More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_3004 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_3004  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
204 aa  396  1e-109  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.985459  normal  0.107301 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3171  beta-lactamase domain protein  74.02 
 
 
211 aa  298  4e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.343145 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2261  beta-lactamase-like protein  51.92 
 
 
219 aa  197  7.999999999999999e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  48.31 
 
 
214 aa  167  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  45.41 
 
 
211 aa  166  2e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3707  beta-lactamase domain-containing protein  44.5 
 
 
209 aa  159  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107683  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0215  beta-lactamase domain-containing protein  42.11 
 
 
215 aa  159  3e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.755925 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  44.55 
 
 
208 aa  158  4e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0673  beta-lactamase domain-containing protein  44.55 
 
 
206 aa  156  2e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.20621  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  43.84 
 
 
209 aa  151  5e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  38.46 
 
 
212 aa  150  2e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  43.78 
 
 
213 aa  149  4e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  40.2 
 
 
251 aa  148  4e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2375  beta-lactamase domain protein  41.9 
 
 
210 aa  148  4e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3014  beta-lactamase domain protein  45.97 
 
 
213 aa  148  6e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.309827  normal  0.0865031 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  39.71 
 
 
209 aa  148  6e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  41.06 
 
 
207 aa  147  9e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  40.58 
 
 
210 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5067  beta-lactamase domain protein  40 
 
 
212 aa  145  4.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.533186  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2989  beta-lactamase domain-containing protein  40.67 
 
 
209 aa  145  5e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.86043  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0635  beta-lactamase domain-containing protein  40.59 
 
 
204 aa  143  2e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.320984  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0198  beta-lactamase domain protein  41.15 
 
 
210 aa  142  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4341  metallo-beta-lactamase family protein  38.46 
 
 
209 aa  142  4e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4394  metallo-beta-lactamase family protein  38.46 
 
 
209 aa  142  4e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4003  metallo-beta-lactamase family protein  38.94 
 
 
209 aa  141  6e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4375  metallo-beta-lactamase family protein  37.98 
 
 
209 aa  141  8e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4114  beta-lactamase domain-containing protein  37.5 
 
 
209 aa  140  9e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1700  beta-lactamase domain protein  44.5 
 
 
234 aa  140  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153973  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0859  metallo-beta-lactamase family protein  37.98 
 
 
209 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4013  metallo-beta-lactamase family protein  38.46 
 
 
209 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.098472  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2191  metallo-beta-lactamase family protein  37.98 
 
 
206 aa  140  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1902  metallo-beta-lactamase family protein  38.46 
 
 
206 aa  140  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4281  metallo-beta-lactamase family protein  38.46 
 
 
209 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1608  beta-lactamase domain-containing protein  39.41 
 
 
206 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.130416  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4163  metallo-beta-lactamase family protein  37.68 
 
 
208 aa  138  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00575624  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4485  metallo-beta-lactamase family protein  37.68 
 
 
208 aa  138  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.859552  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1522  Beta-lactamase-like  42.79 
 
 
214 aa  138  4.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0418  beta-lactamase domain protein  37.44 
 
 
212 aa  138  7e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  39.11 
 
 
209 aa  137  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  38.16 
 
 
205 aa  136  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5856  beta-lactamase domain protein  43.28 
 
 
213 aa  136  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.518272  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1336  beta-lactamase domain-containing protein  42.32 
 
 
256 aa  136  2e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.542543 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1603  beta-lactamase domain-containing protein  36.36 
 
 
207 aa  135  4e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0599073  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1637  beta-lactamase domain-containing protein  36.36 
 
 
207 aa  135  4e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.084203  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3235  metallo-beta-lactamase family protein  37.86 
 
 
213 aa  134  8e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  40 
 
 
215 aa  134  8e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5335  beta-lactamase domain-containing protein  42.36 
 
 
213 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.311932  normal  0.0822687 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0549  beta-lactamase domain-containing protein  36.59 
 
 
216 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141512  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1171  beta-lactamase domain protein  40.69 
 
 
303 aa  134  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.361402  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1411  beta-lactamase domain-containing protein  40.19 
 
 
214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.557584  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  35.5 
 
 
210 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0228  beta-lactamase domain-containing protein  39.42 
 
 
212 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  37.62 
 
 
209 aa  132  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2240  beta-lactamase domain-containing protein  43.72 
 
 
213 aa  132  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2055  beta-lactamase domain-containing protein  40.55 
 
 
229 aa  132  3e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1731  beta-lactamase domain protein  40.49 
 
 
208 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00010066  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2184  beta-lactamase domain-containing protein  37.02 
 
 
215 aa  131  6e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0861591  normal  0.0986326 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  37.2 
 
 
206 aa  131  7.999999999999999e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0479  beta-lactamase domain protein  35.89 
 
 
212 aa  130  1.0000000000000001e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2364  beta-lactamase domain protein  40.91 
 
 
231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3014  beta-lactamase domain protein  36.71 
 
 
213 aa  130  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6103  beta-lactamase-like protein  41.1 
 
 
231 aa  129  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00776  probable metallo-beta-lactamase  35.71 
 
 
213 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2120  beta-lactamase domain protein  40.45 
 
 
231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.316298  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2954  beta-lactamase domain-containing protein  35.41 
 
 
214 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12170  beta-lactamase domain protein  36.6 
 
 
210 aa  129  4.0000000000000003e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000265397  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3054  metallo-beta-lactamase family protein  37.32 
 
 
214 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1975  metallo-beta-lactamase superfamily protein  37.5 
 
 
215 aa  129  4.0000000000000003e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0642346  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2652  beta-lactamase domain-containing protein  37.5 
 
 
215 aa  129  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0560187  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2561  metallo-beta-lactamase family protein  37.5 
 
 
215 aa  129  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000219407  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2142  metallo-beta-lactamase family protein  38.76 
 
 
214 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.84321  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0282  beta-lactamase domain-containing protein  40.39 
 
 
240 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1493  beta-lactamase domain-containing protein  38.28 
 
 
214 aa  128  6e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2186  beta-lactamase domain protein  38.54 
 
 
210 aa  128  6e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.704345 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3388  Beta-lactamase-like  36.84 
 
 
241 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1728  beta-lactamase domain-containing protein  38.28 
 
 
215 aa  128  7.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3159  hydrolase  42.23 
 
 
215 aa  128  7.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00931  predicted metal-binding enzyme  38.46 
 
 
215 aa  127  9.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  38.46 
 
 
215 aa  127  9.000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1435  beta-lactamase domain-containing protein  37.32 
 
 
214 aa  127  9.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  38.46 
 
 
215 aa  127  9.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1110  metallo-beta-lactamase family protein  33.33 
 
 
207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0167  beta-lactamase-like  41.29 
 
 
212 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1500  beta-lactamase domain-containing protein  37.32 
 
 
214 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.903392  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0267  beta-lactamase domain-containing protein  36.84 
 
 
214 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4155  beta-lactamase domain protein  36.19 
 
 
212 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000681201 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3268  hypothetical protein  37.5 
 
 
224 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1088  metallo-beta-lactamase family protein  38.46 
 
 
215 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153658  normal  0.346644 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  38.46 
 
 
215 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  38.46 
 
 
215 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2428  beta-lactamase domain-containing protein  37.32 
 
 
214 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0220  beta-lactamase domain protein  39.41 
 
 
212 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0711  beta-lactamase domain-containing protein  40.2 
 
 
217 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  38.46 
 
 
215 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0285  beta-lactamase domain-containing protein  36.84 
 
 
214 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394027  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4417  beta-lactamase domain-containing protein  38.19 
 
 
214 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.834565  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0539  beta-lactamase domain-containing protein  39.7 
 
 
205 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  41 
 
 
205 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  38.46 
 
 
215 aa  126  3e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2821  beta-lactamase-like  36.84 
 
 
237 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>