More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1339 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1339  beta-lactamase-like protein  100 
 
 
192 aa  378  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  35.89 
 
 
205 aa  128  5.0000000000000004e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  36.92 
 
 
205 aa  128  6e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  35.23 
 
 
210 aa  123  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  41.54 
 
 
209 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2120  beta-lactamase domain protein  38.46 
 
 
231 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.316298  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  37.88 
 
 
211 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  38.46 
 
 
208 aa  115  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  35.96 
 
 
212 aa  115  3.9999999999999997e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  35.05 
 
 
213 aa  112  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3413  beta-lactamase domain protein  39.38 
 
 
209 aa  112  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2989  beta-lactamase domain-containing protein  34.33 
 
 
209 aa  112  3e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.86043  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  36.04 
 
 
210 aa  112  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3563  beta-lactamase domain protein  38.89 
 
 
218 aa  112  5e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4341  metallo-beta-lactamase family protein  34.01 
 
 
209 aa  111  5e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4394  metallo-beta-lactamase family protein  34.01 
 
 
209 aa  111  5e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4003  metallo-beta-lactamase family protein  34.01 
 
 
209 aa  111  6e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  37.06 
 
 
217 aa  111  6e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4013  metallo-beta-lactamase family protein  34.01 
 
 
209 aa  111  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.098472  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0859  metallo-beta-lactamase family protein  34.01 
 
 
209 aa  110  9e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  35.94 
 
 
205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3479  Beta-lactamase-like  38.38 
 
 
218 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4375  metallo-beta-lactamase family protein  34.01 
 
 
209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1731  beta-lactamase domain protein  35.23 
 
 
208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00010066  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  32.47 
 
 
207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4163  metallo-beta-lactamase family protein  34.18 
 
 
208 aa  108  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00575624  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4281  metallo-beta-lactamase family protein  33.5 
 
 
209 aa  109  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4485  metallo-beta-lactamase family protein  34.18 
 
 
208 aa  108  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.859552  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  35.38 
 
 
251 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  37.5 
 
 
213 aa  108  4.0000000000000004e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  36.22 
 
 
209 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4114  beta-lactamase domain-containing protein  31.98 
 
 
209 aa  108  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0479  beta-lactamase domain protein  33.7 
 
 
212 aa  108  5e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  36.73 
 
 
209 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3707  beta-lactamase domain-containing protein  34.36 
 
 
209 aa  107  8.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107683  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  37.76 
 
 
209 aa  107  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3167  beta-lactamase domain protein  39.05 
 
 
231 aa  107  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0163096  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6103  beta-lactamase-like protein  37.32 
 
 
231 aa  106  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2055  beta-lactamase domain-containing protein  36.36 
 
 
229 aa  105  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  35.23 
 
 
207 aa  105  6e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1818  beta-lactamase domain-containing protein  37.85 
 
 
238 aa  104  7e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.52487  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3631  beta-lactamase domain protein  36.82 
 
 
218 aa  104  8e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  35.03 
 
 
215 aa  104  8e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1808  beta-lactamase domain-containing protein  38.32 
 
 
238 aa  103  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000181534 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3004  beta-lactamase domain-containing protein  38.66 
 
 
204 aa  104  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.985459  normal  0.107301 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0673  beta-lactamase domain-containing protein  37.38 
 
 
206 aa  103  2e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.20621  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2087  hydrolase  36.19 
 
 
224 aa  102  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1637  beta-lactamase domain-containing protein  31.16 
 
 
207 aa  102  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.084203  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1603  beta-lactamase domain-containing protein  31.16 
 
 
207 aa  102  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0599073  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2186  beta-lactamase domain protein  35.27 
 
 
210 aa  102  4e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.704345 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0317  beta-lactamase domain-containing protein  36.18 
 
 
214 aa  102  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.605621  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  34.18 
 
 
207 aa  102  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3466  beta-lactamase domain protein  34.62 
 
 
218 aa  101  8e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2687  beta-lactamase domain protein  36.41 
 
 
195 aa  100  9e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1336  beta-lactamase domain-containing protein  34.21 
 
 
256 aa  100  9e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.542543 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2524  beta-lactamase domain-containing protein  33.84 
 
 
215 aa  100  9e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1110  metallo-beta-lactamase family protein  28.72 
 
 
207 aa  100  1e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2364  beta-lactamase domain protein  36.1 
 
 
231 aa  100  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2375  beta-lactamase domain protein  33.16 
 
 
210 aa  100  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2799  beta-lactamase domain protein  36.18 
 
 
214 aa  99.8  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.130329  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2576  beta-lactamase domain-containing protein  36.18 
 
 
214 aa  99.8  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.835238  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3171  beta-lactamase domain protein  35.32 
 
 
211 aa  99.8  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.343145 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  32.6 
 
 
209 aa  100  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2261  beta-lactamase-like protein  34.67 
 
 
219 aa  99.8  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0630  hypothetical protein  28.97 
 
 
214 aa  100  2e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  31.22 
 
 
201 aa  99.8  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3014  beta-lactamase domain protein  35.21 
 
 
213 aa  99.8  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.309827  normal  0.0865031 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0521  beta-lactamase domain protein  33.16 
 
 
258 aa  99.4  3e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000535463  hitchhiker  0.000000708931 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2240  beta-lactamase domain-containing protein  35.5 
 
 
213 aa  98.6  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1095  hydroxyacylglutathione hydrolase  34.48 
 
 
215 aa  98.2  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1112  hydroxyacylglutathione hydrolase  34.48 
 
 
215 aa  98.2  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347617  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1062  hydroxyacylglutathione hydrolase  34.48 
 
 
215 aa  98.2  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1030  hydroxyacylglutathione hydrolase  34.48 
 
 
215 aa  98.2  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  hitchhiker  0.00661846 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2954  beta-lactamase domain-containing protein  30.81 
 
 
214 aa  98.2  7e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1003  hydroxyacylglutathione hydrolase  34.48 
 
 
215 aa  98.2  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105674  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3138  beta-lactamase domain protein  33.65 
 
 
218 aa  98.2  7e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2508  beta-lactamase domain protein  35.18 
 
 
214 aa  97.8  8e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.523411 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1819  beta-lactamase domain-containing protein  36.57 
 
 
204 aa  97.4  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0368429  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3655  beta-lactamase domain-containing protein  36.18 
 
 
211 aa  97.1  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.658752  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2853  beta-lactamase domain protein  35.23 
 
 
210 aa  96.7  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3268  hypothetical protein  33.65 
 
 
224 aa  96.3  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0900  metallo-beta-lactamase family protein  29.51 
 
 
198 aa  96.3  2e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0113  beta-lactamase-like  35.57 
 
 
224 aa  96.7  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.110968 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0830  metallo-beta-lactamase family protein  29.51 
 
 
198 aa  96.3  2e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0389556  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3722  beta-lactamase domain-containing protein  36.96 
 
 
206 aa  97.1  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3091  hydrolase  35.85 
 
 
225 aa  96.3  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513985  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2323  beta-lactamase domain-containing protein  35.27 
 
 
222 aa  95.9  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.420202  normal  0.0208731 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2284  beta-lactamase-like protein  35.27 
 
 
222 aa  95.9  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.459653  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2331  beta-lactamase domain-containing protein  35.27 
 
 
222 aa  95.9  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.995633  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0715  Beta-lactamase-like  34.17 
 
 
222 aa  95.5  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1782  Metallo-beta-lactamase  31.53 
 
 
217 aa  95.5  4e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.111003  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1076  metallo-beta-lactamase family protein  30.37 
 
 
196 aa  95.5  4e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.253465  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1713  metallo-beta-lactamase family protein  37.36 
 
 
212 aa  95.1  5e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1201  metallo-beta-lactamase family protein  28.96 
 
 
198 aa  95.1  5e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7673  metallo-hydrolase/oxidoreductase domain-containing protein  34.67 
 
 
222 aa  95.1  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1082  beta-lactamase domain protein  36.06 
 
 
222 aa  95.1  6e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1728  beta-lactamase domain-containing protein  32.2 
 
 
215 aa  94.7  6e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1635  beta-lactamase domain-containing protein  32.35 
 
 
214 aa  95.1  6e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.702342  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0536  beta-lactamase domain protein  37.02 
 
 
226 aa  95.1  6e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0161694  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3818  beta-lactamase domain-containing protein  33.96 
 
 
231 aa  94.7  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.419873  normal  0.0855026 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>