More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0512 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0512  Zn-dependent hydrolase  100 
 
 		 275 aa  548  1e-155  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.146741  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3834  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase  59.61 
 
 		 339 aa  263  3e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.537571 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2999  beta-lactamase domain-containing protein  49.76 
 
 		 235 aa  189  4e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.658581 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8397  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  44.39 
 
 		 238 aa  162  6e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.376935 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1196  beta-lactamase domain protein  39.91 
 
 		 235 aa  150  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.269825  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18790  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  37.44 
 
 		 208 aa  146  5e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.659057 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0656  beta-lactamase domain protein  33.82 
 
 		 208 aa  141  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03750  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  36.1 
 
 		 228 aa  141  9.999999999999999e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0915981 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2397  putative hydrolase  37.44 
 
 		 210 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.322158 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3936  putative hydrolase  36.63 
 
 		 211 aa  139  7e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3392  beta-lactamase domain-containing protein  37.93 
 
 		 210 aa  138  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.302908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3381  beta-lactamase-like protein  37.93 
 
 		 210 aa  138  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.302529  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3443  beta-lactamase domain-containing protein  37.93 
 
 		 210 aa  138  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1402  beta-lactamase domain-containing protein  34.98 
 
 		 204 aa  132  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.147744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1330  beta-lactamase domain-containing protein  37.25 
 
 		 205 aa  132  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.422414 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2453  beta-lactamase domain protein  36.59 
 
 		 207 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000197435  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0409  beta-lactamase domain protein  33.5 
 
 		 208 aa  130  3e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.494171  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3768  beta-lactamase domain-containing protein  35.96 
 
 		 209 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.905496 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2765  beta-lactamase domain-containing protein  35.96 
 
 		 209 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.268698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12288  hypothetical protein  36.49 
 
 		 211 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5067  beta-lactamase domain-containing protein  37.38 
 
 		 215 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.512117  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3768  beta-lactamase domain protein  33.5 
 
 		 209 aa  127  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0366381  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0909  beta-lactamase domain protein  34.76 
 
 		 213 aa  126  4.0000000000000003e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0324643  normal  0.0194681 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0093  beta-lactamase domain protein  33.49 
 
 		 210 aa  125  6e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15320  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  36 
 
 		 204 aa  123  3e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4164  beta-lactamase domain protein  38.14 
 
 		 205 aa  123  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420537  normal  0.04389 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10570  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  34.56 
 
 		 218 aa  122  5e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.193193  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2903  beta-lactamase domain protein  32.83 
 
 		 202 aa  121  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4760  beta-lactamase domain protein  35.38 
 
 		 202 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3722  beta-lactamase domain-containing protein  35.32 
 
 		 206 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3471  beta-lactamase domain protein  35.82 
 
 		 206 aa  117  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1448  beta-lactamase-like  33.49 
 
 		 216 aa  116  5e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65636  normal  0.0425697 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2886  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 220 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3650  beta-lactamase domain-containing protein  34.36 
 
 		 207 aa  112  9e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.335819  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21860  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  37.17 
 
 		 574 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2551  putative hydrolase  36.08 
 
 		 209 aa  102  7e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.505017  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2375  beta-lactamase domain protein  34.38 
 
 		 210 aa  90.5  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0479  beta-lactamase domain protein  28.65 
 
 		 212 aa  85.5  8e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2687  beta-lactamase domain protein  29.41 
 
 		 195 aa  83.2  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  31.55 
 
 		 217 aa  81.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  31.53 
 
 		 211 aa  81.3  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0198  beta-lactamase domain protein  30.89 
 
 		 210 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4003  metallo-beta-lactamase family protein  30.26 
 
 		 209 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4013  metallo-beta-lactamase family protein  29.74 
 
 		 209 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.098472  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1949  beta-lactamase domain protein  30.57 
 
 		 198 aa  78.2  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.857141  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4281  metallo-beta-lactamase family protein  29.74 
 
 		 209 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4163  metallo-beta-lactamase family protein  29.02 
 
 		 208 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00575624  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4375  metallo-beta-lactamase family protein  29.74 
 
 		 209 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4485  metallo-beta-lactamase family protein  29.02 
 
 		 208 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.859552  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2989  beta-lactamase domain-containing protein  29.9 
 
 		 209 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.86043  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0859  metallo-beta-lactamase family protein  29.74 
 
 		 209 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3563  beta-lactamase domain protein  29.1 
 
 		 218 aa  76.3  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3479  Beta-lactamase-like  28.04 
 
 		 218 aa  75.9  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4341  metallo-beta-lactamase family protein  28.72 
 
 		 209 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0203  beta-lactamase domain-containing protein  32.66 
 
 		 263 aa  74.7  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0208476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4394  metallo-beta-lactamase family protein  28.72 
 
 		 209 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0549  beta-lactamase domain-containing protein  30.69 
 
 		 216 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141512  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4114  beta-lactamase domain-containing protein  29.53 
 
 		 209 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  29.17 
 
 		 215 aa  72  0.000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2853  beta-lactamase domain protein  30.21 
 
 		 210 aa  71.6  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1731  beta-lactamase domain protein  30.16 
 
 		 208 aa  72  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00010066  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3631  beta-lactamase domain protein  28.95 
 
 		 218 aa  71.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  29.47 
 
 		 205 aa  70.9  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12170  beta-lactamase domain protein  27.98 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000265397  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0841  Beta-lactamase-like  28.41 
 
 		 213 aa  70.1  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0225813 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  28.09 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0786  metallo-beta-lactamase family protein  29.69 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0221878  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4851  beta-lactamase domain protein  33.74 
 
 		 296 aa  68.9  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  29.55 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0418  beta-lactamase domain protein  29.9 
 
 		 212 aa  68.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1713  metallo-beta-lactamase family protein  27.18 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3413  beta-lactamase domain protein  28.65 
 
 		 209 aa  67.8  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2261  beta-lactamase-like protein  28.02 
 
 		 219 aa  67.8  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  28.12 
 
 		 207 aa  67.8  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0539  beta-lactamase domain-containing protein  31.89 
 
 		 205 aa  67.8  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0443  beta-lactamase domain protein  25.85 
 
 		 208 aa  67  0.0000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  27.37 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  29.29 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6047  hydroxyacylglutathione hydrolase W  26.09 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0800591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  26.44 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  26.44 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2391  metallo-beta-lactamase family protein  26.44 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  26.44 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00931  predicted metal-binding enzyme  26.44 
 
 		 215 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  26.44 
 
 		 215 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0673  beta-lactamase domain-containing protein  29.35 
 
 		 206 aa  65.1  0.000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.20621  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  26.44 
 
 		 215 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0068  metallo-beta-lactamase superfamily protein  25 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0554126  normal  0.354369 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3171  beta-lactamase domain protein  30.46 
 
 		 211 aa  64.7  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.343145 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25370  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  31.09 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.555955 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0899  conserved hypothetical protein, putative hydrolase (metallo-beta-lactamase family)  25.81 
 
 		 199 aa  64.7  0.000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.585968  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3014  beta-lactamase domain protein  27.07 
 
 		 213 aa  64.7  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.309827  normal  0.0865031 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2186  beta-lactamase domain protein  28.19 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.704345 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  25.91 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  28.09 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1603  beta-lactamase domain-containing protein  24.62 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0599073  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1637  beta-lactamase domain-containing protein  24.62 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.084203  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2512  beta-lactamase domain protein  29.61 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.738891  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  26.98 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  28.25 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>