More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0243 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0243  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 215 aa  443  1.0000000000000001e-124  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1171  beta-lactamase domain protein  47.62 
 
 		 303 aa  217  8.999999999999998e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.361402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0418  beta-lactamase domain protein  49.05 
 
 		 212 aa  203  1e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5067  beta-lactamase domain protein  41.9 
 
 		 212 aa  181  6e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.533186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  43.75 
 
 		 210 aa  178  5.999999999999999e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  42.86 
 
 		 207 aa  176  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  42.45 
 
 		 209 aa  176  3e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  42.45 
 
 		 209 aa  175  4e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3235  metallo-beta-lactamase family protein  41.63 
 
 		 213 aa  174  7e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  41.51 
 
 		 209 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  41.78 
 
 		 209 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0630  hypothetical protein  41.23 
 
 		 214 aa  172  2.9999999999999996e-42  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3014  beta-lactamase domain protein  39.71 
 
 		 213 aa  171  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  42.2 
 
 		 212 aa  169  2e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0715  Beta-lactamase-like  42.11 
 
 		 222 aa  168  5e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  41.31 
 
 		 214 aa  166  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5856  beta-lactamase domain protein  43.41 
 
 		 213 aa  166  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.518272  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  42.65 
 
 		 210 aa  166  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003129  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.18 
 
 		 216 aa  165  5e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000730462  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5335  beta-lactamase domain-containing protein  42.93 
 
 		 213 aa  164  9e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.311932  normal  0.0822687 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02708  hypothetical protein  39.27 
 
 		 218 aa  164  9e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  40.3 
 
 		 251 aa  163  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0890  glyoxylase II family protein  42.11 
 
 		 218 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000389063  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0134  beta-lactamase-like  40.38 
 
 		 222 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  41.31 
 
 		 207 aa  162  4.0000000000000004e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4155  beta-lactamase domain protein  42.38 
 
 		 212 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000681201 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3151  metallo-beta-lactamase family protein  41.31 
 
 		 214 aa  161  6e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1782  beta-lactamase domain protein  41.04 
 
 		 215 aa  161  7e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00356762  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  40.83 
 
 		 215 aa  161  8.000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  40.83 
 
 		 215 aa  161  8.000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  40.83 
 
 		 215 aa  161  8.000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2240  beta-lactamase domain-containing protein  41.95 
 
 		 213 aa  161  9e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00931  predicted metal-binding enzyme  40.83 
 
 		 215 aa  160  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  40.83 
 
 		 215 aa  160  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1306  metallo-beta-lactamase family protein  41.63 
 
 		 214 aa  160  1e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0571  beta-lactamase domain protein  41.26 
 
 		 221 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.695514  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  40.83 
 
 		 215 aa  160  1e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  40.37 
 
 		 215 aa  160  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1088  metallo-beta-lactamase family protein  40.37 
 
 		 215 aa  160  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153658  normal  0.346644 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0213  beta-lactamase domain-containing protein  40.85 
 
 		 214 aa  159  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.325973 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2391  metallo-beta-lactamase family protein  40.37 
 
 		 215 aa  159  3e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1634  beta-lactamase domain protein  40.09 
 
 		 211 aa  159  4e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0717617  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0374  beta-lactamase-like  40.69 
 
 		 222 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.834872 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0199  beta-lactamase domain-containing protein  40.85 
 
 		 214 aa  158  5e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604325  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0194  beta-lactamase domain-containing protein  41.12 
 
 		 214 aa  158  5e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113604  hitchhiker  0.00000000306881 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2853  beta-lactamase domain protein  43.66 
 
 		 210 aa  158  5e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2269  beta-lactamase domain-containing protein  43.66 
 
 		 214 aa  158  6e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.289735 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0215  beta-lactamase domain-containing protein  40 
 
 		 215 aa  158  6e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.755925 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0841  Beta-lactamase-like  40.74 
 
 		 213 aa  157  9e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0225813 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  41.35 
 
 		 209 aa  157  9e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0044  metallo-beta-lactamase superfamily protein  40.85 
 
 		 214 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3822  metallo-beta-lactamase family protein  40.85 
 
 		 214 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  41.2 
 
 		 213 aa  157  1e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1662  beta-lactamase domain protein  40.09 
 
 		 212 aa  157  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3054  metallo-beta-lactamase family protein  39.91 
 
 		 214 aa  156  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2909  metallo-beta-lactamase family protein  40.38 
 
 		 214 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.457315  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1632  metallo-beta-lactamase family protein  40.38 
 
 		 214 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2969  metallo-beta-lactamase family protein  40.38 
 
 		 214 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3903  metallo-beta-lactamase family protein  40.38 
 
 		 214 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2508  beta-lactamase domain protein  42.03 
 
 		 214 aa  156  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.523411 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2142  metallo-beta-lactamase family protein  40.38 
 
 		 214 aa  156  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.84321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3400  metallo-beta-lactamase family protein  40.38 
 
 		 214 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00696268  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  40.3 
 
 		 213 aa  155  3e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3388  Beta-lactamase-like  40.38 
 
 		 241 aa  155  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3016  beta-lactamase domain protein  42.79 
 
 		 219 aa  156  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0267  beta-lactamase domain-containing protein  40.38 
 
 		 214 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  41.78 
 
 		 207 aa  155  5.0000000000000005e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2821  beta-lactamase-like  40.38 
 
 		 237 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1446  beta-lactamase domain-containing protein  38.07 
 
 		 215 aa  155  5.0000000000000005e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.746343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0285  beta-lactamase domain-containing protein  40.38 
 
 		 214 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394027  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2954  beta-lactamase domain-containing protein  40.38 
 
 		 214 aa  155  6e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1500  beta-lactamase domain-containing protein  38.53 
 
 		 214 aa  155  6e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.903392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0068  metallo-beta-lactamase superfamily protein  40.65 
 
 		 212 aa  154  8e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0554126  normal  0.354369 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2054  beta-lactamase domain protein  40.09 
 
 		 215 aa  154  8e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.128768  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1728  beta-lactamase domain-containing protein  39.15 
 
 		 215 aa  154  8e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1435  beta-lactamase domain-containing protein  38.53 
 
 		 214 aa  154  9e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  37.44 
 
 		 208 aa  154  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2753  beta-lactamase domain protein  42.36 
 
 		 217 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.254037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3159  hydrolase  41.26 
 
 		 215 aa  154  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1975  metallo-beta-lactamase superfamily protein  39.15 
 
 		 215 aa  153  2e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0642346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2989  beta-lactamase domain-containing protein  43.87 
 
 		 209 aa  153  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.86043  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2428  beta-lactamase domain-containing protein  39.91 
 
 		 214 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7673  metallo-hydrolase/oxidoreductase domain-containing protein  41.26 
 
 		 222 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2652  beta-lactamase domain-containing protein  39.15 
 
 		 215 aa  152  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0560187  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2561  metallo-beta-lactamase family protein  39.15 
 
 		 215 aa  152  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000219407  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2184  beta-lactamase domain-containing protein  37.67 
 
 		 215 aa  152  2.9999999999999998e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0861591  normal  0.0986326 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0317  beta-lactamase domain-containing protein  40 
 
 		 214 aa  152  4e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.605621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1112  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.61 
 
 		 215 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1062  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.61 
 
 		 215 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1003  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.61 
 
 		 215 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105674  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1030  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.61 
 
 		 215 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  hitchhiker  0.00661846 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2576  beta-lactamase domain-containing protein  41.06 
 
 		 214 aa  152  4e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.835238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1095  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.61 
 
 		 215 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2799  beta-lactamase domain protein  41.06 
 
 		 214 aa  152  4e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.130329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1493  beta-lactamase domain-containing protein  38.99 
 
 		 214 aa  152  5e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0233  beta-lactamase-like  40.78 
 
 		 230 aa  151  5.9999999999999996e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  40.09 
 
 		 205 aa  151  7e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  39.81 
 
 		 217 aa  150  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0113  beta-lactamase-like  43 
 
 		 224 aa  149  2e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.110968 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0120  beta-lactamase domain-containing protein  39.91 
 
 		 214 aa  150  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>