More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2036 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2036  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 221 aa  439  9.999999999999999e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3296  putative hydrolase  64.55 
 
 		 229 aa  265  4e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2189  beta-lactamase domain protein  64.55 
 
 		 221 aa  264  7e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000613341  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1630  beta-lactamase-like  61.09 
 
 		 232 aa  255  5e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6047  hydroxyacylglutathione hydrolase W  61.01 
 
 		 213 aa  253  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0800591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1108  beta-lactamase domain-containing protein  61.93 
 
 		 218 aa  253  1.0000000000000001e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.789331  normal  0.46822 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2056  beta-lactamase domain-containing protein  61.29 
 
 		 222 aa  251  6e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.193314  normal  0.542159 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2000  beta-lactamase domain-containing protein  58.72 
 
 		 214 aa  250  1e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.506851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5486  beta-lactamase domain protein  60.91 
 
 		 225 aa  246  3e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000686385  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3134  beta-lactamase domain-containing protein  58.33 
 
 		 216 aa  243  9.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275883  normal  0.0207681 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25780  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  59.19 
 
 		 225 aa  243  1.9999999999999999e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2995  beta-lactamase domain protein  55.11 
 
 		 224 aa  242  3e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00127096  decreased coverage  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2125  putative hydrolase  62.75 
 
 		 203 aa  239  2e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3342  beta-lactamase domain-containing protein  59.63 
 
 		 217 aa  235  4e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.349184  hitchhiker  0.000156681 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3114  beta-lactamase domain-containing protein  57.8 
 
 		 217 aa  229  2e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2522  beta-lactamase domain-containing protein  55.07 
 
 		 230 aa  228  5e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.344384  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5619  beta-lactamase domain protein  53.46 
 
 		 218 aa  214  5.9999999999999996e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0608479  normal  0.170178 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11653  hypothetical protein  55 
 
 		 264 aa  208  7e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.908461 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3004  beta-lactamase domain-containing protein  51.36 
 
 		 225 aa  205  4e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.057062 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3498  beta-lactamase domain protein  53.05 
 
 		 216 aa  205  5e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0919016 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2989  beta-lactamase-like protein  51.36 
 
 		 225 aa  203  1e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3033  beta-lactamase domain-containing protein  51.36 
 
 		 225 aa  203  1e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15140  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  51.26 
 
 		 237 aa  200  9.999999999999999e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.360479  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3771  beta-lactamase domain-containing protein  50.23 
 
 		 216 aa  196  3e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2854  beta-lactamase domain protein  47.51 
 
 		 226 aa  196  3e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0696867  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3549  beta-lactamase domain-containing protein  51.36 
 
 		 225 aa  194  7e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.744565  normal  0.256716 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3340  beta-lactamase domain-containing protein  49.55 
 
 		 225 aa  191  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.154999  normal  0.696965 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20140  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  47.3 
 
 		 231 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.428747 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0760  beta-lactamase domain protein  53.3 
 
 		 205 aa  183  2.0000000000000003e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.118646  normal  0.0112974 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2423  beta-lactamase domain protein  50.5 
 
 		 204 aa  176  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03910  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  43.46 
 
 		 214 aa  164  1.0000000000000001e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0662663 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11270  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  47.93 
 
 		 226 aa  158  5e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.203901  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1951  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  46.64 
 
 		 238 aa  158  5e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5618  beta-lactamase domain protein  42.72 
 
 		 202 aa  127  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.541776  normal  0.23712 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2687  beta-lactamase domain protein  33.66 
 
 		 195 aa  123  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0705  beta-lactamase domain protein  34.29 
 
 		 201 aa  122  4e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0093  beta-lactamase domain protein  37.82 
 
 		 210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2397  putative hydrolase  38.14 
 
 		 210 aa  113  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.322158 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  35.27 
 
 		 207 aa  108  5e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  31.43 
 
 		 201 aa  108  8.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1330  beta-lactamase domain-containing protein  37.56 
 
 		 205 aa  106  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.422414 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21890  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  33.82 
 
 		 229 aa  106  4e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0120239 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0409  beta-lactamase domain protein  35.57 
 
 		 208 aa  103  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.494171  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3936  putative hydrolase  37.24 
 
 		 211 aa  102  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0656  beta-lactamase domain protein  36.6 
 
 		 208 aa  102  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3392  beta-lactamase domain-containing protein  36.92 
 
 		 210 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.302908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12288  hypothetical protein  37.76 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3381  beta-lactamase-like protein  36.92 
 
 		 210 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.302529  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3443  beta-lactamase domain-containing protein  36.92 
 
 		 210 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3768  beta-lactamase domain-containing protein  35.75 
 
 		 209 aa  100  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.905496 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10570  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  33.5 
 
 		 218 aa  99.8  3e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.193193  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3768  beta-lactamase domain protein  36.6 
 
 		 209 aa  99  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0366381  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  31.73 
 
 		 205 aa  98.6  6e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2765  beta-lactamase domain-containing protein  35.75 
 
 		 209 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.268698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  29.67 
 
 		 207 aa  97.8  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  31.55 
 
 		 210 aa  97.4  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18790  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  34.34 
 
 		 208 aa  97.1  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.659057 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2453  beta-lactamase domain protein  37.44 
 
 		 207 aa  97.1  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000197435  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0909  beta-lactamase domain protein  35.35 
 
 		 213 aa  96.7  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0324643  normal  0.0194681 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  35.48 
 
 		 213 aa  95.9  5e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  33.5 
 
 		 211 aa  94.4  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4164  beta-lactamase domain protein  34.74 
 
 		 205 aa  93.6  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420537  normal  0.04389 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3484  beta-lactamase-like protein  36 
 
 		 248 aa  93.6  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3706  beta-lactamase domain-containing protein  29.59 
 
 		 201 aa  94  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000121895  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  30.1 
 
 		 205 aa  93.2  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15320  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  36.08 
 
 		 204 aa  92.8  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1819  beta-lactamase domain-containing protein  33.85 
 
 		 204 aa  92  6e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0368429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3655  beta-lactamase domain-containing protein  34.29 
 
 		 211 aa  91.3  9e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.658752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  36.24 
 
 		 217 aa  91.3  9e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  30.58 
 
 		 206 aa  89.4  4e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3650  beta-lactamase domain-containing protein  34.78 
 
 		 207 aa  89.4  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.335819  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0028  beta-lactamase domain-containing protein  35.71 
 
 		 220 aa  89  5e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0137537  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3722  beta-lactamase domain-containing protein  33.86 
 
 		 206 aa  89  5e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  30.92 
 
 		 213 aa  88.6  7e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3479  Beta-lactamase-like  35.62 
 
 		 218 aa  88.2  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  28.64 
 
 		 210 aa  87.8  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03750  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  32.64 
 
 		 228 aa  87.4  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0915981 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0711  beta-lactamase domain-containing protein  30.69 
 
 		 217 aa  86.7  3e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1448  beta-lactamase-like  33.85 
 
 		 216 aa  86.7  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65636  normal  0.0425697 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3563  beta-lactamase domain protein  35.62 
 
 		 218 aa  86.7  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2738  beta-lactamase domain-containing protein  35.52 
 
 		 205 aa  85.1  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  27.88 
 
 		 251 aa  85.1  8e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1339  beta-lactamase-like protein  33.86 
 
 		 192 aa  85.1  8e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2903  beta-lactamase domain protein  37.43 
 
 		 202 aa  85.1  8e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  30.23 
 
 		 209 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3334  Beta-lactamase-like  35.15 
 
 		 245 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.973711  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5067  beta-lactamase domain-containing protein  31.41 
 
 		 215 aa  84.3  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.512117  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3707  beta-lactamase domain-containing protein  30.85 
 
 		 209 aa  84.3  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1728  beta-lactamase domain-containing protein  31.53 
 
 		 215 aa  84.3  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0890  glyoxylase II family protein  29.81 
 
 		 218 aa  83.6  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000389063  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0321  beta-lactamase domain-containing protein  28.79 
 
 		 202 aa  83.6  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1402  beta-lactamase domain-containing protein  34.9 
 
 		 204 aa  84  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.147744  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0785  metallo-beta-lactamase family protein  30.2 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.721139  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04020  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  30.59 
 
 		 222 aa  83.2  0.000000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.626574 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21860  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  33.15 
 
 		 574 aa  82.8  0.000000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4110  Hydroxyacylglutathione hydrolase  32.83 
 
 		 226 aa  82.4  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119244  normal  0.0132289 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  32.21 
 
 		 214 aa  82.4  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1732  beta-lactamase domain-containing protein  32 
 
 		 214 aa  82  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37479  normal  0.0747191 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0673  beta-lactamase domain-containing protein  34.85 
 
 		 206 aa  82  0.000000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.20621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25370  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  29.11 
 
 		 207 aa  81.6  0.000000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.555955 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>