More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_15170 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_15170  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  100 
 
 		 226 aa  438  9.999999999999999e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.112325 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1700  beta-lactamase domain protein  62.21 
 
 		 234 aa  248  7e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153973  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2120  beta-lactamase domain protein  60.27 
 
 		 231 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.316298  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2055  beta-lactamase domain-containing protein  60.55 
 
 		 229 aa  239  2e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2396  beta-lactamase domain-containing protein  55.9 
 
 		 237 aa  234  8e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.668368  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6103  beta-lactamase-like protein  58.18 
 
 		 231 aa  230  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3357  beta-lactamase domain protein  54.79 
 
 		 233 aa  228  8e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0111217  normal  0.160448 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2284  beta-lactamase-like protein  55.5 
 
 		 222 aa  227  9e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.459653  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2323  beta-lactamase domain-containing protein  55.5 
 
 		 222 aa  227  9e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.420202  normal  0.0208731 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2331  beta-lactamase domain-containing protein  55.5 
 
 		 222 aa  227  9e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.995633  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2087  hydrolase  58.37 
 
 		 224 aa  226  2e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1808  beta-lactamase domain-containing protein  57.47 
 
 		 238 aa  226  3e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000181534 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2364  beta-lactamase domain protein  56.42 
 
 		 231 aa  226  3e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1818  beta-lactamase domain-containing protein  56.11 
 
 		 238 aa  223  2e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.52487  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1949  beta-lactamase domain protein  52.42 
 
 		 245 aa  212  3.9999999999999995e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3818  beta-lactamase domain-containing protein  52.65 
 
 		 231 aa  211  5.999999999999999e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.419873  normal  0.0855026 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12601  glyoxalase II (hydroxyacylglutathione hydrolase)  51.6 
 
 		 246 aa  209  3e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0111807  normal  0.957918 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3810  beta-lactamase domain-containing protein  52.04 
 
 		 225 aa  208  6e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1336  beta-lactamase domain-containing protein  51.26 
 
 		 256 aa  204  1e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.542543 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2310  beta-lactamase domain protein  48.54 
 
 		 246 aa  202  3e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.1865  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3167  beta-lactamase domain protein  51.6 
 
 		 231 aa  198  5e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0163096  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3091  hydrolase  51.36 
 
 		 225 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2589  beta-lactamase domain-containing protein  51.35 
 
 		 225 aa  194  8.000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0687061  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3045  beta-lactamase domain protein  51.82 
 
 		 238 aa  189  2.9999999999999997e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0136984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15250  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  45.65 
 
 		 232 aa  176  2e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00905017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  38.89 
 
 		 206 aa  155  6e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  39.07 
 
 		 205 aa  153  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2375  beta-lactamase domain protein  40.85 
 
 		 210 aa  144  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  42.13 
 
 		 211 aa  143  2e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  36.28 
 
 		 205 aa  142  4e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0198  beta-lactamase domain protein  39.63 
 
 		 210 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  38.6 
 
 		 212 aa  140  9.999999999999999e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4341  metallo-beta-lactamase family protein  38.14 
 
 		 209 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4281  metallo-beta-lactamase family protein  38.14 
 
 		 209 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4394  metallo-beta-lactamase family protein  38.14 
 
 		 209 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  36.41 
 
 		 207 aa  140  1.9999999999999998e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3707  beta-lactamase domain-containing protein  42.79 
 
 		 209 aa  140  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4114  beta-lactamase domain-containing protein  38.14 
 
 		 209 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4003  metallo-beta-lactamase family protein  37.67 
 
 		 209 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  39.61 
 
 		 205 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4013  metallo-beta-lactamase family protein  37.67 
 
 		 209 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.098472  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4375  metallo-beta-lactamase family protein  37.67 
 
 		 209 aa  138  6e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0859  metallo-beta-lactamase family protein  37.67 
 
 		 209 aa  138  6e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0549  beta-lactamase domain-containing protein  35.27 
 
 		 216 aa  137  8.999999999999999e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141512  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  41.83 
 
 		 209 aa  137  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  41.59 
 
 		 213 aa  136  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4163  metallo-beta-lactamase family protein  38.25 
 
 		 208 aa  136  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00575624  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4485  metallo-beta-lactamase family protein  38.25 
 
 		 208 aa  136  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.859552  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  39.91 
 
 		 215 aa  137  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  39.35 
 
 		 209 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  39.35 
 
 		 209 aa  135  4e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2989  beta-lactamase domain-containing protein  37.21 
 
 		 209 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.86043  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  44.02 
 
 		 209 aa  134  8e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  39.13 
 
 		 210 aa  133  3e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1902  metallo-beta-lactamase family protein  35.81 
 
 		 206 aa  132  3.9999999999999996e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1805  beta-lactamase domain protein  40.17 
 
 		 238 aa  131  9e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0524123  normal  0.122686 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3268  Beta-lactamase-like  39.17 
 
 		 216 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1782  beta-lactamase domain protein  40.47 
 
 		 215 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00356762  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4317  putative metallo-beta-lactamase family protein  39.91 
 
 		 214 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2191  metallo-beta-lactamase family protein  35.32 
 
 		 206 aa  130  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0479  beta-lactamase domain protein  34.93 
 
 		 212 aa  130  2.0000000000000002e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0317  beta-lactamase domain-containing protein  40.83 
 
 		 214 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.605621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2576  beta-lactamase domain-containing protein  39.91 
 
 		 214 aa  128  6e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.835238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2799  beta-lactamase domain protein  39.91 
 
 		 214 aa  128  6e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.130329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1648  beta-lactamase domain-containing protein  40.48 
 
 		 218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1728  beta-lactamase domain-containing protein  37.44 
 
 		 215 aa  127  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  38.89 
 
 		 207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7673  metallo-hydrolase/oxidoreductase domain-containing protein  36.32 
 
 		 222 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  32.56 
 
 		 210 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3159  hydrolase  40 
 
 		 215 aa  127  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2508  beta-lactamase domain protein  40.09 
 
 		 214 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.523411 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2269  beta-lactamase domain-containing protein  38.21 
 
 		 214 aa  126  3e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.289735 
 
 
-
 
NC_004310  BR1517  metallo-beta-lactamase family protein  40.57 
 
 		 218 aa  126  3e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0715  Beta-lactamase-like  39.35 
 
 		 222 aa  126  3e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2261  beta-lactamase-like protein  39.34 
 
 		 219 aa  126  3e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3151  metallo-beta-lactamase family protein  38.71 
 
 		 214 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1467  metallo-beta-lactamase family protein  40.57 
 
 		 218 aa  125  4.0000000000000003e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0267  beta-lactamase domain-containing protein  36.87 
 
 		 214 aa  125  6e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0194  beta-lactamase domain-containing protein  36.87 
 
 		 214 aa  125  6e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113604  hitchhiker  0.00000000306881 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2142  metallo-beta-lactamase family protein  38.68 
 
 		 214 aa  125  6e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.84321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1082  beta-lactamase domain protein  43.48 
 
 		 222 aa  125  7e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3388  Beta-lactamase-like  36.87 
 
 		 241 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0199  beta-lactamase domain-containing protein  36.87 
 
 		 214 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604325  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1588  beta-lactamase domain-containing protein  36.56 
 
 		 237 aa  124  9e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  39.81 
 
 		 214 aa  124  9e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2909  metallo-beta-lactamase family protein  38.25 
 
 		 214 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.457315  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3822  metallo-beta-lactamase family protein  38.25 
 
 		 214 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0044  metallo-beta-lactamase superfamily protein  38.25 
 
 		 214 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3903  metallo-beta-lactamase family protein  38.25 
 
 		 214 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1632  metallo-beta-lactamase family protein  38.25 
 
 		 214 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5335  beta-lactamase domain-containing protein  40.28 
 
 		 213 aa  124  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.311932  normal  0.0822687 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0571  beta-lactamase domain protein  38.68 
 
 		 221 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.695514  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2969  metallo-beta-lactamase family protein  38.25 
 
 		 214 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0285  beta-lactamase domain-containing protein  36.87 
 
 		 214 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394027  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0402  beta-lactamase domain protein  39.45 
 
 		 214 aa  124  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3400  metallo-beta-lactamase family protein  38.25 
 
 		 214 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00696268  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3119  beta-lactamase domain-containing protein  39.81 
 
 		 216 aa  124  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.603346  normal  0.30493 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0134  beta-lactamase-like  38.1 
 
 		 222 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  37.21 
 
 		 209 aa  123  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2821  beta-lactamase-like  36.87 
 
 		 237 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>