More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0409 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0409  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 208 aa  416  9.999999999999999e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.494171  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0093  beta-lactamase domain protein  68.93 
 
 		 210 aa  302  3.0000000000000004e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1330  beta-lactamase domain-containing protein  62.87 
 
 		 205 aa  274  8e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.422414 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2765  beta-lactamase domain-containing protein  63.55 
 
 		 209 aa  273  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.268698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3768  beta-lactamase domain-containing protein  63.55 
 
 		 209 aa  271  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.905496 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0909  beta-lactamase domain protein  60.09 
 
 		 213 aa  267  7e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0324643  normal  0.0194681 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12288  hypothetical protein  63.77 
 
 		 211 aa  267  1e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0656  beta-lactamase domain protein  63.73 
 
 		 208 aa  267  1e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2397  putative hydrolase  62.14 
 
 		 210 aa  263  1e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.322158 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3381  beta-lactamase-like protein  59.61 
 
 		 210 aa  255  4e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.302529  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3443  beta-lactamase domain-containing protein  59.61 
 
 		 210 aa  255  4e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3392  beta-lactamase domain-containing protein  59.61 
 
 		 210 aa  255  4e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.302908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2453  beta-lactamase domain protein  61.84 
 
 		 207 aa  248  6e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000197435  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03750  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  55.83 
 
 		 228 aa  246  2e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0915981 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18790  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  55.88 
 
 		 208 aa  240  1e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.659057 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3768  beta-lactamase domain protein  55.5 
 
 		 209 aa  239  2.9999999999999997e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0366381  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1402  beta-lactamase domain-containing protein  57.64 
 
 		 204 aa  235  4e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.147744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15320  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  58.62 
 
 		 204 aa  232  4.0000000000000004e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10570  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  54.63 
 
 		 218 aa  231  4.0000000000000004e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.193193  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2903  beta-lactamase domain protein  56.93 
 
 		 202 aa  226  1e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4760  beta-lactamase domain protein  57.87 
 
 		 202 aa  224  9e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4164  beta-lactamase domain protein  54.46 
 
 		 205 aa  222  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420537  normal  0.04389 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3722  beta-lactamase domain-containing protein  53.2 
 
 		 206 aa  218  3e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3650  beta-lactamase domain-containing protein  56.19 
 
 		 207 aa  219  3e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.335819  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3471  beta-lactamase domain protein  51.74 
 
 		 206 aa  216  2e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1448  beta-lactamase-like  54.29 
 
 		 216 aa  215  4e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65636  normal  0.0425697 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5067  beta-lactamase domain-containing protein  54.33 
 
 		 215 aa  212  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.512117  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2886  beta-lactamase domain protein  52.74 
 
 		 220 aa  203  2e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21860  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  51.28 
 
 		 574 aa  200  1.9999999999999998e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3936  putative hydrolase  49.27 
 
 		 211 aa  187  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2999  beta-lactamase domain-containing protein  39.51 
 
 		 235 aa  158  4e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.658581 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1196  beta-lactamase domain protein  36.73 
 
 		 235 aa  144  7.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.269825  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8397  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  39.02 
 
 		 238 aa  143  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.376935 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2687  beta-lactamase domain protein  44.68 
 
 		 195 aa  138  4.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2551  putative hydrolase  41.53 
 
 		 209 aa  135  4e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.505017  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3834  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase  36.63 
 
 		 339 aa  131  6e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.537571 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0512  Zn-dependent hydrolase  33.5 
 
 		 275 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.146741  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6047  hydroxyacylglutathione hydrolase W  37.77 
 
 		 213 aa  112  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0800591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  37.89 
 
 		 208 aa  108  5e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0705  beta-lactamase domain protein  38.5 
 
 		 201 aa  107  1e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2000  beta-lactamase domain-containing protein  37.7 
 
 		 214 aa  107  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.506851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  33.33 
 
 		 211 aa  105  4e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1630  beta-lactamase-like  36.13 
 
 		 232 aa  105  5e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0479  beta-lactamase domain protein  34.02 
 
 		 212 aa  105  5e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1108  beta-lactamase domain-containing protein  34.74 
 
 		 218 aa  104  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.789331  normal  0.46822 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  36.89 
 
 		 217 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2056  beta-lactamase domain-containing protein  35.79 
 
 		 222 aa  103  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.193314  normal  0.542159 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2036  beta-lactamase domain protein  35.57 
 
 		 221 aa  103  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1949  beta-lactamase domain protein  32.31 
 
 		 208 aa  103  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  34.74 
 
 		 251 aa  102  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  34.67 
 
 		 207 aa  102  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3479  Beta-lactamase-like  37.13 
 
 		 218 aa  101  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  33.68 
 
 		 201 aa  101  7e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0549  beta-lactamase domain-containing protein  32.29 
 
 		 216 aa  99.4  3e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141512  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3563  beta-lactamase domain protein  36.63 
 
 		 218 aa  99.8  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21890  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  34.54 
 
 		 229 aa  99.8  3e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0120239 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3342  beta-lactamase domain-containing protein  36.13 
 
 		 217 aa  99  5e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.349184  hitchhiker  0.000156681 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3296  putative hydrolase  36.79 
 
 		 229 aa  98.6  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2423  beta-lactamase domain protein  38.68 
 
 		 204 aa  98.2  8e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  32.02 
 
 		 214 aa  98.2  8e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  35.11 
 
 		 205 aa  97.8  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  35.15 
 
 		 213 aa  97.1  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  34.76 
 
 		 209 aa  97.1  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  35.11 
 
 		 215 aa  96.7  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3134  beta-lactamase domain-containing protein  33.49 
 
 		 216 aa  96.3  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275883  normal  0.0207681 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3114  beta-lactamase domain-containing protein  35.6 
 
 		 217 aa  95.9  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  34.18 
 
 		 209 aa  95.9  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3549  beta-lactamase domain-containing protein  36.41 
 
 		 225 aa  95.5  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.744565  normal  0.256716 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  31.18 
 
 		 212 aa  95.5  5e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2189  beta-lactamase domain protein  34.36 
 
 		 221 aa  95.5  5e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000613341  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  34.38 
 
 		 205 aa  95.1  7e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3631  beta-lactamase domain protein  36.14 
 
 		 218 aa  94.7  8e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  32.51 
 
 		 210 aa  94.7  9e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25780  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  36.22 
 
 		 225 aa  93.2  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4163  metallo-beta-lactamase family protein  29.32 
 
 		 208 aa  93.6  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00575624  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4485  metallo-beta-lactamase family protein  29.32 
 
 		 208 aa  93.6  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.859552  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  36.17 
 
 		 207 aa  92.4  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3651  beta-lactamase domain-containing protein  36.36 
 
 		 215 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  32.65 
 
 		 209 aa  91.7  6e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4003  metallo-beta-lactamase family protein  30.69 
 
 		 209 aa  91.7  7e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4704  Beta-lactamase-like  35.29 
 
 		 214 aa  91.7  7e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551492 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1637  beta-lactamase domain-containing protein  29.53 
 
 		 207 aa  91.7  7e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.084203  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1603  beta-lactamase domain-containing protein  29.53 
 
 		 207 aa  91.7  7e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0599073  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0772  beta-lactamase domain protein  35.79 
 
 		 214 aa  91.7  8e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12170  beta-lactamase domain protein  31.89 
 
 		 210 aa  91.7  8e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000265397  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3171  beta-lactamase domain protein  36.36 
 
 		 211 aa  91.7  8e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.343145 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3004  beta-lactamase domain-containing protein  36.92 
 
 		 225 aa  91.3  9e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.057062 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2375  beta-lactamase domain protein  32.11 
 
 		 210 aa  90.9  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  33.33 
 
 		 209 aa  90.9  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0797  beta-lactamase domain-containing protein  34.58 
 
 		 238 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.16357 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3771  beta-lactamase domain-containing protein  36.15 
 
 		 216 aa  90.9  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1731  beta-lactamase domain protein  31.55 
 
 		 208 aa  90.1  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00010066  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20140  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  35.78 
 
 		 231 aa  90.1  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.428747 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1110  metallo-beta-lactamase family protein  29.69 
 
 		 207 aa  89.7  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  35.83 
 
 		 210 aa  90.5  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2989  beta-lactamase-like protein  36.92 
 
 		 225 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3033  beta-lactamase domain-containing protein  36.92 
 
 		 225 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4110  Hydroxyacylglutathione hydrolase  34.29 
 
 		 226 aa  90.1  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119244  normal  0.0132289 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25370  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  35.42 
 
 		 207 aa  90.5  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.555955 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0811  beta-lactamase domain-containing protein  35.26 
 
 		 214 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>