More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2055 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2055  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
229 aa  456  1e-127  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6103  beta-lactamase-like protein  78.79 
 
 
231 aa  361  6e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2120  beta-lactamase domain protein  71 
 
 
231 aa  336  1.9999999999999998e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.316298  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2364  beta-lactamase domain protein  66.38 
 
 
231 aa  297  9e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1808  beta-lactamase domain-containing protein  66.11 
 
 
238 aa  288  4e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000181534 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1818  beta-lactamase domain-containing protein  64.85 
 
 
238 aa  284  7e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.52487  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1700  beta-lactamase domain protein  63.83 
 
 
234 aa  278  6e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153973  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2396  beta-lactamase domain-containing protein  62.01 
 
 
237 aa  274  7e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.668368  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2087  hydrolase  61.71 
 
 
224 aa  267  1e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3818  beta-lactamase domain-containing protein  61.37 
 
 
231 aa  263  1e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.419873  normal  0.0855026 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1336  beta-lactamase domain-containing protein  55.69 
 
 
256 aa  246  3e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.542543 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1949  beta-lactamase domain protein  52.54 
 
 
245 aa  239  4e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3091  hydrolase  56.25 
 
 
225 aa  236  2e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513985  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3045  beta-lactamase domain protein  56.9 
 
 
238 aa  231  7.000000000000001e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0136984  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3167  beta-lactamase domain protein  55.41 
 
 
231 aa  229  2e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0163096  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2310  beta-lactamase domain protein  52.81 
 
 
246 aa  225  4e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.1865  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3357  beta-lactamase domain protein  52.49 
 
 
233 aa  221  9.999999999999999e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0111217  normal  0.160448 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2284  beta-lactamase-like protein  56.16 
 
 
222 aa  218  6e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.459653  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2323  beta-lactamase domain-containing protein  56.16 
 
 
222 aa  218  6e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.420202  normal  0.0208731 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2331  beta-lactamase domain-containing protein  56.16 
 
 
222 aa  218  6e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.995633  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15170  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  60.55 
 
 
226 aa  218  7.999999999999999e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.112325 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12601  glyoxalase II (hydroxyacylglutathione hydrolase)  51.14 
 
 
246 aa  207  1e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0111807  normal  0.957918 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15250  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  52.38 
 
 
232 aa  207  1e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00905017  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3810  beta-lactamase domain-containing protein  50.43 
 
 
225 aa  205  6e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2589  beta-lactamase domain-containing protein  48.68 
 
 
225 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0687061  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  41.28 
 
 
205 aa  159  3e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  40.55 
 
 
205 aa  155  4e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  42.92 
 
 
211 aa  150  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0198  beta-lactamase domain protein  40.83 
 
 
210 aa  148  5e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  39.81 
 
 
212 aa  147  9e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4003  metallo-beta-lactamase family protein  39.91 
 
 
209 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4013  metallo-beta-lactamase family protein  39.91 
 
 
209 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.098472  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  40.45 
 
 
214 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1902  metallo-beta-lactamase family protein  38.53 
 
 
206 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  37.61 
 
 
207 aa  147  2.0000000000000003e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4281  metallo-beta-lactamase family protein  39.91 
 
 
209 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  42.38 
 
 
205 aa  146  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4375  metallo-beta-lactamase family protein  39.44 
 
 
209 aa  146  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0859  metallo-beta-lactamase family protein  39.44 
 
 
209 aa  146  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2191  metallo-beta-lactamase family protein  38.07 
 
 
206 aa  145  6e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4341  metallo-beta-lactamase family protein  38.97 
 
 
209 aa  144  9e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  37.16 
 
 
206 aa  144  9e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4394  metallo-beta-lactamase family protein  38.97 
 
 
209 aa  144  9e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3014  beta-lactamase domain protein  42.47 
 
 
213 aa  144  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.309827  normal  0.0865031 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2375  beta-lactamase domain protein  40.38 
 
 
210 aa  144  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2989  beta-lactamase domain-containing protein  41.12 
 
 
209 aa  144  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.86043  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4114  beta-lactamase domain-containing protein  38.97 
 
 
209 aa  143  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4163  metallo-beta-lactamase family protein  39.91 
 
 
208 aa  141  6e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00575624  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4485  metallo-beta-lactamase family protein  39.91 
 
 
208 aa  141  6e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.859552  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2261  beta-lactamase-like protein  43.26 
 
 
219 aa  141  7e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3707  beta-lactamase domain-containing protein  40.47 
 
 
209 aa  140  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107683  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  37.61 
 
 
209 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1082  beta-lactamase domain protein  43.6 
 
 
222 aa  139  4.999999999999999e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  35.29 
 
 
210 aa  137  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  42.38 
 
 
213 aa  135  4e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  39.81 
 
 
201 aa  135  5e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  38.81 
 
 
209 aa  135  5e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  37.9 
 
 
209 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  38.91 
 
 
215 aa  135  6.0000000000000005e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0479  beta-lactamase domain protein  37.67 
 
 
212 aa  133  3e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0549  beta-lactamase domain-containing protein  35.71 
 
 
216 aa  131  6.999999999999999e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141512  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1731  beta-lactamase domain protein  38.6 
 
 
208 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00010066  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0900  metallo-beta-lactamase family protein  33.95 
 
 
198 aa  129  4.0000000000000003e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3004  beta-lactamase domain-containing protein  40.28 
 
 
204 aa  128  7.000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.985459  normal  0.107301 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  36.57 
 
 
210 aa  128  7.000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  38.36 
 
 
210 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1975  metallo-beta-lactamase superfamily protein  35.51 
 
 
215 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0642346  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2652  beta-lactamase domain-containing protein  35.51 
 
 
215 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0560187  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2561  metallo-beta-lactamase family protein  35.51 
 
 
215 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000219407  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0418  beta-lactamase domain protein  38.01 
 
 
212 aa  126  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2508  beta-lactamase domain protein  38.89 
 
 
214 aa  126  3e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.523411 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  40.28 
 
 
217 aa  125  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3014  beta-lactamase domain protein  34.84 
 
 
213 aa  125  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0841  Beta-lactamase-like  39.27 
 
 
213 aa  125  5e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0225813 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0890  glyoxylase II family protein  37.56 
 
 
218 aa  125  5e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000389063  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1728  beta-lactamase domain-containing protein  35.81 
 
 
215 aa  125  7e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2576  beta-lactamase domain-containing protein  37.96 
 
 
214 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.835238  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2799  beta-lactamase domain protein  37.96 
 
 
214 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.130329  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  37.91 
 
 
213 aa  124  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0786  metallo-beta-lactamase family protein  38.01 
 
 
208 aa  124  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0221878  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  37.17 
 
 
207 aa  124  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003129  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.65 
 
 
216 aa  124  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000730462  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0213  beta-lactamase domain-containing protein  38.12 
 
 
214 aa  123  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.325973 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1805  beta-lactamase domain protein  39.91 
 
 
238 aa  124  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0524123  normal  0.122686 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0443  beta-lactamase domain protein  32.87 
 
 
208 aa  123  2e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0199  beta-lactamase domain-containing protein  38.12 
 
 
214 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604325  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1201  metallo-beta-lactamase family protein  33.18 
 
 
198 aa  122  3e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5067  beta-lactamase domain protein  36.07 
 
 
212 aa  123  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.533186  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0830  metallo-beta-lactamase family protein  33.64 
 
 
198 aa  123  3e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0389556  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0194  beta-lactamase domain-containing protein  37.22 
 
 
214 aa  122  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113604  hitchhiker  0.00000000306881 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2054  beta-lactamase domain protein  35.68 
 
 
215 aa  122  4e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.128768  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2512  beta-lactamase domain protein  38.2 
 
 
214 aa  122  4e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.738891  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0243  beta-lactamase domain protein  39.82 
 
 
215 aa  122  5e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00931  predicted metal-binding enzyme  35.32 
 
 
215 aa  122  7e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  35.32 
 
 
215 aa  122  7e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3171  beta-lactamase domain protein  37.9 
 
 
211 aa  122  7e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.343145 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  35.32 
 
 
215 aa  122  7e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  35.48 
 
 
208 aa  121  8e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02708  hypothetical protein  34.84 
 
 
218 aa  121  8e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0215  beta-lactamase domain-containing protein  34.08 
 
 
215 aa  121  8e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.755925 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>