More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3498 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3498  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
216 aa  437  9.999999999999999e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0919016 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3771  beta-lactamase domain-containing protein  82.87 
 
 
216 aa  364  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11270  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  63.18 
 
 
226 aa  254  6e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.203901  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20140  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  55.61 
 
 
231 aa  236  2e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.428747 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0760  beta-lactamase domain protein  55.77 
 
 
205 aa  218  6e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.118646  normal  0.0112974 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3342  beta-lactamase domain-containing protein  51.89 
 
 
217 aa  215  4e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.349184  hitchhiker  0.000156681 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5619  beta-lactamase domain protein  52.86 
 
 
218 aa  211  7e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0608479  normal  0.170178 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3114  beta-lactamase domain-containing protein  50.94 
 
 
217 aa  211  7.999999999999999e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15140  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  59.45 
 
 
237 aa  208  6e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.360479  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2995  beta-lactamase domain protein  52.38 
 
 
224 aa  206  2e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00127096  decreased coverage  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6047  hydroxyacylglutathione hydrolase W  51.89 
 
 
213 aa  205  5e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0800591  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25780  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  52.15 
 
 
225 aa  205  5e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2036  beta-lactamase domain protein  53.05 
 
 
221 aa  205  5e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3296  putative hydrolase  52.83 
 
 
229 aa  201  5e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5486  beta-lactamase domain protein  51.67 
 
 
225 aa  201  8e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000686385  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2189  beta-lactamase domain protein  50.7 
 
 
221 aa  200  9.999999999999999e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000613341  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2000  beta-lactamase domain-containing protein  51.43 
 
 
214 aa  200  9.999999999999999e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.506851  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2989  beta-lactamase-like protein  52.61 
 
 
225 aa  200  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3033  beta-lactamase domain-containing protein  52.61 
 
 
225 aa  200  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3004  beta-lactamase domain-containing protein  52.13 
 
 
225 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.057062 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3549  beta-lactamase domain-containing protein  51.66 
 
 
225 aa  198  7e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.744565  normal  0.256716 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1630  beta-lactamase-like  49.05 
 
 
232 aa  196  3e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1108  beta-lactamase domain-containing protein  49.52 
 
 
218 aa  195  4.0000000000000005e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.789331  normal  0.46822 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2056  beta-lactamase domain-containing protein  48.57 
 
 
222 aa  194  6e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.193314  normal  0.542159 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3340  beta-lactamase domain-containing protein  50.24 
 
 
225 aa  194  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.154999  normal  0.696965 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2854  beta-lactamase domain protein  51.67 
 
 
226 aa  191  8e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0696867  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2125  putative hydrolase  49.53 
 
 
203 aa  190  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3134  beta-lactamase domain-containing protein  48.58 
 
 
216 aa  189  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275883  normal  0.0207681 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03910  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  49.54 
 
 
214 aa  188  5e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0662663 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11653  hypothetical protein  52.13 
 
 
264 aa  186  3e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.908461 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2522  beta-lactamase domain-containing protein  47.93 
 
 
230 aa  185  5e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.344384  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1951  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  50.69 
 
 
238 aa  175  6e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2423  beta-lactamase domain protein  47.83 
 
 
204 aa  171  1e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2687  beta-lactamase domain protein  39.71 
 
 
195 aa  150  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5618  beta-lactamase domain protein  40.8 
 
 
202 aa  109  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.541776  normal  0.23712 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2397  putative hydrolase  35.78 
 
 
210 aa  102  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.322158 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0705  beta-lactamase domain protein  32.86 
 
 
201 aa  101  7e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1330  beta-lactamase domain-containing protein  36.5 
 
 
205 aa  96.3  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.422414 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10570  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  31.8 
 
 
218 aa  95.1  8e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.193193  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0656  beta-lactamase domain protein  35.32 
 
 
208 aa  94.7  9e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0786  metallo-beta-lactamase family protein  32.42 
 
 
208 aa  90.5  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0221878  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  33.8 
 
 
214 aa  89.7  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21860  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  34.55 
 
 
574 aa  89.4  4e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
207 aa  89  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3722  beta-lactamase domain-containing protein  35.2 
 
 
206 aa  88.6  6e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3655  beta-lactamase domain-containing protein  33.94 
 
 
211 aa  87.8  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.658752  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12288  hypothetical protein  34.29 
 
 
211 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0409  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 
208 aa  87  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.494171  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  28.77 
 
 
205 aa  86.7  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3768  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 
209 aa  86.7  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0366381  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  30.33 
 
 
201 aa  86.3  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18790  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  32.2 
 
 
208 aa  85.9  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.659057 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  33.18 
 
 
211 aa  85.5  5e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0909  beta-lactamase domain protein  33.97 
 
 
213 aa  85.9  5e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0324643  normal  0.0194681 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21890  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  32.26 
 
 
229 aa  85.1  6e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0120239 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5067  beta-lactamase domain-containing protein  33.99 
 
 
215 aa  85.1  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.512117  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2261  beta-lactamase-like protein  30.26 
 
 
219 aa  85.1  7e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2453  beta-lactamase domain protein  35.64 
 
 
207 aa  84.3  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000197435  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  27.57 
 
 
207 aa  84.3  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03750  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  32.5 
 
 
228 aa  83.2  0.000000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0915981 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  30.37 
 
 
206 aa  82.8  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15320  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  33.67 
 
 
204 aa  82.8  0.000000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0093  beta-lactamase domain protein  33.83 
 
 
210 aa  82  0.000000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3334  Beta-lactamase-like  33.85 
 
 
245 aa  82  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.973711  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  27.27 
 
 
205 aa  81.6  0.000000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3707  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
209 aa  81.6  0.000000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107683  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3936  putative hydrolase  34.48 
 
 
211 aa  81.6  0.000000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1732  beta-lactamase domain-containing protein  29.85 
 
 
214 aa  81.6  0.000000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37479  normal  0.0747191 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  27.49 
 
 
209 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  27.23 
 
 
205 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1902  metallo-beta-lactamase family protein  27.8 
 
 
206 aa  80.5  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1949  beta-lactamase domain protein  28.71 
 
 
198 aa  80.1  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.857141  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  29.72 
 
 
251 aa  79.3  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3381  beta-lactamase-like protein  32.54 
 
 
210 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.302529  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3392  beta-lactamase domain-containing protein  32.54 
 
 
210 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.302908  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3443  beta-lactamase domain-containing protein  32.54 
 
 
210 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2765  beta-lactamase domain-containing protein  32.54 
 
 
209 aa  79.3  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.268698  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  30.52 
 
 
207 aa  79  0.00000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3484  beta-lactamase-like protein  33.16 
 
 
248 aa  79  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0912  beta-lactamase domain protein  30.41 
 
 
200 aa  79  0.00000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.330922  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  28.91 
 
 
210 aa  79  0.00000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2191  metallo-beta-lactamase family protein  27.32 
 
 
206 aa  78.6  0.00000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3768  beta-lactamase domain-containing protein  31.58 
 
 
209 aa  78.2  0.00000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.905496 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3471  beta-lactamase domain protein  32.47 
 
 
206 aa  78.2  0.00000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  31.08 
 
 
213 aa  77.8  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0028  beta-lactamase domain-containing protein  32.34 
 
 
220 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0137537  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04020  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  30.41 
 
 
222 aa  77.8  0.0000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.626574 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  26.77 
 
 
210 aa  77.8  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  29.52 
 
 
208 aa  77  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  29.52 
 
 
210 aa  76.3  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4164  beta-lactamase domain protein  32.16 
 
 
205 aa  75.5  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420537  normal  0.04389 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1448  beta-lactamase-like  33.83 
 
 
216 aa  74.7  0.0000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65636  normal  0.0425697 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3014  beta-lactamase domain protein  26.79 
 
 
213 aa  74.7  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1211  beta-lactamase domain protein  29.36 
 
 
211 aa  74.3  0.000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000331215  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  31.25 
 
 
217 aa  74.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1446  beta-lactamase domain-containing protein  28.7 
 
 
215 aa  74.3  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.746343  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1062  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.7 
 
 
215 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1003  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.7 
 
 
215 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105674  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1112  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.7 
 
 
215 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347617  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1030  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.7 
 
 
215 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  hitchhiker  0.00661846 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>