More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3342 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3342  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 217 aa  437  9.999999999999999e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.349184  hitchhiker  0.000156681 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3114  beta-lactamase domain-containing protein  91.24 
 
 		 217 aa  404  1.0000000000000001e-112  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2189  beta-lactamase domain protein  70.14 
 
 		 221 aa  291  5e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000613341  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6047  hydroxyacylglutathione hydrolase W  66.06 
 
 		 213 aa  284  5.999999999999999e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0800591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3134  beta-lactamase domain-containing protein  62.67 
 
 		 216 aa  273  1.0000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275883  normal  0.0207681 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2000  beta-lactamase domain-containing protein  63.3 
 
 		 214 aa  273  1.0000000000000001e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.506851  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3296  putative hydrolase  64.68 
 
 		 229 aa  271  7e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2056  beta-lactamase domain-containing protein  63.43 
 
 		 222 aa  270  9e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.193314  normal  0.542159 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2125  putative hydrolase  66.67 
 
 		 203 aa  269  2e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5619  beta-lactamase domain protein  62.96 
 
 		 218 aa  265  5e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0608479  normal  0.170178 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1630  beta-lactamase-like  62.5 
 
 		 232 aa  261  6e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25780  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  62.73 
 
 		 225 aa  261  6e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2995  beta-lactamase domain protein  60.91 
 
 		 224 aa  260  1e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00127096  decreased coverage  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5486  beta-lactamase domain protein  62.73 
 
 		 225 aa  258  6e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000686385  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1108  beta-lactamase domain-containing protein  61.01 
 
 		 218 aa  256  1e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.789331  normal  0.46822 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2522  beta-lactamase domain-containing protein  61.61 
 
 		 230 aa  254  7e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.344384  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15140  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  59.48 
 
 		 237 aa  239  2e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.360479  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2036  beta-lactamase domain protein  59.63 
 
 		 221 aa  235  4e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2854  beta-lactamase domain protein  54.79 
 
 		 226 aa  223  2e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0696867  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20140  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  51.95 
 
 		 231 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.428747 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3549  beta-lactamase domain-containing protein  57.01 
 
 		 225 aa  219  3e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.744565  normal  0.256716 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3340  beta-lactamase domain-containing protein  56.11 
 
 		 225 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.154999  normal  0.696965 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3498  beta-lactamase domain protein  51.89 
 
 		 216 aa  215  4e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0919016 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3771  beta-lactamase domain-containing protein  51.89 
 
 		 216 aa  214  7e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0760  beta-lactamase domain protein  58.76 
 
 		 205 aa  209  3e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.118646  normal  0.0112974 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2989  beta-lactamase-like protein  54.09 
 
 		 225 aa  209  3e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3033  beta-lactamase domain-containing protein  54.09 
 
 		 225 aa  209  3e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3004  beta-lactamase domain-containing protein  53.64 
 
 		 225 aa  207  9e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.057062 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1951  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  55.56 
 
 		 238 aa  207  1e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11653  hypothetical protein  55.45 
 
 		 264 aa  203  2e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.908461 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2423  beta-lactamase domain protein  50.5 
 
 		 204 aa  173  1.9999999999999998e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5618  beta-lactamase domain protein  47.62 
 
 		 202 aa  160  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.541776  normal  0.23712 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11270  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  47.25 
 
 		 226 aa  159  3e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.203901  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03910  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  46.51 
 
 		 214 aa  157  1e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0662663 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2687  beta-lactamase domain protein  40.4 
 
 		 195 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0705  beta-lactamase domain protein  35.58 
 
 		 201 aa  125  4.0000000000000003e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  36.36 
 
 		 205 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  33.95 
 
 		 210 aa  111  7.000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3479  Beta-lactamase-like  39.23 
 
 		 218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3563  beta-lactamase domain protein  39.23 
 
 		 218 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  39.44 
 
 		 213 aa  109  4.0000000000000004e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  34.93 
 
 		 209 aa  107  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  37.26 
 
 		 207 aa  107  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  36.84 
 
 		 211 aa  105  5e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  33.95 
 
 		 214 aa  103  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4110  Hydroxyacylglutathione hydrolase  36.32 
 
 		 226 aa  102  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119244  normal  0.0132289 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3631  beta-lactamase domain protein  38.28 
 
 		 218 aa  102  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  34.34 
 
 		 209 aa  102  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21890  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  34.95 
 
 		 229 aa  102  5e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0120239 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  31.28 
 
 		 207 aa  101  7e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  34.85 
 
 		 208 aa  100  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  34.63 
 
 		 251 aa  100  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0656  beta-lactamase domain protein  35.75 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  37.02 
 
 		 217 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  31.92 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0409  beta-lactamase domain protein  36.13 
 
 		 208 aa  99  5e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.494171  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2397  putative hydrolase  34.72 
 
 		 210 aa  98.6  6e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.322158 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  31.78 
 
 		 205 aa  98.6  7e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0093  beta-lactamase domain protein  34.55 
 
 		 210 aa  98.2  8e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1330  beta-lactamase domain-containing protein  34.03 
 
 		 205 aa  97.4  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.422414 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  33.96 
 
 		 210 aa  97.4  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  32.37 
 
 		 213 aa  95.1  6e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1732  beta-lactamase domain-containing protein  33.67 
 
 		 214 aa  95.5  6e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37479  normal  0.0747191 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03750  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  35.42 
 
 		 228 aa  95.1  7e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0915981 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  29.25 
 
 		 206 aa  94.4  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3655  beta-lactamase domain-containing protein  34.6 
 
 		 211 aa  92.8  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.658752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1030  hydroxyacylglutathione hydrolase  34.83 
 
 		 215 aa  93.2  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  hitchhiker  0.00661846 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1112  hydroxyacylglutathione hydrolase  34.83 
 
 		 215 aa  93.2  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0394  putative metallo-beta-lactamase family protein  33.5 
 
 		 215 aa  93.2  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1003  hydroxyacylglutathione hydrolase  34.83 
 
 		 215 aa  93.2  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105674  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1095  hydroxyacylglutathione hydrolase  34.83 
 
 		 215 aa  93.2  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1062  hydroxyacylglutathione hydrolase  34.83 
 
 		 215 aa  93.2  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4164  beta-lactamase domain protein  34.04 
 
 		 205 aa  93.2  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420537  normal  0.04389 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  30.73 
 
 		 201 aa  92.4  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0479  beta-lactamase domain protein  28.17 
 
 		 212 aa  92.4  5e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12288  hypothetical protein  33.85 
 
 		 211 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0909  beta-lactamase domain protein  33.84 
 
 		 213 aa  90.1  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0324643  normal  0.0194681 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12170  beta-lactamase domain protein  32.02 
 
 		 210 aa  90.5  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000265397  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1975  metallo-beta-lactamase superfamily protein  33.49 
 
 		 215 aa  90.1  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0642346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2561  metallo-beta-lactamase family protein  33.49 
 
 		 215 aa  89.7  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000219407  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2652  beta-lactamase domain-containing protein  33.49 
 
 		 215 aa  89.7  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0560187  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3484  beta-lactamase-like protein  37.16 
 
 		 248 aa  89.7  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3707  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 209 aa  89.7  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0673  beta-lactamase domain-containing protein  34.83 
 
 		 206 aa  89.7  3e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.20621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3413  beta-lactamase domain protein  30.48 
 
 		 209 aa  89.4  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  31.03 
 
 		 205 aa  88.6  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3014  beta-lactamase domain protein  33.97 
 
 		 213 aa  88.6  7e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.309827  normal  0.0865031 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0841  Beta-lactamase-like  31.02 
 
 		 213 aa  88.2  8e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0225813 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2261  beta-lactamase-like protein  33.33 
 
 		 219 aa  88.2  8e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3768  beta-lactamase domain protein  32.29 
 
 		 209 aa  88.2  8e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0366381  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2391  metallo-beta-lactamase family protein  33.33 
 
 		 215 aa  87.8  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0028  beta-lactamase domain-containing protein  32.72 
 
 		 220 aa  87.8  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0137537  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1819  beta-lactamase domain-containing protein  34.03 
 
 		 204 aa  87.4  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0368429  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10570  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  32.5 
 
 		 218 aa  87.4  2e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.193193  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 215 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  33.33 
 
 		 215 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  33.33 
 
 		 215 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 215 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3650  beta-lactamase domain-containing protein  33.68 
 
 		 207 aa  86.3  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.335819  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1782  beta-lactamase domain protein  33.98 
 
 		 215 aa  86.3  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00356762  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>