999999999e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.172924  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3479  Beta-lactamase-like  38.81 
 
 		 218 aa  116  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3413  beta-lactamase domain protein  35.45 
 
 		 209 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3159  hydrolase  36.36 
 
 		 215 aa  115  5e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1637  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 207 aa  114  7.999999999999999e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.084203  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1088  metallo-beta-lactamase family protein  34.17 
 
 		 215 aa  114  7.999999999999999e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153658  normal  0.346644 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1603  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 207 aa  114  7.999999999999999e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0599073  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3563  beta-lactamase domain protein  37.9 
 
 		 218 aa  114  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2508  beta-lactamase domain protein  40.91 
 
 		 214 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.523411 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2261  beta-lactamase-like protein  34.23 
 
 		 219 aa  114  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2323  beta-lactamase domain-containing protein  38.1 
 
 		 222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.420202  normal  0.0208731 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2284  beta-lactamase-like protein  38.1 
 
 		 222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.459653  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2331  beta-lactamase domain-containing protein  38.1 
 
 		 222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.995633  normal  0.216162 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00931  predicted metal-binding enzyme  33.67 
 
 		 215 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  33.67 
 
 		 215 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2799  beta-lactamase domain protein  40 
 
 		 214 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.130329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15250  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  37.12 
 
 		 232 aa  113  2.0000000000000002e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00905017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2391  metallo-beta-lactamase family protein  33.67 
 
 		 215 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2576  beta-lactamase domain-containing protein  40 
 
 		 214 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.835238  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  33.67 
 
 		 215 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12601  glyoxalase II (hydroxyacylglutathione hydrolase)  37.44 
 
 		 246 aa  113  3e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0111807  normal  0.957918 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3810  beta-lactamase domain-containing protein  36.84 
 
 		 225 aa  112  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  33.67 
 
 		 215 aa  113  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  33.67 
 
 		 215 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3631  beta-lactamase domain protein  36.87 
 
 		 218 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  33.67 
 
 		 215 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  33.67 
 
 		 215 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15170  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  43 
 
 		 226 aa  112  4.0000000000000004e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.112325 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12170  beta-lactamase domain protein  34.42 
 
 		 210 aa  111  7.000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000265397  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0785  metallo-beta-lactamase family protein  34.55 
 
 		 205 aa  111  8.000000000000001e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.721139  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0317  beta-lactamase domain-containing protein  37.85 
 
 		 214 aa  111  8.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.605621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0394  putative metallo-beta-lactamase family protein  40 
 
 		 215 aa  111  8.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5335  beta-lactamase domain-containing protein  37.37 
 
 		 213 aa  111  9e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.311932  normal  0.0822687 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003129  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.65 
 
 		 216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000730462  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2561  metallo-beta-lactamase family protein  32.32 
 
 		 215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000219407  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1782  Metallo-beta-lactamase  35.23 
 
 		 217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.111003  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3235  metallo-beta-lactamase family protein  33.03 
 
 		 213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>