More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3340 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_3340  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
225 aa  451  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.154999  normal  0.696965 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3549  beta-lactamase domain-containing protein  90.67 
 
 
225 aa  417  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.744565  normal  0.256716 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2989  beta-lactamase-like protein  80.89 
 
 
225 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3004  beta-lactamase domain-containing protein  80.44 
 
 
225 aa  368  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.057062 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3033  beta-lactamase domain-containing protein  80.89 
 
 
225 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11653  hypothetical protein  75.56 
 
 
264 aa  330  1e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.908461 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2854  beta-lactamase domain protein  62.95 
 
 
226 aa  275  6e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0696867  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25780  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  59.65 
 
 
225 aa  248  6e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2125  putative hydrolase  59.71 
 
 
203 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5486  beta-lactamase domain protein  57.46 
 
 
225 aa  239  2.9999999999999997e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000686385  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3296  putative hydrolase  57.28 
 
 
229 aa  227  1e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2189  beta-lactamase domain protein  56.73 
 
 
221 aa  221  6e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000613341  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2000  beta-lactamase domain-containing protein  56.52 
 
 
214 aa  216  2e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.506851  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3342  beta-lactamase domain-containing protein  56.11 
 
 
217 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.349184  hitchhiker  0.000156681 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2995  beta-lactamase domain protein  54.95 
 
 
224 aa  211  5.999999999999999e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00127096  decreased coverage  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6047  hydroxyacylglutathione hydrolase W  55 
 
 
213 aa  211  7e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0800591  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3114  beta-lactamase domain-containing protein  54.55 
 
 
217 aa  208  5e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20140  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  55.5 
 
 
231 aa  207  9e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.428747 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2423  beta-lactamase domain protein  55 
 
 
204 aa  204  7e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5619  beta-lactamase domain protein  52.49 
 
 
218 aa  204  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0608479  normal  0.170178 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1951  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  56.54 
 
 
238 aa  202  3e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1630  beta-lactamase-like  51.58 
 
 
232 aa  200  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2056  beta-lactamase domain-containing protein  52.04 
 
 
222 aa  199  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.193314  normal  0.542159 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1108  beta-lactamase domain-containing protein  52.17 
 
 
218 aa  198  6e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.789331  normal  0.46822 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15140  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  55.83 
 
 
237 aa  197  1.0000000000000001e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.360479  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3771  beta-lactamase domain-containing protein  52.66 
 
 
216 aa  196  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0760  beta-lactamase domain protein  57.29 
 
 
205 aa  194  9e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.118646  normal  0.0112974 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3498  beta-lactamase domain protein  50.24 
 
 
216 aa  194  1e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0919016 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2036  beta-lactamase domain protein  49.55 
 
 
221 aa  191  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3134  beta-lactamase domain-containing protein  50 
 
 
216 aa  189  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275883  normal  0.0207681 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2522  beta-lactamase domain-containing protein  50.66 
 
 
230 aa  187  1e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.344384  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11270  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  50 
 
 
226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.203901  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03910  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  49.06 
 
 
214 aa  171  7.999999999999999e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0662663 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2687  beta-lactamase domain protein  42.51 
 
 
195 aa  154  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  37.56 
 
 
211 aa  122  6e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21890  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  35.92 
 
 
229 aa  112  6e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0120239 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5618  beta-lactamase domain protein  41.67 
 
 
202 aa  111  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.541776  normal  0.23712 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  36.62 
 
 
217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  32.21 
 
 
205 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0705  beta-lactamase domain protein  34.67 
 
 
201 aa  105  5e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  31.53 
 
 
210 aa  103  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3479  Beta-lactamase-like  35.68 
 
 
218 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0394  putative metallo-beta-lactamase family protein  34.27 
 
 
215 aa  103  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  32.68 
 
 
207 aa  103  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  35.15 
 
 
207 aa  103  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  32.02 
 
 
201 aa  103  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  33 
 
 
205 aa  101  8e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3563  beta-lactamase domain protein  35.21 
 
 
218 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  33.17 
 
 
209 aa  100  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03750  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  34.36 
 
 
228 aa  99.8  3e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0915981 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5335  beta-lactamase domain-containing protein  35.98 
 
 
213 aa  99.4  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.311932  normal  0.0822687 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1732  beta-lactamase domain-containing protein  35.2 
 
 
214 aa  99.4  4e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37479  normal  0.0747191 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2397  putative hydrolase  37.76 
 
 
210 aa  99  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.322158 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0656  beta-lactamase domain protein  36.73 
 
 
208 aa  99  5e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  33.83 
 
 
213 aa  98.6  7e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3631  beta-lactamase domain protein  35.21 
 
 
218 aa  98.6  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  34.43 
 
 
213 aa  97.8  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5856  beta-lactamase domain protein  34.12 
 
 
213 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.518272  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10570  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  34.33 
 
 
218 aa  96.7  2e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.193193  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1330  beta-lactamase domain-containing protein  35.86 
 
 
205 aa  97.1  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.422414 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  30.24 
 
 
207 aa  95.5  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  30.73 
 
 
206 aa  95.5  6e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3014  beta-lactamase domain protein  33.5 
 
 
213 aa  95.5  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.309827  normal  0.0865031 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  31.53 
 
 
210 aa  95.5  6e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3768  beta-lactamase domain protein  35.18 
 
 
209 aa  95.1  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0366381  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1819  beta-lactamase domain-containing protein  37.1 
 
 
204 aa  95.1  8e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0368429  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3235  metallo-beta-lactamase family protein  29.86 
 
 
213 aa  95.1  8e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  32.35 
 
 
208 aa  94.7  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  31.5 
 
 
209 aa  94.4  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0228  beta-lactamase domain-containing protein  34.6 
 
 
212 aa  94.7  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1975  metallo-beta-lactamase superfamily protein  30.05 
 
 
215 aa  93.2  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0642346  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0334  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
212 aa  93.2  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00931  predicted metal-binding enzyme  31.55 
 
 
215 aa  92.8  4e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  31.55 
 
 
215 aa  92.8  4e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2561  metallo-beta-lactamase family protein  30.05 
 
 
215 aa  92.8  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000219407  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2652  beta-lactamase domain-containing protein  30.05 
 
 
215 aa  92.8  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0560187  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4760  beta-lactamase domain protein  38.92 
 
 
202 aa  92.8  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  31.55 
 
 
215 aa  92.8  4e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2391  metallo-beta-lactamase family protein  31.07 
 
 
215 aa  92  6e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  31.55 
 
 
215 aa  92  6e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1088  metallo-beta-lactamase family protein  31.55 
 
 
215 aa  92  7e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153658  normal  0.346644 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  31.68 
 
 
209 aa  91.7  8e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  31.55 
 
 
215 aa  91.7  9e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  31.55 
 
 
215 aa  91.7  9e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3722  beta-lactamase domain-containing protein  33.51 
 
 
206 aa  91.7  9e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5067  beta-lactamase domain-containing protein  35.2 
 
 
215 aa  91.7  9e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.512117  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  31.55 
 
 
215 aa  91.7  9e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1755  beta-lactamase domain-containing protein  30.14 
 
 
235 aa  90.9  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.622383  normal  0.422321 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12288  hypothetical protein  36.04 
 
 
211 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2370  beta-lactamase-like  29.67 
 
 
245 aa  90.5  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0317  beta-lactamase domain-containing protein  32.86 
 
 
214 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.605621  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1112  hydroxyacylglutathione hydrolase  31.71 
 
 
215 aa  89.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347617  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0220  beta-lactamase domain protein  32.42 
 
 
212 aa  89.7  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1095  hydroxyacylglutathione hydrolase  31.71 
 
 
215 aa  89.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1030  hydroxyacylglutathione hydrolase  31.71 
 
 
215 aa  89.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  hitchhiker  0.00661846 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1003  hydroxyacylglutathione hydrolase  31.71 
 
 
215 aa  89.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105674  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1062  hydroxyacylglutathione hydrolase  31.71 
 
 
215 aa  89.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0841  Beta-lactamase-like  31.22 
 
 
213 aa  89.7  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0225813 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3076  metallo-beta-lactamase family protein  35.38 
 
 
207 aa  89.4  4e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000251801  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  32.34 
 
 
205 aa  89.4  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>