More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3936 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3936  putative hydrolase  100 
 
 		 211 aa  418  1e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2397  putative hydrolase  62.25 
 
 		 210 aa  250  1e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.322158 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0656  beta-lactamase domain protein  61.27 
 
 		 208 aa  245  3e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18790  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  57.97 
 
 		 208 aa  244  4.9999999999999997e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.659057 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1402  beta-lactamase domain-containing protein  61.31 
 
 		 204 aa  240  1e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.147744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2453  beta-lactamase domain protein  61.46 
 
 		 207 aa  231  4.0000000000000004e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000197435  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3381  beta-lactamase-like protein  54.76 
 
 		 210 aa  228  4e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.302529  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3443  beta-lactamase domain-containing protein  54.76 
 
 		 210 aa  228  4e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3392  beta-lactamase domain-containing protein  54.76 
 
 		 210 aa  228  4e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.302908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1330  beta-lactamase domain-containing protein  57.84 
 
 		 205 aa  226  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.422414 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10570  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  54.21 
 
 		 218 aa  225  4e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.193193  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3768  beta-lactamase domain protein  55.78 
 
 		 209 aa  223  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0366381  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1448  beta-lactamase-like  55.56 
 
 		 216 aa  223  2e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65636  normal  0.0425697 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3768  beta-lactamase domain-containing protein  55.12 
 
 		 209 aa  221  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.905496 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2765  beta-lactamase domain-containing protein  55.12 
 
 		 209 aa  221  6e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.268698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5067  beta-lactamase domain-containing protein  53.88 
 
 		 215 aa  216  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.512117  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3722  beta-lactamase domain-containing protein  52.79 
 
 		 206 aa  213  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0909  beta-lactamase domain protein  54.55 
 
 		 213 aa  212  2.9999999999999995e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0324643  normal  0.0194681 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12288  hypothetical protein  50.96 
 
 		 211 aa  209  2e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2903  beta-lactamase domain protein  56.54 
 
 		 202 aa  207  7e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15320  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  57.22 
 
 		 204 aa  205  4e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2551  putative hydrolase  59.79 
 
 		 209 aa  204  7e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.505017  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4760  beta-lactamase domain protein  55.5 
 
 		 202 aa  204  9e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2886  beta-lactamase domain protein  57.07 
 
 		 220 aa  202  2e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0093  beta-lactamase domain protein  50 
 
 		 210 aa  203  2e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3471  beta-lactamase domain protein  50.25 
 
 		 206 aa  202  3e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03750  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  50 
 
 		 228 aa  202  4e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0915981 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3650  beta-lactamase domain-containing protein  55.44 
 
 		 207 aa  197  7.999999999999999e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.335819  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4164  beta-lactamase domain protein  54.97 
 
 		 205 aa  195  5.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420537  normal  0.04389 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0409  beta-lactamase domain protein  49.27 
 
 		 208 aa  194  6e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.494171  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21860  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  50.81 
 
 		 574 aa  188  5e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2999  beta-lactamase domain-containing protein  44.55 
 
 		 235 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.658581 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1196  beta-lactamase domain protein  38.84 
 
 		 235 aa  154  8e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.269825  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8397  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  42.08 
 
 		 238 aa  151  5.9999999999999996e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.376935 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0512  Zn-dependent hydrolase  36.63 
 
 		 275 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.146741  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3834  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase  38.65 
 
 		 339 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.537571 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2687  beta-lactamase domain protein  44.44 
 
 		 195 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0479  beta-lactamase domain protein  33.51 
 
 		 212 aa  119  3e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  38.46 
 
 		 211 aa  117  9e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  37.77 
 
 		 205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0705  beta-lactamase domain protein  38.86 
 
 		 201 aa  112  5e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  37.23 
 
 		 210 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0673  beta-lactamase domain-containing protein  40.33 
 
 		 206 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.20621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6047  hydroxyacylglutathione hydrolase W  35.85 
 
 		 213 aa  109  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0800591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  36.81 
 
 		 212 aa  107  1e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0521  beta-lactamase domain protein  38.1 
 
 		 258 aa  106  2e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000535463  hitchhiker  0.000000708931 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  37.1 
 
 		 209 aa  106  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  35.26 
 
 		 251 aa  105  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  35.75 
 
 		 209 aa  106  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2036  beta-lactamase domain protein  37.24 
 
 		 221 aa  105  5e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  37.95 
 
 		 213 aa  105  7e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  33.16 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25370  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  37.23 
 
 		 207 aa  103  3e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.555955 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0711  beta-lactamase domain-containing protein  36.02 
 
 		 217 aa  102  3e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0549  beta-lactamase domain-containing protein  35.23 
 
 		 216 aa  102  3e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141512  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  36.36 
 
 		 207 aa  103  3e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12170  beta-lactamase domain protein  32.14 
 
 		 210 aa  102  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000265397  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2000  beta-lactamase domain-containing protein  32.72 
 
 		 214 aa  102  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.506851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  35.75 
 
 		 214 aa  102  5e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  36.46 
 
 		 215 aa  102  5e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_691  metallo-beta-lactamase  35.48 
 
 		 217 aa  102  6e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.664332  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3707  beta-lactamase domain-containing protein  38.66 
 
 		 209 aa  101  8e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  35.14 
 
 		 206 aa  101  9e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1817  beta-lactamase domain protein  32.58 
 
 		 208 aa  101  1e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000015217  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  35.29 
 
 		 209 aa  100  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1108  beta-lactamase domain-containing protein  34.97 
 
 		 218 aa  100  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.789331  normal  0.46822 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21890  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  36.32 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0120239 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25780  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  37.06 
 
 		 225 aa  100  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3134  beta-lactamase domain-containing protein  33.79 
 
 		 216 aa  100  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275883  normal  0.0207681 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  34.92 
 
 		 210 aa  100  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0785  metallo-beta-lactamase family protein  35.6 
 
 		 205 aa  99.8  3e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.721139  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0028  beta-lactamase domain-containing protein  38.67 
 
 		 220 aa  99.4  3e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0137537  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0635  beta-lactamase domain-containing protein  36.32 
 
 		 204 aa  99  4e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.320984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0443  beta-lactamase domain protein  29.9 
 
 		 208 aa  98.6  7e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  35.87 
 
 		 210 aa  97.8  9e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1949  beta-lactamase domain protein  31.96 
 
 		 208 aa  97.8  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3296  putative hydrolase  35.81 
 
 		 229 aa  97.4  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0539  beta-lactamase domain-containing protein  37.36 
 
 		 205 aa  97.8  1e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4375  metallo-beta-lactamase family protein  30.41 
 
 		 209 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  34.59 
 
 		 208 aa  97.1  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0859  metallo-beta-lactamase family protein  30.41 
 
 		 209 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1630  beta-lactamase-like  35.59 
 
 		 232 aa  96.3  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2261  beta-lactamase-like protein  33.33 
 
 		 219 aa  96.3  3e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5486  beta-lactamase domain protein  37.56 
 
 		 225 aa  95.9  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000686385  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  34.78 
 
 		 205 aa  95.9  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4114  beta-lactamase domain-containing protein  29.9 
 
 		 209 aa  95.5  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1949  beta-lactamase domain protein  33.85 
 
 		 198 aa  95.5  5e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.857141  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1731  beta-lactamase domain protein  33.68 
 
 		 208 aa  95.5  6e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00010066  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2186  beta-lactamase domain protein  37.7 
 
 		 210 aa  95.5  6e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.704345 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  35.33 
 
 		 209 aa  95.1  7e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4281  metallo-beta-lactamase family protein  30.41 
 
 		 209 aa  95.1  7e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3171  beta-lactamase domain protein  38.02 
 
 		 211 aa  94.7  9e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.343145 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2423  beta-lactamase domain protein  37.14 
 
 		 204 aa  94.7  9e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00931  predicted metal-binding enzyme  35.26 
 
 		 215 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  35.26 
 
 		 215 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  36.02 
 
 		 209 aa  94.4  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2375  beta-lactamase domain protein  32.46 
 
 		 210 aa  94.7  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2269  beta-lactamase domain-containing protein  36.73 
 
 		 214 aa  94.4  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.289735 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  35.26 
 
 		 215 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  34.87 
 
 		 207 aa  94.7  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>