More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3167 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3167  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 231 aa  456  1e-127  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0163096  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1818  beta-lactamase domain-containing protein  58.58 
 
 		 238 aa  247  1e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.52487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2120  beta-lactamase domain protein  57.46 
 
 		 231 aa  246  2e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.316298  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1808  beta-lactamase domain-containing protein  59.29 
 
 		 238 aa  243  9.999999999999999e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000181534 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2364  beta-lactamase domain protein  54.51 
 
 		 231 aa  241  7e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6103  beta-lactamase-like protein  57.08 
 
 		 231 aa  239  4e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1949  beta-lactamase domain protein  53.72 
 
 		 245 aa  236  3e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2055  beta-lactamase domain-containing protein  55.41 
 
 		 229 aa  229  2e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1700  beta-lactamase domain protein  52.74 
 
 		 234 aa  224  8e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153973  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3818  beta-lactamase domain-containing protein  55.2 
 
 		 231 aa  223  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.419873  normal  0.0855026 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2087  hydrolase  55.16 
 
 		 224 aa  218  3.9999999999999997e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3045  beta-lactamase domain protein  53.19 
 
 		 238 aa  217  1e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0136984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2396  beta-lactamase domain-containing protein  51.09 
 
 		 237 aa  215  4e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.668368  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2310  beta-lactamase domain protein  48.95 
 
 		 246 aa  212  2.9999999999999995e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.1865  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1336  beta-lactamase domain-containing protein  52.52 
 
 		 256 aa  211  5.999999999999999e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.542543 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3091  hydrolase  48.9 
 
 		 225 aa  203  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2323  beta-lactamase domain-containing protein  50.23 
 
 		 222 aa  201  6e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.420202  normal  0.0208731 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2284  beta-lactamase-like protein  50.23 
 
 		 222 aa  201  6e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.459653  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2331  beta-lactamase domain-containing protein  50.23 
 
 		 222 aa  201  6e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.995633  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12601  glyoxalase II (hydroxyacylglutathione hydrolase)  47.73 
 
 		 246 aa  195  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0111807  normal  0.957918 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15250  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  48.7 
 
 		 232 aa  194  8.000000000000001e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00905017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3357  beta-lactamase domain protein  47.14 
 
 		 233 aa  191  9e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0111217  normal  0.160448 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2589  beta-lactamase domain-containing protein  46.88 
 
 		 225 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0687061  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3810  beta-lactamase domain-containing protein  46.88 
 
 		 225 aa  181  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15170  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  51.6 
 
 		 226 aa  176  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.112325 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  33.03 
 
 		 207 aa  142  5e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  37.44 
 
 		 205 aa  141  9e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4114  beta-lactamase domain-containing protein  37.09 
 
 		 209 aa  139  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1082  beta-lactamase domain protein  41.85 
 
 		 222 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  36.53 
 
 		 215 aa  138  6e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  36.77 
 
 		 205 aa  138  6e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4281  metallo-beta-lactamase family protein  37.56 
 
 		 209 aa  138  7e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4013  metallo-beta-lactamase family protein  37.56 
 
 		 209 aa  138  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.098472  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4341  metallo-beta-lactamase family protein  37.09 
 
 		 209 aa  137  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4394  metallo-beta-lactamase family protein  37.09 
 
 		 209 aa  137  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0859  metallo-beta-lactamase family protein  37.09 
 
 		 209 aa  137  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1902  metallo-beta-lactamase family protein  36.2 
 
 		 206 aa  137  1e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  39.82 
 
 		 213 aa  137  1e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4375  metallo-beta-lactamase family protein  37.09 
 
 		 209 aa  137  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2989  beta-lactamase domain-containing protein  36.28 
 
 		 209 aa  136  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.86043  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4003  metallo-beta-lactamase family protein  37.09 
 
 		 209 aa  136  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  38.67 
 
 		 211 aa  137  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  38.01 
 
 		 212 aa  137  2e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2191  metallo-beta-lactamase family protein  35.75 
 
 		 206 aa  136  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  36.49 
 
 		 209 aa  135  4e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  35.56 
 
 		 209 aa  135  4e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4163  metallo-beta-lactamase family protein  37.56 
 
 		 208 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00575624  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4485  metallo-beta-lactamase family protein  37.56 
 
 		 208 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.859552  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2261  beta-lactamase-like protein  40.18 
 
 		 219 aa  133  1.9999999999999998e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  36.24 
 
 		 205 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  35.59 
 
 		 209 aa  131  9e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  38.29 
 
 		 214 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0198  beta-lactamase domain protein  36.77 
 
 		 210 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  37.27 
 
 		 208 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2512  beta-lactamase domain protein  37.95 
 
 		 214 aa  129  3e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.738891  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  31.82 
 
 		 206 aa  129  4.0000000000000003e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0418  beta-lactamase domain protein  34.08 
 
 		 212 aa  128  6e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1805  beta-lactamase domain protein  40.42 
 
 		 238 aa  128  7.000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0524123  normal  0.122686 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0715  Beta-lactamase-like  39.63 
 
 		 222 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0479  beta-lactamase domain protein  34.25 
 
 		 212 aa  127  1.0000000000000001e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00931  predicted metal-binding enzyme  36.28 
 
 		 215 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  36.28 
 
 		 215 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  36.28 
 
 		 215 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  40.19 
 
 		 213 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1679  beta-lactamase domain protein  43.33 
 
 		 265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.132867  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2391  metallo-beta-lactamase family protein  36.49 
 
 		 215 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  36.28 
 
 		 215 aa  125  5e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  36.28 
 
 		 215 aa  125  5e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  36.28 
 
 		 215 aa  125  5e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  31.96 
 
 		 210 aa  124  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  36.77 
 
 		 209 aa  123  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2508  beta-lactamase domain protein  36.7 
 
 		 214 aa  123  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.523411 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  34.68 
 
 		 207 aa  123  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1088  metallo-beta-lactamase family protein  36 
 
 		 215 aa  122  4e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153658  normal  0.346644 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2375  beta-lactamase domain protein  34.7 
 
 		 210 aa  122  5e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1949  beta-lactamase domain protein  36.32 
 
 		 198 aa  121  8e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.857141  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3159  hydrolase  38.32 
 
 		 215 aa  121  9e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0334  beta-lactamase domain-containing protein  36.04 
 
 		 212 aa  121  9e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0890  glyoxylase II family protein  38.71 
 
 		 218 aa  121  9.999999999999999e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000389063  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  34.25 
 
 		 207 aa  121  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  35.56 
 
 		 215 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0549  beta-lactamase domain-containing protein  34.12 
 
 		 216 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141512  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  32.11 
 
 		 210 aa  120  3e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1782  beta-lactamase domain protein  34.96 
 
 		 215 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00356762  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2799  beta-lactamase domain protein  37.21 
 
 		 214 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.130329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2576  beta-lactamase domain-containing protein  37.21 
 
 		 214 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.835238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  34.84 
 
 		 217 aa  118  7e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0571  beta-lactamase domain protein  38.01 
 
 		 221 aa  118  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.695514  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3479  Beta-lactamase-like  34.07 
 
 		 218 aa  118  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0220  beta-lactamase domain protein  36.32 
 
 		 212 aa  118  7.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2054  beta-lactamase domain protein  34.63 
 
 		 215 aa  118  7.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.128768  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  32.71 
 
 		 201 aa  118  7.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3563  beta-lactamase domain protein  34.51 
 
 		 218 aa  118  9e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1728  beta-lactamase domain-containing protein  33.63 
 
 		 215 aa  117  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3707  beta-lactamase domain-containing protein  35.98 
 
 		 209 aa  117  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0282  beta-lactamase domain-containing protein  36.2 
 
 		 240 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1634  beta-lactamase domain protein  34.53 
 
 		 211 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0717617  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0233  beta-lactamase-like  36.53 
 
 		 230 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2561  metallo-beta-lactamase family protein  32.89 
 
 		 215 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000219407  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1975  metallo-beta-lactamase superfamily protein  32.89 
 
 		 215 aa  116  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0642346  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>