More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0544 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0544  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 208 aa  419  1e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.591388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2853  beta-lactamase domain protein  64.08 
 
 		 210 aa  264  8e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0786  metallo-beta-lactamase family protein  58.25 
 
 		 208 aa  245  3e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0221878  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3413  beta-lactamase domain protein  55.34 
 
 		 209 aa  231  5e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2186  beta-lactamase domain protein  57.64 
 
 		 210 aa  229  2e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.704345 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1731  beta-lactamase domain protein  54.85 
 
 		 208 aa  229  3e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00010066  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  43.96 
 
 		 207 aa  156  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41150  metallo beta-lactamase-like protein  40.19 
 
 		 213 aa  148  5e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  37.98 
 
 		 209 aa  147  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0811  beta-lactamase domain-containing protein  40.1 
 
 		 214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4417  beta-lactamase domain-containing protein  39.9 
 
 		 214 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.834565  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0772  beta-lactamase domain protein  39.9 
 
 		 214 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3651  beta-lactamase domain-containing protein  38.1 
 
 		 215 aa  144  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0797  beta-lactamase domain-containing protein  38.94 
 
 		 238 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.16357 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4688  hypothetical protein  37.74 
 
 		 207 aa  143  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42598  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0549  beta-lactamase domain-containing protein  38.21 
 
 		 216 aa  142  3e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141512  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53510  hypothetical protein  38.28 
 
 		 213 aa  142  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000645977 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2142  metallo-beta-lactamase family protein  40.48 
 
 		 214 aa  141  8e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.84321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  40.98 
 
 		 215 aa  141  9e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4704  Beta-lactamase-like  37.32 
 
 		 214 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551492 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3479  Beta-lactamase-like  40.19 
 
 		 218 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  37.74 
 
 		 208 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3563  beta-lactamase domain protein  40.19 
 
 		 218 aa  139  3e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0215  beta-lactamase domain-containing protein  34.62 
 
 		 215 aa  139  3.9999999999999997e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.755925 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  38.03 
 
 		 209 aa  138  6e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  36.67 
 
 		 210 aa  136  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  37.62 
 
 		 251 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2375  beta-lactamase domain protein  37.62 
 
 		 210 aa  135  4e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0418  beta-lactamase domain protein  36.49 
 
 		 212 aa  135  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2989  beta-lactamase domain-containing protein  36.79 
 
 		 209 aa  135  4e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.86043  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3631  beta-lactamase domain protein  38.76 
 
 		 218 aa  134  8e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2184  beta-lactamase domain-containing protein  39.25 
 
 		 215 aa  134  9e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0861591  normal  0.0986326 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  35.89 
 
 		 209 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  38.76 
 
 		 212 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  38.94 
 
 		 217 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  36.97 
 
 		 209 aa  131  6e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  38.42 
 
 		 213 aa  131  7.999999999999999e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4163  metallo-beta-lactamase family protein  34.91 
 
 		 208 aa  131  9e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00575624  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4485  metallo-beta-lactamase family protein  34.91 
 
 		 208 aa  131  9e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.859552  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4003  metallo-beta-lactamase family protein  35.38 
 
 		 209 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4281  metallo-beta-lactamase family protein  35.38 
 
 		 209 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4375  metallo-beta-lactamase family protein  35.38 
 
 		 209 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00776  probable metallo-beta-lactamase  34.78 
 
 		 213 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0859  metallo-beta-lactamase family protein  35.38 
 
 		 209 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4394  metallo-beta-lactamase family protein  35.38 
 
 		 209 aa  129  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4341  metallo-beta-lactamase family protein  35.38 
 
 		 209 aa  129  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0841  Beta-lactamase-like  38.46 
 
 		 213 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0225813 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2428  beta-lactamase domain-containing protein  33.95 
 
 		 214 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4114  beta-lactamase domain-containing protein  35.85 
 
 		 209 aa  128  6e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1493  beta-lactamase domain-containing protein  34.88 
 
 		 214 aa  128  6e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1625  beta-lactamase domain protein  34.76 
 
 		 214 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.224285  normal  0.185558 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1500  beta-lactamase domain-containing protein  34.42 
 
 		 214 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.903392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0243  beta-lactamase domain protein  40 
 
 		 215 aa  128  7.000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  34.74 
 
 		 209 aa  127  8.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4013  metallo-beta-lactamase family protein  34.91 
 
 		 209 aa  127  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.098472  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2734  beta-lactamase domain-containing protein  34.76 
 
 		 214 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3054  metallo-beta-lactamase family protein  34.42 
 
 		 214 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2751  beta-lactamase domain-containing protein  34.76 
 
 		 214 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0285  beta-lactamase domain-containing protein  35.81 
 
 		 214 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394027  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1782  Metallo-beta-lactamase  36.71 
 
 		 217 aa  126  2.0000000000000002e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.111003  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0198  beta-lactamase domain protein  35.24 
 
 		 210 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1713  metallo-beta-lactamase family protein  37.14 
 
 		 212 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2821  beta-lactamase-like  36.67 
 
 		 237 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1435  beta-lactamase domain-containing protein  34.42 
 
 		 214 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1588  beta-lactamase domain-containing protein  37.84 
 
 		 237 aa  126  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0199  beta-lactamase domain-containing protein  36.67 
 
 		 214 aa  125  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604325  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2827  beta-lactamase domain-containing protein  33.49 
 
 		 214 aa  125  3e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0208272 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0267  beta-lactamase domain-containing protein  35.35 
 
 		 214 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0213  beta-lactamase domain-containing protein  36.67 
 
 		 214 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.325973 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0334  beta-lactamase domain-containing protein  38.54 
 
 		 212 aa  125  5e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  34.62 
 
 		 205 aa  124  8.000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0167  beta-lactamase-like  39.32 
 
 		 212 aa  124  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3091  hydrolase  41.23 
 
 		 225 aa  124  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0194  beta-lactamase domain-containing protein  35.71 
 
 		 214 aa  123  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113604  hitchhiker  0.00000000306881 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3388  Beta-lactamase-like  35.71 
 
 		 241 aa  123  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3151  metallo-beta-lactamase family protein  36.67 
 
 		 214 aa  122  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2269  beta-lactamase domain-containing protein  35.81 
 
 		 214 aa  122  3e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.289735 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2524  beta-lactamase domain-containing protein  38.57 
 
 		 215 aa  122  3e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0068  metallo-beta-lactamase superfamily protein  35.78 
 
 		 212 aa  122  4e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0554126  normal  0.354369 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  36.67 
 
 		 207 aa  122  4e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003129  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.65 
 
 		 216 aa  122  5e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000730462  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1411  beta-lactamase domain-containing protein  34.29 
 
 		 214 aa  122  5e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.557584  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2954  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 214 aa  121  6e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0451  beta-lactamase domain protein  38.05 
 
 		 213 aa  121  7e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0228  beta-lactamase domain-containing protein  36.89 
 
 		 212 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  35.24 
 
 		 214 aa  120  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1306  metallo-beta-lactamase family protein  32.21 
 
 		 214 aa  119  1.9999999999999998e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3822  metallo-beta-lactamase family protein  36.19 
 
 		 214 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3268  Beta-lactamase-like  35.98 
 
 		 216 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0044  metallo-beta-lactamase superfamily protein  36.19 
 
 		 214 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5067  beta-lactamase domain protein  33.18 
 
 		 212 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.533186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  36.41 
 
 		 210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3707  beta-lactamase domain-containing protein  34.47 
 
 		 209 aa  119  3e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3400  metallo-beta-lactamase family protein  35.71 
 
 		 214 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00696268  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2909  metallo-beta-lactamase family protein  35.71 
 
 		 214 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.457315  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1632  metallo-beta-lactamase family protein  35.71 
 
 		 214 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3903  metallo-beta-lactamase family protein  35.71 
 
 		 214 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2969  metallo-beta-lactamase family protein  35.71 
 
 		 214 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02708  hypothetical protein  31.75 
 
 		 218 aa  118  6e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1522  Beta-lactamase-like  36.45 
 
 		 214 aa  118  6e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>