More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0521 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0521  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 258 aa  519  1e-146  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000535463  hitchhiker  0.000000708931 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  42.03 
 
 		 212 aa  153  2e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0369  beta-lactamase domain-containing protein  45 
 
 		 201 aa  149  4e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0872  beta-lactamase domain protein  42.16 
 
 		 209 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.172924  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  43.96 
 
 		 210 aa  145  6e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  38.28 
 
 		 210 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  39.02 
 
 		 209 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4114  beta-lactamase domain-containing protein  39.71 
 
 		 209 aa  128  8.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3707  beta-lactamase domain-containing protein  39.9 
 
 		 209 aa  128  8.000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0479  beta-lactamase domain protein  36.84 
 
 		 212 aa  128  9.000000000000001e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  41.67 
 
 		 207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  38.54 
 
 		 251 aa  125  5e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4003  metallo-beta-lactamase family protein  39.22 
 
 		 209 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4281  metallo-beta-lactamase family protein  39.22 
 
 		 209 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  37.8 
 
 		 211 aa  124  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4341  metallo-beta-lactamase family protein  39.22 
 
 		 209 aa  124  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4394  metallo-beta-lactamase family protein  39.22 
 
 		 209 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0890  glyoxylase II family protein  36.62 
 
 		 218 aa  123  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000389063  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4375  metallo-beta-lactamase family protein  38.73 
 
 		 209 aa  124  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0859  metallo-beta-lactamase family protein  38.73 
 
 		 209 aa  124  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4013  metallo-beta-lactamase family protein  38.73 
 
 		 209 aa  123  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.098472  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  37.8 
 
 		 209 aa  122  8e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4163  metallo-beta-lactamase family protein  39.71 
 
 		 208 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00575624  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4485  metallo-beta-lactamase family protein  39.71 
 
 		 208 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.859552  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0673  beta-lactamase domain-containing protein  40.5 
 
 		 206 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.20621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1902  metallo-beta-lactamase family protein  36.1 
 
 		 206 aa  119  3e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  35.75 
 
 		 209 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  40.49 
 
 		 213 aa  119  4.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2191  metallo-beta-lactamase family protein  36.1 
 
 		 206 aa  119  4.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_691  metallo-beta-lactamase  35.44 
 
 		 217 aa  117  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.664332  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  38.24 
 
 		 215 aa  117  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003129  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.67 
 
 		 216 aa  118  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000730462  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  37.07 
 
 		 209 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  38.05 
 
 		 205 aa  116  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2120  beta-lactamase domain protein  36.57 
 
 		 231 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.316298  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  37.44 
 
 		 210 aa  115  6e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2989  beta-lactamase domain-containing protein  37.75 
 
 		 209 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.86043  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02708  hypothetical protein  35.71 
 
 		 218 aa  115  7.999999999999999e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1211  beta-lactamase domain protein  38.24 
 
 		 211 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000331215  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0635  beta-lactamase domain-containing protein  36.67 
 
 		 204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.320984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1608  beta-lactamase domain-containing protein  38.89 
 
 		 206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.130416  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0785  metallo-beta-lactamase family protein  34.47 
 
 		 205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.721139  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5335  beta-lactamase domain-containing protein  36.15 
 
 		 213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.311932  normal  0.0822687 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1782  Metallo-beta-lactamase  36.57 
 
 		 217 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.111003  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  35.92 
 
 		 207 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0198  beta-lactamase domain protein  35.61 
 
 		 210 aa  113  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  38.81 
 
 		 201 aa  113  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  36.76 
 
 		 213 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2512  beta-lactamase domain protein  36.32 
 
 		 214 aa  112  6e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.738891  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  36.59 
 
 		 205 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  36.49 
 
 		 205 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2375  beta-lactamase domain protein  35.96 
 
 		 210 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1731  beta-lactamase domain protein  35.47 
 
 		 208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00010066  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2087  hydrolase  33.94 
 
 		 224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0786  metallo-beta-lactamase family protein  36.71 
 
 		 208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0221878  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  36.45 
 
 		 208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2261  beta-lactamase-like protein  33.02 
 
 		 219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  34.78 
 
 		 209 aa  110  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0571  beta-lactamase domain protein  35.48 
 
 		 221 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.695514  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10570  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  33.17 
 
 		 218 aa  109  5e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.193193  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1336  beta-lactamase domain-containing protein  32.91 
 
 		 256 aa  109  5e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.542543 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5856  beta-lactamase domain protein  35.21 
 
 		 213 aa  108  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.518272  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25370  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  36.41 
 
 		 207 aa  108  9.000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.555955 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0451  beta-lactamase domain protein  33.49 
 
 		 213 aa  107  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3235  metallo-beta-lactamase family protein  35.71 
 
 		 213 aa  108  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2055  beta-lactamase domain-containing protein  34.11 
 
 		 229 aa  108  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  35.61 
 
 		 207 aa  108  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0711  beta-lactamase domain-containing protein  33.98 
 
 		 217 aa  108  1e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3016  beta-lactamase domain protein  35.55 
 
 		 219 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3563  beta-lactamase domain protein  36.45 
 
 		 218 aa  106  4e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2186  beta-lactamase domain protein  37.32 
 
 		 210 aa  106  4e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.704345 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1082  beta-lactamase domain protein  35.41 
 
 		 222 aa  105  5e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1732  beta-lactamase domain-containing protein  35.07 
 
 		 214 aa  105  6e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37479  normal  0.0747191 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0715  Beta-lactamase-like  35.32 
 
 		 222 aa  105  9e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3091  hydrolase  34.39 
 
 		 225 aa  105  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  35.78 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7673  metallo-hydrolase/oxidoreductase domain-containing protein  36.07 
 
 		 222 aa  104  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3171  beta-lactamase domain protein  35.29 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.343145 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  35.07 
 
 		 214 aa  104  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2142  metallo-beta-lactamase family protein  34.72 
 
 		 214 aa  103  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.84321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3014  beta-lactamase domain protein  34.43 
 
 		 213 aa  103  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.309827  normal  0.0865031 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2524  beta-lactamase domain-containing protein  34.13 
 
 		 215 aa  103  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0317  beta-lactamase domain-containing protein  33.18 
 
 		 214 aa  103  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.605621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2364  beta-lactamase domain protein  35.16 
 
 		 231 aa  102  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2184  beta-lactamase domain-containing protein  30.33 
 
 		 215 aa  103  4e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0861591  normal  0.0986326 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6103  beta-lactamase-like protein  33.33 
 
 		 231 aa  102  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2269  beta-lactamase domain-containing protein  34.62 
 
 		 214 aa  102  4e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.289735 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1755  beta-lactamase domain-containing protein  35.41 
 
 		 235 aa  102  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.622383  normal  0.422321 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0134  beta-lactamase-like  34.95 
 
 		 222 aa  102  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0243  beta-lactamase domain protein  34.6 
 
 		 215 aa  102  5e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2396  beta-lactamase domain-containing protein  35.4 
 
 		 237 aa  102  5e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.668368  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3479  Beta-lactamase-like  34.98 
 
 		 218 aa  102  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2753  beta-lactamase domain protein  34.12 
 
 		 217 aa  102  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.254037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2508  beta-lactamase domain protein  33.64 
 
 		 214 aa  102  8e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.523411 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2827  beta-lactamase domain-containing protein  34.12 
 
 		 214 aa  102  8e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0208272 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2853  beta-lactamase domain protein  34.27 
 
 		 210 aa  101  9e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0418  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 212 aa  101  9e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0841  Beta-lactamase-like  33.01 
 
 		 213 aa  101  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0225813 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1625  beta-lactamase domain protein  34.6 
 
 		 214 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.224285  normal  0.185558 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0233  beta-lactamase-like  33.18 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>