More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_22820 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_22820  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  100 
 
 		 236 aa  474  1e-133  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.726243 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0931  beta-lactamase domain-containing protein  70.94 
 
 		 238 aa  347  6e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0914  beta-lactamase-like protein  70.94 
 
 		 238 aa  347  6e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.189009  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10645  glyoxalase II  71.06 
 
 		 237 aa  345  2e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.014491 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0942  beta-lactamase domain-containing protein  70.94 
 
 		 238 aa  346  2e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1228  beta-lactamase domain-containing protein  68.09 
 
 		 262 aa  339  2e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0512718  normal  0.43815 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5123  beta-lactamase domain-containing protein  68.09 
 
 		 238 aa  337  9.999999999999999e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2264  beta-lactamase domain-containing protein  68.09 
 
 		 236 aa  320  9.999999999999999e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal  0.03688 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1241  beta-lactamase-like  64.68 
 
 		 237 aa  314  9e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.180519 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5738  Hydroxyacylglutathione hydrolase  40.1 
 
 		 233 aa  139  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1299  metallo-beta-lactamase family protein  37.24 
 
 		 237 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.827065  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0321  beta-lactamase domain-containing protein  30.19 
 
 		 202 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1043  Hydroxyacylglutathione hydrolase  35.41 
 
 		 235 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0844  hypothetical protein  30 
 
 		 235 aa  114  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0819  hypothetical protein  30 
 
 		 235 aa  114  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1732  beta-lactamase domain-containing protein  35.35 
 
 		 214 aa  114  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37479  normal  0.0747191 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3108  beta-lactamase domain-containing protein  33.01 
 
 		 233 aa  113  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4110  Hydroxyacylglutathione hydrolase  35.1 
 
 		 226 aa  112  7.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119244  normal  0.0132289 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3076  metallo-beta-lactamase family protein  34.6 
 
 		 207 aa  111  8.000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000251801  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  36.55 
 
 		 209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  35.27 
 
 		 251 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0269  metallo-beta-lactamase family protein  32.91 
 
 		 229 aa  108  8.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0318981  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0446  beta-lactamase domain protein  32.91 
 
 		 229 aa  108  8.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000228616 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  35.03 
 
 		 211 aa  107  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  35.18 
 
 		 208 aa  106  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0028  beta-lactamase domain-containing protein  30.95 
 
 		 220 aa  106  4e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0137537  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  35.32 
 
 		 213 aa  105  5e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  31.55 
 
 		 210 aa  105  8e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0851  beta-lactamase domain protein  31.66 
 
 		 235 aa  105  9e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1778  beta-lactamase-like  32.64 
 
 		 249 aa  104  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0321115 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2511  beta-lactamase domain-containing protein  34.19 
 
 		 249 aa  104  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00504203 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  31.95 
 
 		 361 aa  103  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0479  beta-lactamase domain protein  35.48 
 
 		 212 aa  104  2e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2191  metallo-beta-lactamase family protein  31.86 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1902  metallo-beta-lactamase family protein  32.35 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2646  beta-lactamase domain protein  33.8 
 
 		 344 aa  103  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1588  Beta-lactamase-like superfamily protein  32.64 
 
 		 249 aa  103  3e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000117648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  34.27 
 
 		 213 aa  102  4e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0691  putative Zn-dependent hydrolase including glyoxylases /rhodanese-related sulfurtransferase  32.55 
 
 		 345 aa  102  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.979433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2895  beta-lactamase-like protein  30.99 
 
 		 346 aa  100  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973984 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1814  beta-lactamase-like protein  35.55 
 
 		 228 aa  100  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3667  beta-lactamase-like  31.92 
 
 		 346 aa  100  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  30.88 
 
 		 206 aa  99  5e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  35.57 
 
 		 209 aa  98.6  8e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06840  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G12840)  34.57 
 
 		 254 aa  97.1  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.39505  normal  0.976226 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  32.2 
 
 		 205 aa  97.1  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0125  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  31.22 
 
 		 218 aa  97.1  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.477047  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1621  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.22 
 
 		 264 aa  97.1  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.252215  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3773  beta-lactamase-like protein  31.71 
 
 		 354 aa  97.1  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0372  beta-lactamase domain-containing protein  31.5 
 
 		 203 aa  96.7  3e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00504714  hitchhiker  0.000000000307388 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1110  metallo-beta-lactamase family protein  32.09 
 
 		 207 aa  96.3  4e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0282  beta-lactamase domain protein  31.94 
 
 		 213 aa  95.9  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.396725  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  33.51 
 
 		 209 aa  95.9  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  32.64 
 
 		 209 aa  95.9  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2897  beta-lactamase domain-containing protein  33.64 
 
 		 250 aa  95.5  7e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.981732 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  30.54 
 
 		 212 aa  95.5  7e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  29.61 
 
 		 207 aa  95.1  8e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0568  beta-lactamase domain protein  29.38 
 
 		 220 aa  94.4  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0549  beta-lactamase domain-containing protein  29.7 
 
 		 216 aa  94.4  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141512  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  33.5 
 
 		 214 aa  94.7  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1211  beta-lactamase domain protein  37.77 
 
 		 211 aa  94.7  1e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000331215  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  35.87 
 
 		 210 aa  94.7  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1949  beta-lactamase domain protein  34.17 
 
 		 198 aa  94  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.857141  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1103  metallo-beta-lactamase family protein  33.91 
 
 		 239 aa  93.6  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38033  predicted protein  28.94 
 
 		 258 aa  94.4  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00724128 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1733  beta-lactamase-like protein  30.19 
 
 		 232 aa  93.6  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000811303 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3334  Beta-lactamase-like  30.94 
 
 		 245 aa  93.2  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.973711  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2640  beta-lactamase domain protein  29.79 
 
 		 206 aa  93.2  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_691  metallo-beta-lactamase  32.39 
 
 		 217 aa  93.2  3e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.664332  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1793  Beta-lactamase-like  29.79 
 
 		 233 aa  93.2  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0443  beta-lactamase domain protein  30.73 
 
 		 208 aa  92.4  5e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02510  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  33.85 
 
 		 274 aa  92.4  6e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.115534  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  31.44 
 
 		 210 aa  92.4  6e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2295  hypothetical protein  31.78 
 
 		 233 aa  92  7e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000122918 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0932  Beta-lactamase-like  31.75 
 
 		 229 aa  91.3  1e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2719  beta-lactamase domain protein  33.16 
 
 		 218 aa  91.3  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.227848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2688  beta-lactamase-like protein  32.38 
 
 		 250 aa  90.9  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3631  beta-lactamase domain protein  34.9 
 
 		 374 aa  90.5  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.162031  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4293  beta-lactamase domain protein  35.91 
 
 		 376 aa  90.1  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2790  beta-lactamase domain protein  30.49 
 
 		 246 aa  89.7  4e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00087  metallo-beta-lactamase family protein  28.63 
 
 		 284 aa  89.7  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1532  Beta-lactamase-like  28.63 
 
 		 250 aa  89.4  4e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1222  beta-lactamase domain-containing protein  30.59 
 
 		 244 aa  88.6  8e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0114069  normal  0.0644035 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0182  Beta-lactamase-like  33.33 
 
 		 356 aa  87.8  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.237116 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  31.98 
 
 		 207 aa  87.8  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3034  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 382 aa  88.2  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3484  beta-lactamase-like protein  33.02 
 
 		 248 aa  88.2  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1949  beta-lactamase domain protein  27.23 
 
 		 208 aa  88.2  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2512  beta-lactamase domain protein  32.68 
 
 		 214 aa  87  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.738891  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0772  beta-lactamase domain protein  37.85 
 
 		 214 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0267  beta-lactamase domain protein  29.34 
 
 		 484 aa  87  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.30409  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0711  beta-lactamase domain-containing protein  32.04 
 
 		 217 aa  87.4  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0954  zn-dependent hydrolase, glyoxalase II family  28.7 
 
 		 233 aa  87  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.509073  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0297  Hydroxyacylglutathione hydrolase  29.53 
 
 		 239 aa  87  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000396762  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2720  metallo-beta-lactamase superfamily protein  31.63 
 
 		 299 aa  87  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.525017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3563  beta-lactamase domain protein  36.32 
 
 		 218 aa  87.4  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2853  beta-lactamase domain protein  37.06 
 
 		 210 aa  87  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0937  hypothetical protein  31.22 
 
 		 230 aa  87  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.110914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1057  metallo-beta-lactamase family protein  28.7 
 
 		 233 aa  87  2e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.9507  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0246  beta-lactamase domain protein  29.31 
 
 		 213 aa  87.4  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>