More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_18790 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_18790  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  100 
 
 		 208 aa  423  1e-117  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.659057 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0656  beta-lactamase domain protein  63.94 
 
 		 208 aa  282  3.0000000000000004e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2397  putative hydrolase  63.9 
 
 		 210 aa  277  9e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.322158 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2453  beta-lactamase domain protein  68.29 
 
 		 207 aa  271  6e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000197435  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1330  beta-lactamase domain-containing protein  60.49 
 
 		 205 aa  256  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.422414 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1402  beta-lactamase domain-containing protein  59.8 
 
 		 204 aa  253  1.0000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.147744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0909  beta-lactamase domain protein  57.62 
 
 		 213 aa  250  1e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0324643  normal  0.0194681 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10570  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  58.72 
 
 		 218 aa  248  6e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.193193  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3381  beta-lactamase-like protein  55.34 
 
 		 210 aa  241  5e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.302529  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3443  beta-lactamase domain-containing protein  55.34 
 
 		 210 aa  241  5e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3392  beta-lactamase domain-containing protein  55.34 
 
 		 210 aa  241  5e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.302908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3768  beta-lactamase domain protein  56.59 
 
 		 209 aa  241  6e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0366381  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0409  beta-lactamase domain protein  55.88 
 
 		 208 aa  240  1e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.494171  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0093  beta-lactamase domain protein  55.88 
 
 		 210 aa  238  5e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12288  hypothetical protein  55.66 
 
 		 211 aa  237  1e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3936  putative hydrolase  57.97 
 
 		 211 aa  236  2e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3722  beta-lactamase domain-containing protein  58.38 
 
 		 206 aa  236  2e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3768  beta-lactamase domain-containing protein  54.85 
 
 		 209 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.905496 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3650  beta-lactamase domain-containing protein  59.07 
 
 		 207 aa  232  3e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.335819  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2765  beta-lactamase domain-containing protein  54.15 
 
 		 209 aa  231  7.000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.268698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03750  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  51.71 
 
 		 228 aa  225  4e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0915981 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15320  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  56.06 
 
 		 204 aa  223  1e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4164  beta-lactamase domain protein  57.79 
 
 		 205 aa  222  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420537  normal  0.04389 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3471  beta-lactamase domain protein  54.31 
 
 		 206 aa  221  4e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4760  beta-lactamase domain protein  55.84 
 
 		 202 aa  221  6e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2903  beta-lactamase domain protein  55.38 
 
 		 202 aa  218  7e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5067  beta-lactamase domain-containing protein  52.66 
 
 		 215 aa  216  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.512117  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1448  beta-lactamase-like  51.92 
 
 		 216 aa  214  9e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65636  normal  0.0425697 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2886  beta-lactamase domain protein  53.33 
 
 		 220 aa  201  6e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21860  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  51.3 
 
 		 574 aa  200  9.999999999999999e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2551  putative hydrolase  48.92 
 
 		 209 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.505017  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2999  beta-lactamase domain-containing protein  43.28 
 
 		 235 aa  168  7e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.658581 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8397  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  43.28 
 
 		 238 aa  166  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.376935 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0512  Zn-dependent hydrolase  37.44 
 
 		 275 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.146741  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3834  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase  38.42 
 
 		 339 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.537571 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1196  beta-lactamase domain protein  37.67 
 
 		 235 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.269825  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2687  beta-lactamase domain protein  42.86 
 
 		 195 aa  144  8.000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  37.1 
 
 		 215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  35.14 
 
 		 212 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0479  beta-lactamase domain protein  31.77 
 
 		 212 aa  115  6e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  38.5 
 
 		 209 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25370  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  37.57 
 
 		 207 aa  112  5e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.555955 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  36.27 
 
 		 211 aa  111  7.000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12170  beta-lactamase domain protein  36.9 
 
 		 210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000265397  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  37.97 
 
 		 209 aa  109  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1110  metallo-beta-lactamase family protein  32.11 
 
 		 207 aa  108  7.000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  34.83 
 
 		 215 aa  107  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0418  beta-lactamase domain protein  34.72 
 
 		 212 aa  107  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  34.83 
 
 		 215 aa  107  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  34.83 
 
 		 215 aa  107  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00931  predicted metal-binding enzyme  34.83 
 
 		 215 aa  106  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  34.83 
 
 		 215 aa  106  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  34.83 
 
 		 215 aa  106  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6047  hydroxyacylglutathione hydrolase W  34.9 
 
 		 213 aa  106  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0800591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2391  metallo-beta-lactamase family protein  34.83 
 
 		 215 aa  106  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0705  beta-lactamase domain protein  37.37 
 
 		 201 aa  106  3e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  34.83 
 
 		 215 aa  105  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1637  beta-lactamase domain-containing protein  33.68 
 
 		 207 aa  105  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.084203  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1603  beta-lactamase domain-containing protein  33.68 
 
 		 207 aa  105  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0599073  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  34.76 
 
 		 210 aa  105  5e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1949  beta-lactamase domain protein  35.94 
 
 		 198 aa  105  7e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.857141  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  31.77 
 
 		 201 aa  104  7e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  36.46 
 
 		 251 aa  104  8e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1088  metallo-beta-lactamase family protein  34.27 
 
 		 215 aa  104  9e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153658  normal  0.346644 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0859  metallo-beta-lactamase family protein  31.41 
 
 		 209 aa  103  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4375  metallo-beta-lactamase family protein  31.41 
 
 		 209 aa  103  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  37.43 
 
 		 217 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2261  beta-lactamase-like protein  35.6 
 
 		 219 aa  103  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  35.45 
 
 		 205 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21890  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  35.57 
 
 		 229 aa  102  4e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0120239 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  34.54 
 
 		 213 aa  102  4e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2184  beta-lactamase domain-containing protein  34.92 
 
 		 215 aa  102  6e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0861591  normal  0.0986326 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1446  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 215 aa  101  7e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.746343  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4341  metallo-beta-lactamase family protein  30.89 
 
 		 209 aa  101  8e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4394  metallo-beta-lactamase family protein  30.89 
 
 		 209 aa  101  8e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2000  beta-lactamase domain-containing protein  34.02 
 
 		 214 aa  101  8e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.506851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  35.08 
 
 		 208 aa  100  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0785  metallo-beta-lactamase family protein  34.39 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.721139  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4114  beta-lactamase domain-containing protein  30.89 
 
 		 209 aa  100  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  31.98 
 
 		 213 aa  100  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1095  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.71 
 
 		 215 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1630  beta-lactamase-like  32.12 
 
 		 232 aa  100  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  32.54 
 
 		 214 aa  100  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1003  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.71 
 
 		 215 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105674  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  32.45 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1062  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.71 
 
 		 215 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1112  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.71 
 
 		 215 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1030  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.71 
 
 		 215 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  hitchhiker  0.00661846 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  34.21 
 
 		 205 aa  99.8  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4013  metallo-beta-lactamase family protein  30.89 
 
 		 209 aa  99.8  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.098472  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3563  beta-lactamase domain protein  36.51 
 
 		 218 aa  99.8  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4281  metallo-beta-lactamase family protein  30.89 
 
 		 209 aa  99  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4163  metallo-beta-lactamase family protein  31.05 
 
 		 208 aa  99.4  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00575624  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4485  metallo-beta-lactamase family protein  31.05 
 
 		 208 aa  99.4  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.859552  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_691  metallo-beta-lactamase  32.65 
 
 		 217 aa  99.4  4e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.664332  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2186  beta-lactamase domain protein  35.03 
 
 		 210 aa  98.6  6e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.704345 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2125  putative hydrolase  34.72 
 
 		 203 aa  98.6  6e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4003  metallo-beta-lactamase family protein  30.37 
 
 		 209 aa  98.2  7e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  32.64 
 
 		 206 aa  98.2  7e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2719  beta-lactamase domain protein  30.91 
 
 		 218 aa  98.2  8e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.227848  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>