More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0851 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0851  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
235 aa  491  9.999999999999999e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3108  beta-lactamase domain-containing protein  44.34 
 
 
233 aa  220  9.999999999999999e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1299  metallo-beta-lactamase family protein  31.82 
 
 
237 aa  144  2e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.827065  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1043  Hydroxyacylglutathione hydrolase  35.92 
 
 
235 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5738  Hydroxyacylglutathione hydrolase  36.73 
 
 
233 aa  134  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2264  beta-lactamase domain-containing protein  34.17 
 
 
236 aa  118  7.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal  0.03688 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5123  beta-lactamase domain-containing protein  32.5 
 
 
238 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2191  metallo-beta-lactamase family protein  35.29 
 
 
206 aa  113  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1902  metallo-beta-lactamase family protein  35.29 
 
 
206 aa  113  3e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1228  beta-lactamase domain-containing protein  31.53 
 
 
262 aa  107  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0512718  normal  0.43815 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10645  glyoxalase II  29.86 
 
 
237 aa  107  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.014491 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0321  beta-lactamase domain-containing protein  31.07 
 
 
202 aa  107  2e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0914  beta-lactamase-like protein  31.16 
 
 
238 aa  106  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.189009  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0942  beta-lactamase domain-containing protein  31.16 
 
 
238 aa  106  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0931  beta-lactamase domain-containing protein  31.16 
 
 
238 aa  106  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22820  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  31.66 
 
 
236 aa  105  8e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.726243 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  29 
 
 
205 aa  101  9e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1241  beta-lactamase-like  32.67 
 
 
237 aa  101  9e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.180519 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4110  Hydroxyacylglutathione hydrolase  28.04 
 
 
226 aa  99.4  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119244  normal  0.0132289 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0372  beta-lactamase domain-containing protein  31.72 
 
 
203 aa  99  6e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00504714  hitchhiker  0.000000000307388 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0568  beta-lactamase domain protein  32.37 
 
 
220 aa  97.4  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  31.63 
 
 
205 aa  97.1  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0282  beta-lactamase domain protein  28.87 
 
 
213 aa  95.5  7e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.396725  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  33.52 
 
 
210 aa  95.1  9e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4719  beta-lactamase domain-containing protein  29.57 
 
 
308 aa  89.7  4e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0422  metallo-beta-lactamase family protein  28.31 
 
 
257 aa  89  6e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0543677  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1765  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.31 
 
 
257 aa  89  6e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0711  beta-lactamase domain-containing protein  31.22 
 
 
217 aa  88.6  8e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0785  metallo-beta-lactamase family protein  31.82 
 
 
205 aa  87  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.721139  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0028  beta-lactamase domain-containing protein  27.18 
 
 
220 aa  86.7  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0137537  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_691  metallo-beta-lactamase  31.22 
 
 
217 aa  86.7  3e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.664332  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  30.69 
 
 
212 aa  86.3  3e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  32.77 
 
 
206 aa  86.3  4e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2687  beta-lactamase domain protein  30.39 
 
 
195 aa  84.7  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31656  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.91 
 
 
255 aa  84.7  0.000000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.976065  normal  0.697857 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4658  hypothetical protein  29 
 
 
432 aa  84.7  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0479  beta-lactamase domain protein  30.26 
 
 
212 aa  84.7  0.000000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1732  beta-lactamase domain-containing protein  27.69 
 
 
214 aa  83.6  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37479  normal  0.0747191 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1949  beta-lactamase domain protein  29.23 
 
 
198 aa  82.8  0.000000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.857141  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06840  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G12840)  31.4 
 
 
254 aa  82.4  0.000000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.39505  normal  0.976226 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  26.63 
 
 
209 aa  82.4  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  31.02 
 
 
201 aa  82  0.000000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02510  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  32.75 
 
 
274 aa  82  0.000000000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.115534  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2563  metallo-beta-lactamase family protein  31.15 
 
 
267 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18790  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  27.08 
 
 
208 aa  81.6  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.659057 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  25.94 
 
 
213 aa  81.3  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0246  beta-lactamase domain protein  26.94 
 
 
213 aa  80.9  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  28.28 
 
 
209 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0932  Beta-lactamase-like  28.74 
 
 
229 aa  80.1  0.00000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002770  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.07 
 
 
252 aa  79.7  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.18088  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04020  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  31.32 
 
 
222 aa  80.1  0.00000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.626574 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2720  metallo-beta-lactamase superfamily protein  26.85 
 
 
299 aa  79.7  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.525017  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2381  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.51 
 
 
256 aa  79.7  0.00000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.239292 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0498  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.33 
 
 
256 aa  79.3  0.00000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0378559  normal  0.142728 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1481  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.25 
 
 
250 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00263805  normal  0.131466 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0314  beta-lactamase domain-containing protein  33.1 
 
 
214 aa  79.3  0.00000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0549  beta-lactamase domain-containing protein  28.79 
 
 
216 aa  79  0.00000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141512  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  30.9 
 
 
210 aa  79  0.00000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0872  beta-lactamase domain protein  25.98 
 
 
209 aa  78.6  0.00000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.172924  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  27.78 
 
 
209 aa  78.6  0.00000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  29.61 
 
 
205 aa  78.6  0.00000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1828  putative hydroxyacylglutathione hydrolase GloB  30.68 
 
 
252 aa  77.8  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4346  beta-lactamase domain protein  29.95 
 
 
242 aa  78.2  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3484  beta-lactamase-like protein  26.09 
 
 
248 aa  77.8  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21890  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  31.55 
 
 
229 aa  77  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0120239 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  26.8 
 
 
209 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  28.27 
 
 
214 aa  77.4  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1595  Beta-lactamase-like  30.68 
 
 
265 aa  76.6  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  24.88 
 
 
213 aa  76.6  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2295  hypothetical protein  30.12 
 
 
233 aa  76.6  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000122918 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2719  beta-lactamase domain protein  31.89 
 
 
218 aa  76.6  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.227848  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  28.65 
 
 
207 aa  77  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  28.43 
 
 
251 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  29.27 
 
 
361 aa  76.3  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1884  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.94 
 
 
258 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000396006  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3004  beta-lactamase domain-containing protein  24.75 
 
 
204 aa  75.5  0.0000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.985459  normal  0.107301 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1898  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.05 
 
 
256 aa  75.5  0.0000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2019  hydroxyacylglutathione hydrolase  31.41 
 
 
282 aa  75.9  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.612705  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1587  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.17 
 
 
255 aa  75.5  0.0000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.325978  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1403  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.16 
 
 
258 aa  75.5  0.0000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0310666  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1446  beta-lactamase domain-containing protein  29.32 
 
 
215 aa  75.1  0.0000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.746343  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2346  beta-lactamase domain protein  26.7 
 
 
226 aa  75.1  0.0000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1141  hydroxyacylglutathione hydrolase  31.54 
 
 
251 aa  75.1  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1110  metallo-beta-lactamase family protein  27.93 
 
 
207 aa  74.7  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1566  beta-lactamase domain protein  26.5 
 
 
230 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2685  metallo-beta-lactamase family protein  29.94 
 
 
280 aa  74.3  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0199524 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0430  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.32 
 
 
256 aa  74.7  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.255177 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1589  Hydroxyacylglutathione hydrolase  26.5 
 
 
230 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0793524 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03213  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.7 
 
 
252 aa  74.3  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4621  beta-lactamase-like  25.53 
 
 
302 aa  73.6  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.380042  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0946  beta-lactamase-like  28.35 
 
 
288 aa  74.3  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000101762  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3334  Beta-lactamase-like  26.17 
 
 
245 aa  73.2  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.973711  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2892  beta-lactamase domain-containing protein  26.38 
 
 
301 aa  73.2  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.433152  normal  0.377505 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2161  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.43 
 
 
295 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000853605  normal  0.0597088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2238  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.43 
 
 
295 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000229962  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3064  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.33 
 
 
242 aa  72.8  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00018038  normal  0.0339192 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3773  beta-lactamase-like protein  27.45 
 
 
354 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2401  putative metallo-beta-lactamase  31.43 
 
 
252 aa  72.4  0.000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53510  hypothetical protein  30.26 
 
 
213 aa  72.4  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000645977 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1112  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.27 
 
 
215 aa  72  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347617  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>