More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3045 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3045  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 238 aa  460  1e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0136984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3818  beta-lactamase domain-containing protein  57.85 
 
 		 231 aa  250  1e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.419873  normal  0.0855026 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1818  beta-lactamase domain-containing protein  60.7 
 
 		 238 aa  249  2e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.52487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1808  beta-lactamase domain-containing protein  61.47 
 
 		 238 aa  246  2e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000181534 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15250  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  58.8 
 
 		 232 aa  242  5e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00905017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6103  beta-lactamase-like protein  57.14 
 
 		 231 aa  241  9e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2055  beta-lactamase domain-containing protein  56.9 
 
 		 229 aa  231  7.000000000000001e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2120  beta-lactamase domain protein  54.15 
 
 		 231 aa  229  4e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.316298  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2396  beta-lactamase domain-containing protein  52.34 
 
 		 237 aa  221  4.9999999999999996e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.668368  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2087  hydrolase  55.11 
 
 		 224 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1700  beta-lactamase domain protein  57.14 
 
 		 234 aa  220  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153973  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3091  hydrolase  51.56 
 
 		 225 aa  218  6e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3167  beta-lactamase domain protein  53.19 
 
 		 231 aa  217  1e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0163096  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2310  beta-lactamase domain protein  49.17 
 
 		 246 aa  214  9.999999999999999e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.1865  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2364  beta-lactamase domain protein  51.3 
 
 		 231 aa  211  5.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1949  beta-lactamase domain protein  48.73 
 
 		 245 aa  211  5.999999999999999e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1336  beta-lactamase domain-containing protein  50.79 
 
 		 256 aa  207  1e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.542543 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3810  beta-lactamase domain-containing protein  46.88 
 
 		 225 aa  193  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2323  beta-lactamase domain-containing protein  48.44 
 
 		 222 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.420202  normal  0.0208731 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2284  beta-lactamase-like protein  48.44 
 
 		 222 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.459653  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2331  beta-lactamase domain-containing protein  48.44 
 
 		 222 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.995633  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12601  glyoxalase II (hydroxyacylglutathione hydrolase)  45.37 
 
 		 246 aa  181  6e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0111807  normal  0.957918 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2589  beta-lactamase domain-containing protein  45.09 
 
 		 225 aa  177  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0687061  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15170  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  51.82 
 
 		 226 aa  171  6.999999999999999e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.112325 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3357  beta-lactamase domain protein  44.34 
 
 		 233 aa  171  1e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0111217  normal  0.160448 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1805  beta-lactamase domain protein  46.19 
 
 		 238 aa  155  4e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0524123  normal  0.122686 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1679  beta-lactamase domain protein  45 
 
 		 265 aa  144  1e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.132867  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  35 
 
 		 205 aa  138  7.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1082  beta-lactamase domain protein  42.92 
 
 		 222 aa  137  2e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  34.68 
 
 		 209 aa  136  4e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  38.91 
 
 		 209 aa  135  5e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  38.71 
 
 		 213 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  40.87 
 
 		 211 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  34.55 
 
 		 205 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  39.01 
 
 		 213 aa  134  9.999999999999999e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2508  beta-lactamase domain protein  41.01 
 
 		 214 aa  132  5e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.523411 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  37.61 
 
 		 214 aa  132  6e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  36.94 
 
 		 209 aa  131  9e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  37.73 
 
 		 207 aa  131  9e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  35 
 
 		 210 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  33.78 
 
 		 209 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  36 
 
 		 208 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0198  beta-lactamase domain protein  37.44 
 
 		 210 aa  128  8.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4341  metallo-beta-lactamase family protein  34.93 
 
 		 209 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  34.88 
 
 		 201 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4394  metallo-beta-lactamase family protein  34.93 
 
 		 209 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2576  beta-lactamase domain-containing protein  38.71 
 
 		 214 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.835238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2799  beta-lactamase domain protein  38.71 
 
 		 214 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.130329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2191  metallo-beta-lactamase family protein  32.58 
 
 		 206 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4114  beta-lactamase domain-containing protein  34.93 
 
 		 209 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  33.78 
 
 		 251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1902  metallo-beta-lactamase family protein  32.58 
 
 		 206 aa  126  3e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0859  metallo-beta-lactamase family protein  34.45 
 
 		 209 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5335  beta-lactamase domain-containing protein  40.55 
 
 		 213 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.311932  normal  0.0822687 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4375  metallo-beta-lactamase family protein  34.45 
 
 		 209 aa  125  5e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  36.32 
 
 		 215 aa  125  6e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0317  beta-lactamase domain-containing protein  38.71 
 
 		 214 aa  125  7e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.605621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  31.22 
 
 		 207 aa  125  7e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5856  beta-lactamase domain protein  41.94 
 
 		 213 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.518272  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4003  metallo-beta-lactamase family protein  34.45 
 
 		 209 aa  124  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  35 
 
 		 205 aa  124  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2989  beta-lactamase domain-containing protein  33.97 
 
 		 209 aa  124  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.86043  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4281  metallo-beta-lactamase family protein  34.45 
 
 		 209 aa  123  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1517  metallo-beta-lactamase family protein  38.6 
 
 		 218 aa  124  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4013  metallo-beta-lactamase family protein  34.45 
 
 		 209 aa  123  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.098472  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2142  metallo-beta-lactamase family protein  35.94 
 
 		 214 aa  124  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.84321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1467  metallo-beta-lactamase family protein  38.6 
 
 		 218 aa  123  3e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  33.18 
 
 		 209 aa  122  5e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0228  beta-lactamase domain-containing protein  36.04 
 
 		 212 aa  122  5e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0213  beta-lactamase domain-containing protein  36.28 
 
 		 214 aa  122  7e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.325973 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0549  beta-lactamase domain-containing protein  33.48 
 
 		 216 aa  121  8e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141512  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  31.78 
 
 		 210 aa  121  8e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0890  glyoxylase II family protein  37.12 
 
 		 218 aa  121  9.999999999999999e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000389063  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3563  beta-lactamase domain protein  40.09 
 
 		 218 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3479  Beta-lactamase-like  39.62 
 
 		 218 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1728  beta-lactamase domain-containing protein  35 
 
 		 215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0199  beta-lactamase domain-containing protein  36.62 
 
 		 214 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604325  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0285  beta-lactamase domain-containing protein  34.88 
 
 		 214 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394027  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  35.14 
 
 		 210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1648  beta-lactamase domain-containing protein  36.99 
 
 		 218 aa  119  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4163  metallo-beta-lactamase family protein  33.97 
 
 		 208 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00575624  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4485  metallo-beta-lactamase family protein  33.97 
 
 		 208 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.859552  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2821  beta-lactamase-like  34.88 
 
 		 237 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3388  Beta-lactamase-like  35.21 
 
 		 241 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0282  beta-lactamase domain-containing protein  35.96 
 
 		 240 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  31.22 
 
 		 206 aa  119  4.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0267  beta-lactamase domain-containing protein  34.42 
 
 		 214 aa  118  7e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3014  beta-lactamase domain protein  33.93 
 
 		 213 aa  118  7e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  35.27 
 
 		 212 aa  118  7.999999999999999e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2561  metallo-beta-lactamase family protein  34.38 
 
 		 215 aa  118  9e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000219407  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2652  beta-lactamase domain-containing protein  34.38 
 
 		 215 aa  118  9e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0560187  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1975  metallo-beta-lactamase superfamily protein  34.38 
 
 		 215 aa  118  9e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0642346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0334  beta-lactamase domain-containing protein  33.18 
 
 		 212 aa  117  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3707  beta-lactamase domain-containing protein  35.71 
 
 		 209 aa  117  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107683  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2375  beta-lactamase domain protein  36.06 
 
 		 210 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2240  beta-lactamase domain-containing protein  36.94 
 
 		 213 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  33.64 
 
 		 207 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00776  probable metallo-beta-lactamase  32.59 
 
 		 213 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1077  beta-lactamase domain protein  40.09 
 
 		 226 aa  116  3e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3159  hydrolase  38.07 
 
 		 215 aa  116  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>