More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3357 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3357  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 233 aa  460  1e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0111217  normal  0.160448 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2120  beta-lactamase domain protein  52.21 
 
 		 231 aa  224  8e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.316298  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2055  beta-lactamase domain-containing protein  52.49 
 
 		 229 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6103  beta-lactamase-like protein  51.57 
 
 		 231 aa  218  5e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2087  hydrolase  52.94 
 
 		 224 aa  218  6e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1700  beta-lactamase domain protein  51.13 
 
 		 234 aa  216  2.9999999999999998e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153973  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1818  beta-lactamase domain-containing protein  52.61 
 
 		 238 aa  214  5.9999999999999996e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.52487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1808  beta-lactamase domain-containing protein  52.65 
 
 		 238 aa  214  9.999999999999999e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000181534 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2364  beta-lactamase domain protein  50.22 
 
 		 231 aa  213  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15170  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  54.79 
 
 		 226 aa  210  1e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.112325 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2284  beta-lactamase-like protein  50.9 
 
 		 222 aa  206  2e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.459653  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2331  beta-lactamase domain-containing protein  50.9 
 
 		 222 aa  206  2e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.995633  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2323  beta-lactamase domain-containing protein  50.9 
 
 		 222 aa  206  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.420202  normal  0.0208731 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1949  beta-lactamase domain protein  51.48 
 
 		 245 aa  206  3e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2310  beta-lactamase domain protein  50.86 
 
 		 246 aa  204  9e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.1865  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12601  glyoxalase II (hydroxyacylglutathione hydrolase)  47.75 
 
 		 246 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0111807  normal  0.957918 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2396  beta-lactamase domain-containing protein  45.85 
 
 		 237 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.668368  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3818  beta-lactamase domain-containing protein  48.4 
 
 		 231 aa  194  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.419873  normal  0.0855026 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3167  beta-lactamase domain protein  47.14 
 
 		 231 aa  191  9e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0163096  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3810  beta-lactamase domain-containing protein  45.95 
 
 		 225 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2589  beta-lactamase domain-containing protein  45.95 
 
 		 225 aa  183  3e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0687061  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3091  hydrolase  45.29 
 
 		 225 aa  181  7e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1336  beta-lactamase domain-containing protein  44.77 
 
 		 256 aa  180  2e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.542543 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3045  beta-lactamase domain protein  44.34 
 
 		 238 aa  171  1e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0136984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15250  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  43.04 
 
 		 232 aa  157  2e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00905017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0198  beta-lactamase domain protein  42.47 
 
 		 210 aa  149  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2375  beta-lactamase domain protein  40 
 
 		 210 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1902  metallo-beta-lactamase family protein  37.27 
 
 		 206 aa  145  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  36.99 
 
 		 205 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2191  metallo-beta-lactamase family protein  36.36 
 
 		 206 aa  143  3e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  36.99 
 
 		 205 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  35.45 
 
 		 212 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  39.64 
 
 		 211 aa  139  3e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  36.94 
 
 		 207 aa  135  4e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  36.07 
 
 		 206 aa  134  9e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  37.44 
 
 		 214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3707  beta-lactamase domain-containing protein  41.74 
 
 		 209 aa  134  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107683  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4003  metallo-beta-lactamase family protein  35.45 
 
 		 209 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4013  metallo-beta-lactamase family protein  35.45 
 
 		 209 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.098472  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4281  metallo-beta-lactamase family protein  35.45 
 
 		 209 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2989  beta-lactamase domain-containing protein  37.23 
 
 		 209 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.86043  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4163  metallo-beta-lactamase family protein  34.22 
 
 		 208 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00575624  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4485  metallo-beta-lactamase family protein  34.22 
 
 		 208 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.859552  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4341  metallo-beta-lactamase family protein  35 
 
 		 209 aa  128  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4394  metallo-beta-lactamase family protein  35 
 
 		 209 aa  128  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2512  beta-lactamase domain protein  39.01 
 
 		 214 aa  128  9.000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.738891  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3016  beta-lactamase domain protein  40 
 
 		 219 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0859  metallo-beta-lactamase family protein  35 
 
 		 209 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4375  metallo-beta-lactamase family protein  35 
 
 		 209 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0228  beta-lactamase domain-containing protein  41.1 
 
 		 212 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4114  beta-lactamase domain-containing protein  34.09 
 
 		 209 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1805  beta-lactamase domain protein  40.43 
 
 		 238 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0524123  normal  0.122686 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2261  beta-lactamase-like protein  39.63 
 
 		 219 aa  125  5e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3014  beta-lactamase domain protein  33.78 
 
 		 213 aa  124  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  37 
 
 		 213 aa  124  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1082  beta-lactamase domain protein  40.09 
 
 		 222 aa  123  2e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0220  beta-lactamase domain protein  39.45 
 
 		 212 aa  123  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0044  metallo-beta-lactamase superfamily protein  38.46 
 
 		 214 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0374  beta-lactamase-like  36.53 
 
 		 222 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.834872 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2753  beta-lactamase domain protein  38.67 
 
 		 217 aa  123  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.254037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3822  metallo-beta-lactamase family protein  38.46 
 
 		 214 aa  123  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  37.16 
 
 		 210 aa  122  3e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2969  metallo-beta-lactamase family protein  37.22 
 
 		 214 aa  122  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3903  metallo-beta-lactamase family protein  37.22 
 
 		 214 aa  122  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2909  metallo-beta-lactamase family protein  37.22 
 
 		 214 aa  122  4e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.457315  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3268  Beta-lactamase-like  38.01 
 
 		 216 aa  122  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1632  metallo-beta-lactamase family protein  37.22 
 
 		 214 aa  122  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3400  metallo-beta-lactamase family protein  37.22 
 
 		 214 aa  122  4e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00696268  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0715  Beta-lactamase-like  35.94 
 
 		 222 aa  122  6e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0194  beta-lactamase domain-containing protein  37.05 
 
 		 214 aa  122  6e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113604  hitchhiker  0.00000000306881 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  32.13 
 
 		 210 aa  121  7e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  37.5 
 
 		 215 aa  121  9e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3119  beta-lactamase domain-containing protein  36.07 
 
 		 216 aa  120  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.603346  normal  0.30493 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3159  hydrolase  37.38 
 
 		 215 aa  120  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0233  beta-lactamase-like  36.24 
 
 		 230 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0285  beta-lactamase domain-containing protein  36.16 
 
 		 214 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394027  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0267  beta-lactamase domain-containing protein  36.16 
 
 		 214 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2821  beta-lactamase-like  36.16 
 
 		 237 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0282  beta-lactamase domain-containing protein  39.55 
 
 		 240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3388  Beta-lactamase-like  36.16 
 
 		 241 aa  119  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3151  metallo-beta-lactamase family protein  37.56 
 
 		 214 aa  120  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2240  beta-lactamase domain-containing protein  39.11 
 
 		 213 aa  119  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0317  beta-lactamase domain-containing protein  35.32 
 
 		 214 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.605621  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00931  predicted metal-binding enzyme  34.1 
 
 		 215 aa  118  7e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  34.1 
 
 		 215 aa  118  7e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53510  hypothetical protein  35.51 
 
 		 213 aa  118  7e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000645977 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  34.1 
 
 		 215 aa  118  7e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0213  beta-lactamase domain-containing protein  35.71 
 
 		 214 aa  118  7e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.325973 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1467  metallo-beta-lactamase family protein  37.5 
 
 		 218 aa  118  9e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4688  hypothetical protein  34.7 
 
 		 207 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42598  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1517  metallo-beta-lactamase family protein  37.5 
 
 		 218 aa  117  9.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0113  beta-lactamase-like  37.44 
 
 		 224 aa  117  9.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.110968 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1728  beta-lactamase domain-containing protein  34.26 
 
 		 215 aa  117  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2391  metallo-beta-lactamase family protein  33.8 
 
 		 215 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  34.1 
 
 		 215 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  33.79 
 
 		 209 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  34.39 
 
 		 209 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7673  metallo-hydrolase/oxidoreductase domain-containing protein  35.19 
 
 		 222 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  34.1 
 
 		 215 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  34.56 
 
 		 215 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>