More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0850 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0850  Beta-lactamase-like  100 
 
 
197 aa  415  9.999999999999999e-116  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1347  beta-lactamase domain protein  54.82 
 
 
197 aa  232  3e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2047  DNA polymerase III epsilon subunit  50 
 
 
200 aa  198  3.9999999999999996e-50  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0204926  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0899  conserved hypothetical protein, putative hydrolase (metallo-beta-lactamase family)  47.96 
 
 
199 aa  189  2e-47  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.585968  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1076  metallo-beta-lactamase family protein  45.88 
 
 
196 aa  182  2.0000000000000003e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.253465  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1201  metallo-beta-lactamase family protein  47.96 
 
 
198 aa  182  3e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0124  thioredoxin reductase (trxr) (general stress protein 35)(Gsp35)  46.39 
 
 
200 aa  180  2e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0830  metallo-beta-lactamase family protein  46.94 
 
 
198 aa  177  1e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0389556  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0900  metallo-beta-lactamase family protein  45.41 
 
 
198 aa  176  2e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1026  metallo-beta-lactamase family protein  36.15 
 
 
215 aa  141  5e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.771017  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3413  beta-lactamase domain protein  35.75 
 
 
209 aa  122  3e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  37.19 
 
 
210 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3091  hydrolase  34.68 
 
 
225 aa  114  8.999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513985  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2191  metallo-beta-lactamase family protein  35.92 
 
 
206 aa  113  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1902  metallo-beta-lactamase family protein  36.41 
 
 
206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1949  beta-lactamase domain protein  35.9 
 
 
198 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.857141  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2055  beta-lactamase domain-containing protein  32.72 
 
 
229 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2120  beta-lactamase domain protein  35.14 
 
 
231 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.316298  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2087  hydrolase  35.35 
 
 
224 aa  112  5e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6103  beta-lactamase-like protein  35.02 
 
 
231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2186  beta-lactamase domain protein  33.01 
 
 
210 aa  107  1e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.704345 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3707  beta-lactamase domain-containing protein  31.68 
 
 
209 aa  106  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107683  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  32.99 
 
 
201 aa  105  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  31.88 
 
 
205 aa  104  6e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  34.33 
 
 
206 aa  105  6e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  32.16 
 
 
212 aa  104  9e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  33.17 
 
 
211 aa  104  9e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2853  beta-lactamase domain protein  32.85 
 
 
210 aa  104  9e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2396  beta-lactamase domain-containing protein  31.9 
 
 
237 aa  103  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.668368  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1949  beta-lactamase domain protein  31.88 
 
 
245 aa  102  3e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  32 
 
 
208 aa  102  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3004  beta-lactamase domain-containing protein  34.78 
 
 
204 aa  101  7e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.985459  normal  0.107301 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2640  beta-lactamase domain protein  33 
 
 
206 aa  101  8e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0068  metallo-beta-lactamase superfamily protein  32.67 
 
 
212 aa  101  9e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0554126  normal  0.354369 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1336  beta-lactamase domain-containing protein  31.14 
 
 
256 aa  101  9e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.542543 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12601  glyoxalase II (hydroxyacylglutathione hydrolase)  29.77 
 
 
246 aa  100  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0111807  normal  0.957918 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1700  beta-lactamase domain protein  34.15 
 
 
234 aa  99.4  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153973  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  33.66 
 
 
215 aa  99.4  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15170  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  34.98 
 
 
226 aa  99  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.112325 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  33.5 
 
 
205 aa  98.2  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  32.04 
 
 
207 aa  98.2  8e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  32.84 
 
 
210 aa  97.4  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1808  beta-lactamase domain-containing protein  29.91 
 
 
238 aa  97.4  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000181534 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  31.71 
 
 
209 aa  96.7  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00776  probable metallo-beta-lactamase  33.65 
 
 
213 aa  97.1  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3171  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 
211 aa  95.9  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.343145 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3167  beta-lactamase domain protein  32.11 
 
 
231 aa  95.5  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0163096  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2989  beta-lactamase domain-containing protein  32.68 
 
 
209 aa  95.1  5e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.86043  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0372  beta-lactamase domain-containing protein  30.61 
 
 
203 aa  95.1  6e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00504714  hitchhiker  0.000000000307388 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1818  beta-lactamase domain-containing protein  29.91 
 
 
238 aa  94.7  7e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.52487  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  29.35 
 
 
213 aa  94.7  7e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2310  beta-lactamase domain protein  32.13 
 
 
246 aa  94.7  8e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.1865  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2576  beta-lactamase domain-containing protein  32.06 
 
 
214 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.835238  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0786  metallo-beta-lactamase family protein  30.73 
 
 
208 aa  94.4  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0221878  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0479  beta-lactamase domain protein  29.27 
 
 
212 aa  93.6  1e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2799  beta-lactamase domain protein  32.06 
 
 
214 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.130329  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2391  metallo-beta-lactamase family protein  28.64 
 
 
215 aa  93.2  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  28.64 
 
 
215 aa  93.2  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  28.64 
 
 
215 aa  93.2  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1062  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.11 
 
 
215 aa  93.2  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1095  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.11 
 
 
215 aa  93.2  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1112  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.11 
 
 
215 aa  93.2  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347617  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  28.64 
 
 
215 aa  93.2  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1030  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.11 
 
 
215 aa  93.2  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  hitchhiker  0.00661846 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  29.11 
 
 
215 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2508  beta-lactamase domain protein  31.73 
 
 
214 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.523411 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1003  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.11 
 
 
215 aa  93.2  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105674  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0912  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 
200 aa  92.8  3e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.330922  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1088  metallo-beta-lactamase family protein  28.64 
 
 
215 aa  92.4  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153658  normal  0.346644 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2261  beta-lactamase-like protein  30.05 
 
 
219 aa  92.4  4e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1339  beta-lactamase-like protein  27.32 
 
 
192 aa  92.4  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  31.5 
 
 
213 aa  91.7  6e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0549  beta-lactamase domain-containing protein  31.68 
 
 
216 aa  91.7  6e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141512  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1805  beta-lactamase domain protein  29.78 
 
 
238 aa  91.3  8e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0524123  normal  0.122686 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00931  predicted metal-binding enzyme  28.17 
 
 
215 aa  91.3  9e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  28.17 
 
 
215 aa  91.3  9e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  30.77 
 
 
209 aa  91.3  9e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  28.17 
 
 
215 aa  91.3  9e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0872  beta-lactamase domain protein  32.34 
 
 
209 aa  90.5  1e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.172924  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1211  beta-lactamase domain protein  30.05 
 
 
211 aa  90.9  1e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000331215  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1074  glyoxalase II family protein  32.86 
 
 
210 aa  90.9  1e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.905224  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3818  beta-lactamase domain-containing protein  31.34 
 
 
231 aa  90.5  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.419873  normal  0.0855026 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0544  beta-lactamase domain-containing protein  33.5 
 
 
208 aa  90.9  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.591388  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1975  metallo-beta-lactamase superfamily protein  28.5 
 
 
215 aa  90.9  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0642346  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2652  beta-lactamase domain-containing protein  28.02 
 
 
215 aa  90.1  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0560187  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  31.75 
 
 
207 aa  90.5  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2561  metallo-beta-lactamase family protein  28.02 
 
 
215 aa  90.1  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000219407  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2512  beta-lactamase domain protein  28.99 
 
 
214 aa  89.7  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.738891  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0834  beta-lactamase domain-containing protein  30.43 
 
 
205 aa  89  4e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4341  metallo-beta-lactamase family protein  31.68 
 
 
209 aa  89  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4394  metallo-beta-lactamase family protein  31.68 
 
 
209 aa  89  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1732  beta-lactamase domain-containing protein  31.58 
 
 
214 aa  88.6  5e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37479  normal  0.0747191 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0443  beta-lactamase domain protein  31.84 
 
 
208 aa  88.6  6e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2375  beta-lactamase domain protein  31.37 
 
 
210 aa  88.6  6e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3357  beta-lactamase domain protein  29.58 
 
 
233 aa  88.2  7e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0111217  normal  0.160448 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4375  metallo-beta-lactamase family protein  31.68 
 
 
209 aa  88.2  7e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4003  metallo-beta-lactamase family protein  31.19 
 
 
209 aa  88.2  8e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0859  metallo-beta-lactamase family protein  31.68 
 
 
209 aa  87.8  9e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0317  beta-lactamase domain-containing protein  28.85 
 
 
214 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.605621  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1635  beta-lactamase domain-containing protein  28.77 
 
 
214 aa  87  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.702342  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>