More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2396 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2396  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 237 aa  479  1e-134  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.668368  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6103  beta-lactamase-like protein  65.5 
 
 		 231 aa  293  2e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2120  beta-lactamase domain protein  61.02 
 
 		 231 aa  285  4e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.316298  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2055  beta-lactamase domain-containing protein  62.01 
 
 		 229 aa  274  7e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1818  beta-lactamase domain-containing protein  58.8 
 
 		 238 aa  265  4e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.52487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1700  beta-lactamase domain protein  58.47 
 
 		 234 aa  260  1e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153973  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1808  beta-lactamase domain-containing protein  58.8 
 
 		 238 aa  259  2e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000181534 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2364  beta-lactamase domain protein  54.58 
 
 		 231 aa  247  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1949  beta-lactamase domain protein  52.4 
 
 		 245 aa  243  9.999999999999999e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2087  hydrolase  54.98 
 
 		 224 aa  236  3e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1336  beta-lactamase domain-containing protein  50.83 
 
 		 256 aa  223  2e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.542543 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2284  beta-lactamase-like protein  50.85 
 
 		 222 aa  222  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.459653  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3045  beta-lactamase domain protein  52.34 
 
 		 238 aa  221  4.9999999999999996e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0136984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2331  beta-lactamase domain-containing protein  50.85 
 
 		 222 aa  222  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.995633  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2323  beta-lactamase domain-containing protein  50.85 
 
 		 222 aa  222  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.420202  normal  0.0208731 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3818  beta-lactamase domain-containing protein  49.78 
 
 		 231 aa  217  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.419873  normal  0.0855026 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2310  beta-lactamase domain protein  49.79 
 
 		 246 aa  216  2.9999999999999998e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.1865  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15170  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  55.9 
 
 		 226 aa  215  4e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.112325 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3167  beta-lactamase domain protein  51.09 
 
 		 231 aa  215  4e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0163096  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3091  hydrolase  52.16 
 
 		 225 aa  212  3.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12601  glyoxalase II (hydroxyacylglutathione hydrolase)  46.58 
 
 		 246 aa  206  3e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0111807  normal  0.957918 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2589  beta-lactamase domain-containing protein  48.28 
 
 		 225 aa  206  3e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0687061  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3810  beta-lactamase domain-containing protein  47.86 
 
 		 225 aa  205  5e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15250  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  48.07 
 
 		 232 aa  204  1e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00905017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3357  beta-lactamase domain protein  45.85 
 
 		 233 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0111217  normal  0.160448 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  39.74 
 
 		 211 aa  154  1e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  34.93 
 
 		 205 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0549  beta-lactamase domain-containing protein  34.84 
 
 		 216 aa  139  3e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141512  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1082  beta-lactamase domain protein  40.79 
 
 		 222 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  33.19 
 
 		 206 aa  137  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  33.19 
 
 		 210 aa  137  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  37.28 
 
 		 205 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  34.93 
 
 		 205 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  36.61 
 
 		 201 aa  136  4e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2375  beta-lactamase domain protein  37.05 
 
 		 210 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1902  metallo-beta-lactamase family protein  34.06 
 
 		 206 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  32.17 
 
 		 207 aa  134  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4114  beta-lactamase domain-containing protein  35.43 
 
 		 209 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2191  metallo-beta-lactamase family protein  33.62 
 
 		 206 aa  132  3.9999999999999996e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  35.81 
 
 		 209 aa  132  5e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4341  metallo-beta-lactamase family protein  35.27 
 
 		 209 aa  131  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4394  metallo-beta-lactamase family protein  35.27 
 
 		 209 aa  131  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4375  metallo-beta-lactamase family protein  35.27 
 
 		 209 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4281  metallo-beta-lactamase family protein  35.27 
 
 		 209 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4003  metallo-beta-lactamase family protein  35.27 
 
 		 209 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4013  metallo-beta-lactamase family protein  35.27 
 
 		 209 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.098472  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  37.56 
 
 		 213 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3707  beta-lactamase domain-containing protein  35.71 
 
 		 209 aa  130  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0859  metallo-beta-lactamase family protein  34.82 
 
 		 209 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  35.37 
 
 		 209 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  35.22 
 
 		 213 aa  129  4.0000000000000003e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2989  beta-lactamase domain-containing protein  34.98 
 
 		 209 aa  128  7.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.86043  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  34.93 
 
 		 215 aa  128  9.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  34.5 
 
 		 207 aa  128  9.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1805  beta-lactamase domain protein  38.12 
 
 		 238 aa  126  3e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0524123  normal  0.122686 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4163  metallo-beta-lactamase family protein  33.93 
 
 		 208 aa  126  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00575624  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4485  metallo-beta-lactamase family protein  33.93 
 
 		 208 aa  126  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.859552  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  34.78 
 
 		 214 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0418  beta-lactamase domain protein  35.32 
 
 		 212 aa  125  5e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0198  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 210 aa  125  7e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  32.75 
 
 		 212 aa  124  1e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0786  metallo-beta-lactamase family protein  35.62 
 
 		 208 aa  121  8e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0221878  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  35.37 
 
 		 208 aa  121  9e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0830  metallo-beta-lactamase family protein  35.24 
 
 		 198 aa  120  9.999999999999999e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0389556  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3014  beta-lactamase domain protein  37.55 
 
 		 213 aa  120  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.309827  normal  0.0865031 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  35.81 
 
 		 209 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0571  beta-lactamase domain protein  34.48 
 
 		 221 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.695514  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1201  metallo-beta-lactamase family protein  34.36 
 
 		 198 aa  119  4.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  33.48 
 
 		 207 aa  119  4.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1949  beta-lactamase domain protein  34.68 
 
 		 198 aa  118  7e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.857141  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2508  beta-lactamase domain protein  36.64 
 
 		 214 aa  118  7e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.523411 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0899  conserved hypothetical protein, putative hydrolase (metallo-beta-lactamase family)  33.48 
 
 		 199 aa  117  9.999999999999999e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.585968  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  31.28 
 
 		 209 aa  117  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  35.81 
 
 		 209 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0900  metallo-beta-lactamase family protein  34.21 
 
 		 198 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3479  Beta-lactamase-like  34.23 
 
 		 218 aa  116  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3563  beta-lactamase domain protein  34.23 
 
 		 218 aa  115  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2261  beta-lactamase-like protein  34.96 
 
 		 219 aa  116  3.9999999999999997e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  31.3 
 
 		 210 aa  115  5e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5335  beta-lactamase domain-containing protein  35.09 
 
 		 213 aa  115  6e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.311932  normal  0.0822687 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1467  metallo-beta-lactamase family protein  34.05 
 
 		 218 aa  114  8.999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0785  metallo-beta-lactamase family protein  33.62 
 
 		 205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.721139  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7673  metallo-hydrolase/oxidoreductase domain-containing protein  33.77 
 
 		 222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1517  metallo-beta-lactamase family protein  34.07 
 
 		 218 aa  114  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5856  beta-lactamase domain protein  34.96 
 
 		 213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.518272  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1648  beta-lactamase domain-containing protein  33.19 
 
 		 218 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1522  Beta-lactamase-like  34.91 
 
 		 214 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4155  beta-lactamase domain protein  31.3 
 
 		 212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000681201 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2576  beta-lactamase domain-containing protein  34.91 
 
 		 214 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.835238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0451  beta-lactamase domain protein  34.38 
 
 		 213 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1975  metallo-beta-lactamase superfamily protein  32.59 
 
 		 215 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0642346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0890  glyoxylase II family protein  32.89 
 
 		 218 aa  113  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000389063  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2561  metallo-beta-lactamase family protein  32.59 
 
 		 215 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000219407  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2799  beta-lactamase domain protein  34.91 
 
 		 214 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.130329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2652  beta-lactamase domain-containing protein  32.59 
 
 		 215 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0560187  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1782  beta-lactamase domain protein  34.53 
 
 		 215 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00356762  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5067  beta-lactamase domain protein  32.03 
 
 		 212 aa  113  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.533186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1731  beta-lactamase domain protein  35.37 
 
 		 208 aa  113  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00010066  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0044  metallo-beta-lactamase superfamily protein  34.17 
 
 		 214 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3822  metallo-beta-lactamase family protein  34.17 
 
 		 214 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>