More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2886 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2886  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 220 aa  438  9.999999999999999e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2903  beta-lactamase domain protein  79.1 
 
 		 202 aa  317  7.999999999999999e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4760  beta-lactamase domain protein  77.61 
 
 		 202 aa  310  9e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3722  beta-lactamase domain-containing protein  59.18 
 
 		 206 aa  235  4e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3471  beta-lactamase domain protein  61.14 
 
 		 206 aa  234  7e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3768  beta-lactamase domain protein  58 
 
 		 209 aa  234  7e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0366381  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2397  putative hydrolase  55.94 
 
 		 210 aa  229  2e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.322158 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0656  beta-lactamase domain protein  61.66 
 
 		 208 aa  227  1e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15320  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  58.21 
 
 		 204 aa  220  9.999999999999999e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3650  beta-lactamase domain-containing protein  57.95 
 
 		 207 aa  217  1e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.335819  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2453  beta-lactamase domain protein  60.1 
 
 		 207 aa  213  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000197435  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2765  beta-lactamase domain-containing protein  57.14 
 
 		 209 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.268698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4164  beta-lactamase domain protein  54.19 
 
 		 205 aa  213  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420537  normal  0.04389 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1448  beta-lactamase-like  57.21 
 
 		 216 aa  213  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65636  normal  0.0425697 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0093  beta-lactamase domain protein  55.28 
 
 		 210 aa  213  1.9999999999999998e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3768  beta-lactamase domain-containing protein  56.12 
 
 		 209 aa  209  3e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.905496 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3392  beta-lactamase domain-containing protein  56.7 
 
 		 210 aa  209  4e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.302908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3381  beta-lactamase-like protein  56.7 
 
 		 210 aa  209  4e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.302529  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12288  hypothetical protein  53.92 
 
 		 211 aa  208  4e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3443  beta-lactamase domain-containing protein  56.7 
 
 		 210 aa  209  4e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1330  beta-lactamase domain-containing protein  56.06 
 
 		 205 aa  208  5e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.422414 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1402  beta-lactamase domain-containing protein  52.76 
 
 		 204 aa  208  6e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.147744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21860  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  52.45 
 
 		 574 aa  207  7e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10570  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  52.38 
 
 		 218 aa  207  9e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.193193  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0909  beta-lactamase domain protein  56.52 
 
 		 213 aa  206  2e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0324643  normal  0.0194681 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5067  beta-lactamase domain-containing protein  55.61 
 
 		 215 aa  204  6e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.512117  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0409  beta-lactamase domain protein  52.74 
 
 		 208 aa  203  2e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.494171  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18790  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  53.33 
 
 		 208 aa  201  7e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.659057 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03750  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  51.27 
 
 		 228 aa  201  8e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0915981 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3936  putative hydrolase  57.07 
 
 		 211 aa  193  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2999  beta-lactamase domain-containing protein  41.97 
 
 		 235 aa  150  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.658581 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8397  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  40.51 
 
 		 238 aa  137  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.376935 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2551  putative hydrolase  41.76 
 
 		 209 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.505017  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1196  beta-lactamase domain protein  36.24 
 
 		 235 aa  126  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.269825  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3834  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase  38.27 
 
 		 339 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.537571 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0512  Zn-dependent hydrolase  33.33 
 
 		 275 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.146741  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3413  beta-lactamase domain protein  36.56 
 
 		 209 aa  100  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2687  beta-lactamase domain protein  36.81 
 
 		 195 aa  99.4  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3707  beta-lactamase domain-containing protein  35.79 
 
 		 209 aa  99  5e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2186  beta-lactamase domain protein  37.04 
 
 		 210 aa  98.2  8e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.704345 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0479  beta-lactamase domain protein  31.05 
 
 		 212 aa  98.2  8e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2261  beta-lactamase-like protein  33.51 
 
 		 219 aa  95.9  4e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  36.27 
 
 		 211 aa  94.7  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25370  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  33.85 
 
 		 207 aa  93.6  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.555955 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12170  beta-lactamase domain protein  32.62 
 
 		 210 aa  92.8  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000265397  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0785  metallo-beta-lactamase family protein  32.62 
 
 		 205 aa  92.4  4e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.721139  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_691  metallo-beta-lactamase  32.09 
 
 		 217 aa  92  6e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.664332  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  34.74 
 
 		 201 aa  90.9  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0635  beta-lactamase domain-containing protein  37.7 
 
 		 204 aa  91.3  1e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.320984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0673  beta-lactamase domain-containing protein  37.64 
 
 		 206 aa  90.5  2e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.20621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  31.35 
 
 		 212 aa  90.5  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  32.63 
 
 		 215 aa  89.7  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2375  beta-lactamase domain protein  33.51 
 
 		 210 aa  89  5e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  31.08 
 
 		 251 aa  88.2  8e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6047  hydroxyacylglutathione hydrolase W  36.67 
 
 		 213 aa  88.2  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0800591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2926  beta-lactamase domain-containing protein  46.07 
 
 		 211 aa  88.2  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0705  beta-lactamase domain protein  37.5 
 
 		 201 aa  87.8  1e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1108  beta-lactamase domain-containing protein  36.7 
 
 		 218 aa  87.8  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.789331  normal  0.46822 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0711  beta-lactamase domain-containing protein  32.09 
 
 		 217 aa  87.8  1e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1110  metallo-beta-lactamase family protein  29.44 
 
 		 207 aa  87  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  33.86 
 
 		 209 aa  87  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1608  beta-lactamase domain-containing protein  37.91 
 
 		 206 aa  87  2e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.130416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4704  Beta-lactamase-like  33.16 
 
 		 214 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551492 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21890  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  35.57 
 
 		 229 aa  85.9  4e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0120239 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1731  beta-lactamase domain protein  31.77 
 
 		 208 aa  86.3  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00010066  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  34.22 
 
 		 209 aa  85.9  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4114  beta-lactamase domain-containing protein  29.79 
 
 		 209 aa  85.5  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  32.28 
 
 		 214 aa  85.1  7e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  34.22 
 
 		 210 aa  85.1  8e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0772  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 214 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4003  metallo-beta-lactamase family protein  29.79 
 
 		 209 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3134  beta-lactamase domain-containing protein  36.46 
 
 		 216 aa  83.6  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275883  normal  0.0207681 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4163  metallo-beta-lactamase family protein  29.95 
 
 		 208 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00575624  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0859  metallo-beta-lactamase family protein  29.26 
 
 		 209 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4485  metallo-beta-lactamase family protein  29.95 
 
 		 208 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.859552  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3651  beta-lactamase domain-containing protein  35.71 
 
 		 215 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  35.71 
 
 		 205 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0198  beta-lactamase domain protein  31.58 
 
 		 210 aa  84  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4375  metallo-beta-lactamase family protein  29.26 
 
 		 209 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3171  beta-lactamase domain protein  33.87 
 
 		 211 aa  82.8  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.343145 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 208 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0797  beta-lactamase domain-containing protein  32.8 
 
 		 238 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.16357 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4417  beta-lactamase domain-containing protein  32.8 
 
 		 214 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.834565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3655  beta-lactamase domain-containing protein  34.62 
 
 		 211 aa  82.8  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.658752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41150  metallo beta-lactamase-like protein  34.04 
 
 		 213 aa  82.4  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4281  metallo-beta-lactamase family protein  29.26 
 
 		 209 aa  82.4  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2047  DNA polymerase III epsilon subunit  31.35 
 
 		 200 aa  82.4  0.000000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0204926  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4341  metallo-beta-lactamase family protein  28.72 
 
 		 209 aa  82  0.000000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  32.11 
 
 		 207 aa  82  0.000000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4394  metallo-beta-lactamase family protein  28.72 
 
 		 209 aa  82  0.000000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  32.62 
 
 		 209 aa  81.6  0.000000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3014  beta-lactamase domain protein  35.96 
 
 		 213 aa  81.6  0.000000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.309827  normal  0.0865031 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4688  hypothetical protein  32.8 
 
 		 207 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42598  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2989  beta-lactamase domain-containing protein  30.32 
 
 		 209 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.86043  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2000  beta-lactamase domain-containing protein  34.38 
 
 		 214 aa  81.3  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.506851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2853  beta-lactamase domain protein  34.39 
 
 		 210 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1637  beta-lactamase domain-containing protein  30.89 
 
 		 207 aa  80.5  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.084203  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3466  beta-lactamase domain protein  32.62 
 
 		 218 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  35.43 
 
 		 217 aa  80.5  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  34.74 
 
 		 205 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>