More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0899 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0899  conserved hypothetical protein, putative hydrolase (metallo-beta-lactamase family)  100 
 
 
199 aa  416  9.999999999999999e-116  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.585968  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0900  metallo-beta-lactamase family protein  66.16 
 
 
198 aa  283  1.0000000000000001e-75  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0830  metallo-beta-lactamase family protein  65.15 
 
 
198 aa  283  1.0000000000000001e-75  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0389556  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1201  metallo-beta-lactamase family protein  63.64 
 
 
198 aa  277  9e-74  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1076  metallo-beta-lactamase family protein  47.72 
 
 
196 aa  204  7e-52  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.253465  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2047  DNA polymerase III epsilon subunit  49.24 
 
 
200 aa  202  3e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0204926  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1347  beta-lactamase domain protein  48.74 
 
 
197 aa  199  1.9999999999999998e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0124  thioredoxin reductase (trxr) (general stress protein 35)(Gsp35)  48.48 
 
 
200 aa  191  5e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0850  Beta-lactamase-like  47.96 
 
 
197 aa  189  2e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1026  metallo-beta-lactamase family protein  41.2 
 
 
215 aa  159  2e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.771017  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  34.63 
 
 
211 aa  123  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3091  hydrolase  32.88 
 
 
225 aa  120  9e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513985  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2055  beta-lactamase domain-containing protein  31.78 
 
 
229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  37.07 
 
 
205 aa  119  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2396  beta-lactamase domain-containing protein  33.48 
 
 
237 aa  117  7.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.668368  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6103  beta-lactamase-like protein  33.8 
 
 
231 aa  117  9e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2989  beta-lactamase domain-containing protein  33.5 
 
 
209 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.86043  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2512  beta-lactamase domain protein  31.82 
 
 
214 aa  116  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.738891  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1700  beta-lactamase domain protein  32.09 
 
 
234 aa  116  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153973  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2120  beta-lactamase domain protein  32.87 
 
 
231 aa  116  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.316298  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  32.49 
 
 
209 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  33.68 
 
 
209 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4114  beta-lactamase domain-containing protein  33.01 
 
 
209 aa  114  7.999999999999999e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2589  beta-lactamase domain-containing protein  32.57 
 
 
225 aa  114  7.999999999999999e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0687061  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4341  metallo-beta-lactamase family protein  33.01 
 
 
209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2323  beta-lactamase domain-containing protein  32.41 
 
 
222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.420202  normal  0.0208731 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4394  metallo-beta-lactamase family protein  33.01 
 
 
209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2284  beta-lactamase-like protein  32.41 
 
 
222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.459653  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4375  metallo-beta-lactamase family protein  33.01 
 
 
209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2331  beta-lactamase domain-containing protein  32.41 
 
 
222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.995633  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1902  metallo-beta-lactamase family protein  37.81 
 
 
206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0859  metallo-beta-lactamase family protein  33.01 
 
 
209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  32.5 
 
 
201 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3810  beta-lactamase domain-containing protein  31.65 
 
 
225 aa  112  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  29.95 
 
 
208 aa  112  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2191  metallo-beta-lactamase family protein  36.82 
 
 
206 aa  112  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4003  metallo-beta-lactamase family protein  32.04 
 
 
209 aa  111  6e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0479  beta-lactamase domain protein  33.5 
 
 
212 aa  111  8.000000000000001e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4281  metallo-beta-lactamase family protein  32.04 
 
 
209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4013  metallo-beta-lactamase family protein  32.04 
 
 
209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.098472  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  34.16 
 
 
210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2087  hydrolase  30.59 
 
 
224 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4163  metallo-beta-lactamase family protein  31.22 
 
 
208 aa  108  5e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00575624  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4485  metallo-beta-lactamase family protein  31.22 
 
 
208 aa  108  5e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.859552  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12601  glyoxalase II (hydroxyacylglutathione hydrolase)  28.71 
 
 
246 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0111807  normal  0.957918 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  32.66 
 
 
205 aa  107  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1110  metallo-beta-lactamase family protein  36.14 
 
 
207 aa  107  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1949  beta-lactamase domain protein  36.13 
 
 
198 aa  107  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.857141  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1211  beta-lactamase domain protein  32.51 
 
 
211 aa  107  1e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000331215  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3818  beta-lactamase domain-containing protein  31.03 
 
 
231 aa  107  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.419873  normal  0.0855026 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  34.33 
 
 
210 aa  106  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0544  beta-lactamase domain-containing protein  32.84 
 
 
208 aa  107  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.591388  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3413  beta-lactamase domain protein  29.7 
 
 
209 aa  106  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3045  beta-lactamase domain protein  31.1 
 
 
238 aa  106  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0136984  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  34.54 
 
 
207 aa  105  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1336  beta-lactamase domain-containing protein  29.44 
 
 
256 aa  106  3e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.542543 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2310  beta-lactamase domain protein  32.16 
 
 
246 aa  106  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.1865  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3167  beta-lactamase domain protein  30.88 
 
 
231 aa  105  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0163096  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  34.15 
 
 
206 aa  105  5e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1949  beta-lactamase domain protein  29.78 
 
 
245 aa  105  6e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2375  beta-lactamase domain protein  31.71 
 
 
210 aa  104  8e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  32.34 
 
 
205 aa  103  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15250  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  30.26 
 
 
232 aa  103  1e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00905017  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0673  beta-lactamase domain-containing protein  31.09 
 
 
206 aa  103  2e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.20621  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1603  beta-lactamase domain-containing protein  34.65 
 
 
207 aa  103  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0599073  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1637  beta-lactamase domain-containing protein  34.65 
 
 
207 aa  103  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.084203  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  31.98 
 
 
251 aa  102  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2853  beta-lactamase domain protein  30.61 
 
 
210 aa  102  3e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0198  beta-lactamase domain protein  29.41 
 
 
210 aa  102  5e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2364  beta-lactamase domain protein  29.63 
 
 
231 aa  102  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15170  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  32.39 
 
 
226 aa  101  9e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.112325 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3479  Beta-lactamase-like  31.82 
 
 
218 aa  101  9e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3054  metallo-beta-lactamase family protein  32 
 
 
214 aa  99.8  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0786  metallo-beta-lactamase family protein  29.61 
 
 
208 aa  99.8  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0221878  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1732  beta-lactamase domain-containing protein  32.54 
 
 
214 aa  100  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37479  normal  0.0747191 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3357  beta-lactamase domain protein  28.44 
 
 
233 aa  100  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0111217  normal  0.160448 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  31.12 
 
 
217 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1808  beta-lactamase domain-containing protein  29.22 
 
 
238 aa  99.4  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000181534 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  32.51 
 
 
210 aa  99.4  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3563  beta-lactamase domain protein  30.3 
 
 
218 aa  98.6  5e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  33.68 
 
 
207 aa  97.8  8e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  29.44 
 
 
209 aa  97.8  9e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  32.32 
 
 
213 aa  97.1  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0635  beta-lactamase domain-containing protein  30.16 
 
 
204 aa  97.4  1e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.320984  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1975  metallo-beta-lactamase superfamily protein  32.34 
 
 
215 aa  97.4  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0642346  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  30.81 
 
 
209 aa  97.8  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1493  beta-lactamase domain-containing protein  32 
 
 
214 aa  97.8  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  30.46 
 
 
207 aa  97.1  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1635  beta-lactamase domain-containing protein  31.5 
 
 
214 aa  97.4  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.702342  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1818  beta-lactamase domain-containing protein  27.85 
 
 
238 aa  96.7  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.52487  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0068  metallo-beta-lactamase superfamily protein  30.65 
 
 
212 aa  96.3  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0554126  normal  0.354369 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2652  beta-lactamase domain-containing protein  31.84 
 
 
215 aa  96.7  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0560187  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2561  metallo-beta-lactamase family protein  31.84 
 
 
215 aa  96.7  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000219407  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2142  metallo-beta-lactamase family protein  34 
 
 
214 aa  96.7  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.84321  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2734  beta-lactamase domain-containing protein  32.5 
 
 
214 aa  97.1  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0443  beta-lactamase domain protein  32.11 
 
 
208 aa  95.9  3e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2827  beta-lactamase domain-containing protein  32.5 
 
 
214 aa  95.9  4e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0208272 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1500  beta-lactamase domain-containing protein  31.5 
 
 
214 aa  95.5  4e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.903392  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0539  Zn-dependent hydrolase, including glyoxylase  28.35 
 
 
210 aa  95.5  4e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0442594  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1625  beta-lactamase domain protein  32 
 
 
214 aa  95.1  5e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.224285  normal  0.185558 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>