82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2926 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2926  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
211 aa  416  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4760  beta-lactamase domain protein  41.98 
 
 
202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2397  putative hydrolase  55.06 
 
 
210 aa  102  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.322158 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3722  beta-lactamase domain-containing protein  51.11 
 
 
206 aa  102  6e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2903  beta-lactamase domain protein  51.69 
 
 
202 aa  100  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3768  beta-lactamase domain protein  39.02 
 
 
209 aa  98.2  8e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0366381  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1402  beta-lactamase domain-containing protein  52.75 
 
 
204 aa  94.7  9e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.147744  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3471  beta-lactamase domain protein  50 
 
 
206 aa  92.8  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3650  beta-lactamase domain-containing protein  50.56 
 
 
207 aa  89.4  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.335819  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21860  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  46.07 
 
 
574 aa  89  4e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18790  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  45.05 
 
 
208 aa  89  5e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.659057 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2886  beta-lactamase domain protein  46.07 
 
 
220 aa  88.2  9e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15320  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  50 
 
 
204 aa  87.4  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1448  beta-lactamase-like  35.8 
 
 
216 aa  87  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65636  normal  0.0425697 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2453  beta-lactamase domain protein  40.37 
 
 
207 aa  84.7  8e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000197435  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03750  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  46.15 
 
 
228 aa  84  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0915981 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3381  beta-lactamase-like protein  43.82 
 
 
210 aa  81.6  0.000000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.302529  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3392  beta-lactamase domain-containing protein  43.82 
 
 
210 aa  81.6  0.000000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.302908  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3443  beta-lactamase domain-containing protein  43.82 
 
 
210 aa  81.6  0.000000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0093  beta-lactamase domain protein  44.94 
 
 
210 aa  81.3  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0656  beta-lactamase domain protein  33.54 
 
 
208 aa  79  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12288  hypothetical protein  40.66 
 
 
211 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0909  beta-lactamase domain protein  45.83 
 
 
213 aa  76.3  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0324643  normal  0.0194681 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2551  putative hydrolase  41.76 
 
 
209 aa  75.9  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.505017  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1330  beta-lactamase domain-containing protein  42.86 
 
 
205 aa  75.9  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.422414 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10570  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  37.36 
 
 
218 aa  75.5  0.0000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.193193  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3768  beta-lactamase domain-containing protein  40.66 
 
 
209 aa  74.7  0.0000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.905496 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4164  beta-lactamase domain protein  42.55 
 
 
205 aa  74.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420537  normal  0.04389 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2765  beta-lactamase domain-containing protein  32.93 
 
 
209 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.268698  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5067  beta-lactamase domain-containing protein  31.87 
 
 
215 aa  72.8  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.512117  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3936  putative hydrolase  41.76 
 
 
211 aa  71.2  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8397  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  41.38 
 
 
238 aa  70.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.376935 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0409  beta-lactamase domain protein  42.86 
 
 
208 aa  71.2  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.494171  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2999  beta-lactamase domain-containing protein  35.04 
 
 
235 aa  69.7  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.658581 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0673  beta-lactamase domain-containing protein  52.46 
 
 
206 aa  63.9  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.20621  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2261  beta-lactamase-like protein  38 
 
 
219 aa  57.8  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1196  beta-lactamase domain protein  37.21 
 
 
235 aa  54.7  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.269825  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3834  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase  37.21 
 
 
339 aa  53.9  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.537571 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0479  beta-lactamase domain protein  38.71 
 
 
212 aa  50.8  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4163  metallo-beta-lactamase family protein  36.11 
 
 
208 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00575624  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4485  metallo-beta-lactamase family protein  36.11 
 
 
208 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.859552  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1108  beta-lactamase domain-containing protein  51.79 
 
 
218 aa  49.3  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.789331  normal  0.46822 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2055  beta-lactamase domain-containing protein  37.62 
 
 
229 aa  48.9  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4013  metallo-beta-lactamase family protein  34.85 
 
 
209 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.098472  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0512  Zn-dependent hydrolase  32.22 
 
 
275 aa  48.5  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.146741  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2120  beta-lactamase domain protein  40.7 
 
 
231 aa  48.5  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.316298  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1603  beta-lactamase domain-containing protein  37.5 
 
 
207 aa  47.8  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0599073  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25370  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  42.86 
 
 
207 aa  48.1  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.555955 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0859  metallo-beta-lactamase family protein  32.79 
 
 
209 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4375  metallo-beta-lactamase family protein  32.79 
 
 
209 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1637  beta-lactamase domain-containing protein  37.5 
 
 
207 aa  47.8  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.084203  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4281  metallo-beta-lactamase family protein  34.85 
 
 
209 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3171  beta-lactamase domain protein  41.18 
 
 
211 aa  46.6  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.343145 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4003  metallo-beta-lactamase family protein  33.33 
 
 
209 aa  46.2  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  37.63 
 
 
215 aa  46.2  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1700  beta-lactamase domain protein  43.55 
 
 
234 aa  46.2  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153973  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0498  hydroxyacylglutathione hydrolase  31.25 
 
 
256 aa  46.2  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0378559  normal  0.142728 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4114  beta-lactamase domain-containing protein  34.78 
 
 
209 aa  46.2  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4394  metallo-beta-lactamase family protein  36.36 
 
 
209 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4341  metallo-beta-lactamase family protein  36.36 
 
 
209 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3167  beta-lactamase domain protein  40.91 
 
 
231 aa  45.4  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0163096  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2125  putative hydrolase  50 
 
 
203 aa  45.4  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3004  beta-lactamase domain-containing protein  40 
 
 
204 aa  45.4  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.985459  normal  0.107301 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0635  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
204 aa  45.1  0.0008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.320984  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6047  hydroxyacylglutathione hydrolase W  40.24 
 
 
213 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0800591  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2396  beta-lactamase domain-containing protein  39.39 
 
 
237 aa  44.3  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.668368  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1336  beta-lactamase domain-containing protein  40.62 
 
 
256 aa  43.5  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.542543 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1037  beta-lactamase-like  31.34 
 
 
555 aa  43.1  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.34364  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1630  beta-lactamase-like  41.07 
 
 
232 aa  42.7  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3714  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  33.33 
 
 
259 aa  42.7  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.610808  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1110  metallo-beta-lactamase family protein  33.33 
 
 
207 aa  42.4  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6103  beta-lactamase-like protein  39.68 
 
 
231 aa  42.4  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2989  beta-lactamase domain-containing protein  34.78 
 
 
209 aa  42.4  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.86043  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21890  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  45.45 
 
 
229 aa  42.4  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0120239 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1608  beta-lactamase domain-containing protein  36.51 
 
 
206 aa  42  0.006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.130416  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2087  hydrolase  37.97 
 
 
224 aa  42  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  30.53 
 
 
209 aa  41.6  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1339  beta-lactamase-like protein  57.58 
 
 
192 aa  41.6  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2000  beta-lactamase domain-containing protein  38.64 
 
 
214 aa  41.6  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.506851  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1079  beta-lactamase domain protein  33.01 
 
 
332 aa  42  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0383209  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  31.51 
 
 
212 aa  41.6  0.009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2375  beta-lactamase domain protein  37.1 
 
 
210 aa  41.2  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>