More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3650 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3650  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 207 aa  411  1e-114  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.335819  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15320  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  73.5 
 
 		 204 aa  292  2e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4164  beta-lactamase domain protein  71.64 
 
 		 205 aa  291  5e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420537  normal  0.04389 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3768  beta-lactamase domain protein  70.5 
 
 		 209 aa  270  1e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0366381  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21860  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  64.8 
 
 		 574 aa  266  2e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2397  putative hydrolase  65.13 
 
 		 210 aa  256  2e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.322158 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0909  beta-lactamase domain protein  63 
 
 		 213 aa  242  3e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0324643  normal  0.0194681 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0656  beta-lactamase domain protein  63.21 
 
 		 208 aa  241  3.9999999999999997e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1402  beta-lactamase domain-containing protein  60.51 
 
 		 204 aa  235  4e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.147744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18790  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  59.07 
 
 		 208 aa  232  3e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.659057 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4760  beta-lactamase domain protein  60 
 
 		 202 aa  231  7.000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10570  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  57.28 
 
 		 218 aa  228  3e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.193193  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3381  beta-lactamase-like protein  57.64 
 
 		 210 aa  225  3e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.302529  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3443  beta-lactamase domain-containing protein  57.64 
 
 		 210 aa  225  3e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3392  beta-lactamase domain-containing protein  57.64 
 
 		 210 aa  225  3e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.302908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1330  beta-lactamase domain-containing protein  59.07 
 
 		 205 aa  225  4e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.422414 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2903  beta-lactamase domain protein  58.46 
 
 		 202 aa  222  4e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2453  beta-lactamase domain protein  60.82 
 
 		 207 aa  219  3e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000197435  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0409  beta-lactamase domain protein  56.19 
 
 		 208 aa  219  3e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.494171  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3471  beta-lactamase domain protein  55.28 
 
 		 206 aa  218  6e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2886  beta-lactamase domain protein  57.95 
 
 		 220 aa  217  1e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0093  beta-lactamase domain protein  54.82 
 
 		 210 aa  216  2e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12288  hypothetical protein  56.22 
 
 		 211 aa  214  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3722  beta-lactamase domain-containing protein  54.27 
 
 		 206 aa  213  9.999999999999999e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3768  beta-lactamase domain-containing protein  56.41 
 
 		 209 aa  212  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.905496 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2765  beta-lactamase domain-containing protein  55.56 
 
 		 209 aa  209  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.268698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03750  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  53.61 
 
 		 228 aa  206  3e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0915981 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5067  beta-lactamase domain-containing protein  53.17 
 
 		 215 aa  205  4e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.512117  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1448  beta-lactamase-like  53.27 
 
 		 216 aa  200  9.999999999999999e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65636  normal  0.0425697 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3936  putative hydrolase  55.44 
 
 		 211 aa  193  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2551  putative hydrolase  44.97 
 
 		 209 aa  156  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.505017  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2999  beta-lactamase domain-containing protein  43.01 
 
 		 235 aa  147  8e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.658581 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1196  beta-lactamase domain protein  39.27 
 
 		 235 aa  143  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.269825  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8397  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  42.78 
 
 		 238 aa  142  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.376935 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3834  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase  36.95 
 
 		 339 aa  129  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.537571 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2687  beta-lactamase domain protein  43.82 
 
 		 195 aa  129  3e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  38.22 
 
 		 214 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  38.3 
 
 		 207 aa  117  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  40.96 
 
 		 208 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  35.48 
 
 		 212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  36.46 
 
 		 211 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0512  Zn-dependent hydrolase  33.33 
 
 		 275 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.146741  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2261  beta-lactamase-like protein  36.65 
 
 		 219 aa  109  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21890  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  38.14 
 
 		 229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0120239 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  38.1 
 
 		 209 aa  109  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12170  beta-lactamase domain protein  35.68 
 
 		 210 aa  107  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000265397  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3413  beta-lactamase domain protein  35.45 
 
 		 209 aa  107  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  38.3 
 
 		 209 aa  107  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  36.7 
 
 		 251 aa  106  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  38.3 
 
 		 209 aa  104  7e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  36.84 
 
 		 201 aa  104  9e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  38.62 
 
 		 210 aa  104  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25370  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  37.57 
 
 		 207 aa  104  1e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.555955 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  35.98 
 
 		 215 aa  103  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6047  hydroxyacylglutathione hydrolase W  36.46 
 
 		 213 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0800591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  34.74 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0539  beta-lactamase domain-containing protein  40.66 
 
 		 205 aa  102  3e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  35.08 
 
 		 209 aa  101  6e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  38.42 
 
 		 207 aa  100  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0479  beta-lactamase domain protein  32.8 
 
 		 212 aa  100  2e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1949  beta-lactamase domain protein  35.6 
 
 		 198 aa  100  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.857141  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0705  beta-lactamase domain protein  36.81 
 
 		 201 aa  100  2e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  36.27 
 
 		 213 aa  100  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0673  beta-lactamase domain-containing protein  39.34 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.20621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0635  beta-lactamase domain-containing protein  38.46 
 
 		 204 aa  99.8  3e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.320984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3134  beta-lactamase domain-containing protein  35.24 
 
 		 216 aa  99  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275883  normal  0.0207681 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_691  metallo-beta-lactamase  34.21 
 
 		 217 aa  97.4  1e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.664332  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2000  beta-lactamase domain-containing protein  36.07 
 
 		 214 aa  97.4  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.506851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3707  beta-lactamase domain-containing protein  36.27 
 
 		 209 aa  97.4  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 206 aa  97.8  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4163  metallo-beta-lactamase family protein  31.12 
 
 		 208 aa  97.1  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00575624  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4003  metallo-beta-lactamase family protein  29.74 
 
 		 209 aa  97.1  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4485  metallo-beta-lactamase family protein  31.12 
 
 		 208 aa  97.1  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.859552  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1630  beta-lactamase-like  36.9 
 
 		 232 aa  96.7  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0321  beta-lactamase domain-containing protein  34.05 
 
 		 202 aa  96.7  2e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1608  beta-lactamase domain-containing protein  38.07 
 
 		 206 aa  97.1  2e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.130416  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0785  metallo-beta-lactamase family protein  34.21 
 
 		 205 aa  96.3  3e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.721139  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  36.84 
 
 		 217 aa  96.3  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  34.39 
 
 		 209 aa  96.3  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0859  metallo-beta-lactamase family protein  29.17 
 
 		 209 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0630  hypothetical protein  31.77 
 
 		 214 aa  95.5  4e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1108  beta-lactamase domain-containing protein  34.95 
 
 		 218 aa  95.1  6e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.789331  normal  0.46822 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4281  metallo-beta-lactamase family protein  29.23 
 
 		 209 aa  95.1  6e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4375  metallo-beta-lactamase family protein  29.17 
 
 		 209 aa  95.1  7e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  34.04 
 
 		 205 aa  95.1  7e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4114  beta-lactamase domain-containing protein  28.72 
 
 		 209 aa  94.7  8e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0711  beta-lactamase domain-containing protein  35.75 
 
 		 217 aa  94.7  8e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  32.11 
 
 		 207 aa  94.4  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4013  metallo-beta-lactamase family protein  28.72 
 
 		 209 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.098472  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2989  beta-lactamase domain-containing protein  31.44 
 
 		 209 aa  94  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.86043  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3004  beta-lactamase domain-containing protein  37.04 
 
 		 204 aa  93.2  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.985459  normal  0.107301 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  34.9 
 
 		 205 aa  93.6  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3138  beta-lactamase domain protein  32.8 
 
 		 218 aa  93.6  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0872  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 209 aa  93.2  3e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.172924  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2125  putative hydrolase  35.29 
 
 		 203 aa  92.8  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2056  beta-lactamase domain-containing protein  35.36 
 
 		 222 aa  92.8  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.193314  normal  0.542159 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4341  metallo-beta-lactamase family protein  29.95 
 
 		 209 aa  92.4  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3466  beta-lactamase domain protein  32.8 
 
 		 218 aa  92.4  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4394  metallo-beta-lactamase family protein  29.95 
 
 		 209 aa  92.4  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3563  beta-lactamase domain protein  35.64 
 
 		 218 aa  92.4  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>