More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1171 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_1171  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
303 aa  621  1e-177  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.361402  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0243  beta-lactamase domain protein  47.62 
 
 
215 aa  189  7e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0418  beta-lactamase domain protein  37.44 
 
 
212 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  39.02 
 
 
208 aa  149  6e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  37.91 
 
 
210 aa  145  9e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  37.25 
 
 
207 aa  144  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0630  hypothetical protein  33.18 
 
 
214 aa  144  2e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  38.57 
 
 
209 aa  142  6e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2561  metallo-beta-lactamase family protein  38.39 
 
 
215 aa  142  9e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000219407  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2652  beta-lactamase domain-containing protein  38.39 
 
 
215 aa  142  9e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0560187  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5067  beta-lactamase domain protein  35.71 
 
 
212 aa  142  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.533186  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1975  metallo-beta-lactamase superfamily protein  37.91 
 
 
215 aa  141  9.999999999999999e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0642346  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  36.97 
 
 
213 aa  140  3e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3014  beta-lactamase domain protein  36.36 
 
 
213 aa  140  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3235  metallo-beta-lactamase family protein  33.18 
 
 
213 aa  140  3e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  38.28 
 
 
211 aa  138  1e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  35.94 
 
 
214 aa  138  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  36.1 
 
 
201 aa  138  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00931  predicted metal-binding enzyme  38.46 
 
 
215 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  38.46 
 
 
215 aa  137  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2391  metallo-beta-lactamase family protein  38.94 
 
 
215 aa  137  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  38.46 
 
 
215 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  38.79 
 
 
217 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5335  beta-lactamase domain-containing protein  39.51 
 
 
213 aa  136  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.311932  normal  0.0822687 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  38.46 
 
 
215 aa  136  5e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1088  metallo-beta-lactamase family protein  38.46 
 
 
215 aa  136  5e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153658  normal  0.346644 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  38.46 
 
 
215 aa  136  5e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  34.43 
 
 
207 aa  136  5e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  38.46 
 
 
215 aa  136  5e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2184  beta-lactamase domain-containing protein  39.81 
 
 
215 aa  135  9e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0861591  normal  0.0986326 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  37.98 
 
 
215 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  38.31 
 
 
213 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  34.12 
 
 
210 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0044  metallo-beta-lactamase superfamily protein  36.06 
 
 
214 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3822  metallo-beta-lactamase family protein  35.92 
 
 
214 aa  133  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2909  metallo-beta-lactamase family protein  35.92 
 
 
214 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.457315  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2969  metallo-beta-lactamase family protein  35.92 
 
 
214 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3903  metallo-beta-lactamase family protein  35.92 
 
 
214 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3400  metallo-beta-lactamase family protein  35.92 
 
 
214 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00696268  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1632  metallo-beta-lactamase family protein  35.92 
 
 
214 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4688  hypothetical protein  36.95 
 
 
207 aa  133  5e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42598  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  35.98 
 
 
212 aa  133  5e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5856  beta-lactamase domain protein  38.05 
 
 
213 aa  132  6e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.518272  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1030  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.02 
 
 
215 aa  132  9e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  hitchhiker  0.00661846 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1095  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.02 
 
 
215 aa  132  9e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1112  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.02 
 
 
215 aa  132  9e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347617  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1003  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.02 
 
 
215 aa  132  9e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105674  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1062  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.02 
 
 
215 aa  132  9e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1782  beta-lactamase domain protein  37.56 
 
 
215 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00356762  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02708  hypothetical protein  35.24 
 
 
218 aa  132  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1713  metallo-beta-lactamase family protein  37.02 
 
 
212 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1411  beta-lactamase domain-containing protein  38.46 
 
 
214 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.557584  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  35.78 
 
 
210 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  34.76 
 
 
207 aa  131  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003129  hydroxyacylglutathione hydrolase  34.76 
 
 
216 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000730462  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0228  beta-lactamase domain-containing protein  37.38 
 
 
212 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0282  beta-lactamase domain-containing protein  37.86 
 
 
240 aa  130  3e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0194  beta-lactamase domain-containing protein  34.47 
 
 
214 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113604  hitchhiker  0.00000000306881 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4053  beta-lactamase domain-containing protein  39.11 
 
 
212 aa  130  4.0000000000000003e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000967513 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4155  beta-lactamase domain protein  32.38 
 
 
212 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000681201 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0890  glyoxylase II family protein  36.67 
 
 
218 aa  130  4.0000000000000003e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000389063  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3151  metallo-beta-lactamase family protein  34.95 
 
 
214 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3479  Beta-lactamase-like  37.56 
 
 
218 aa  129  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0571  beta-lactamase domain protein  36.36 
 
 
221 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.695514  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3563  beta-lactamase domain protein  37.8 
 
 
218 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1306  metallo-beta-lactamase family protein  32.69 
 
 
214 aa  127  2.0000000000000002e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0167  beta-lactamase-like  37.07 
 
 
212 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0394  putative metallo-beta-lactamase family protein  35.44 
 
 
215 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1634  beta-lactamase domain protein  38.05 
 
 
211 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0717617  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53510  hypothetical protein  35.47 
 
 
213 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000645977 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0215  beta-lactamase domain-containing protein  33.49 
 
 
215 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.755925 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1446  beta-lactamase domain-containing protein  35.58 
 
 
215 aa  127  3e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.746343  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  35.27 
 
 
209 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0841  Beta-lactamase-like  36.67 
 
 
213 aa  126  5e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0225813 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  33.17 
 
 
251 aa  125  7e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2054  beta-lactamase domain protein  37.09 
 
 
215 aa  125  8.000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.128768  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3388  Beta-lactamase-like  33.98 
 
 
241 aa  125  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  36.27 
 
 
215 aa  125  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3651  beta-lactamase domain-containing protein  33.49 
 
 
215 aa  125  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2853  beta-lactamase domain protein  35.75 
 
 
210 aa  124  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3004  beta-lactamase domain-containing protein  40.69 
 
 
204 aa  124  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.985459  normal  0.107301 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1522  Beta-lactamase-like  35.27 
 
 
214 aa  124  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0811  beta-lactamase domain-containing protein  34.98 
 
 
214 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1728  beta-lactamase domain-containing protein  35.07 
 
 
215 aa  124  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0285  beta-lactamase domain-containing protein  33.98 
 
 
214 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394027  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  33.82 
 
 
209 aa  124  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0267  beta-lactamase domain-containing protein  33.98 
 
 
214 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3171  beta-lactamase domain protein  36.67 
 
 
211 aa  123  3e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.343145 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0198  beta-lactamase domain protein  36.27 
 
 
210 aa  124  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2821  beta-lactamase-like  33.98 
 
 
237 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0334  beta-lactamase domain-containing protein  36.89 
 
 
212 aa  123  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0220  beta-lactamase domain protein  36.02 
 
 
212 aa  123  3e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0213  beta-lactamase domain-containing protein  33.01 
 
 
214 aa  123  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.325973 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3631  beta-lactamase domain protein  37.09 
 
 
218 aa  123  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  35.61 
 
 
205 aa  123  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0120  beta-lactamase domain-containing protein  35.24 
 
 
214 aa  122  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  33.98 
 
 
209 aa  122  6e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6103  beta-lactamase-like protein  38.16 
 
 
231 aa  122  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  33.18 
 
 
206 aa  122  8e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2240  beta-lactamase domain-containing protein  36.06 
 
 
213 aa  122  8e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>