More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1448 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1448  beta-lactamase-like  100 
 
 		 216 aa  428  1e-119  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65636  normal  0.0425697 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5067  beta-lactamase domain-containing protein  79.63 
 
 		 215 aa  348  3e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.512117  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10570  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  55.3 
 
 		 218 aa  239  2.9999999999999997e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.193193  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0656  beta-lactamase domain protein  58.65 
 
 		 208 aa  239  2.9999999999999997e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2397  putative hydrolase  57.55 
 
 		 210 aa  238  5e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.322158 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2453  beta-lactamase domain protein  61.61 
 
 		 207 aa  236  2e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000197435  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3392  beta-lactamase domain-containing protein  57.28 
 
 		 210 aa  232  3e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.302908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3381  beta-lactamase-like protein  57.28 
 
 		 210 aa  232  3e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.302529  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3443  beta-lactamase domain-containing protein  57.28 
 
 		 210 aa  232  3e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1330  beta-lactamase domain-containing protein  59.13 
 
 		 205 aa  229  4e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.422414 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12288  hypothetical protein  56.67 
 
 		 211 aa  228  5e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3722  beta-lactamase domain-containing protein  58.67 
 
 		 206 aa  227  1e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1402  beta-lactamase domain-containing protein  59 
 
 		 204 aa  224  1e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.147744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4760  beta-lactamase domain protein  59.9 
 
 		 202 aa  222  3e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3768  beta-lactamase domain-containing protein  54.07 
 
 		 209 aa  221  4e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.905496 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3768  beta-lactamase domain protein  53.59 
 
 		 209 aa  220  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0366381  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03750  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  54.5 
 
 		 228 aa  219  3e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0915981 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3471  beta-lactamase domain protein  54.77 
 
 		 206 aa  219  3e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2765  beta-lactamase domain-containing protein  53.59 
 
 		 209 aa  218  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.268698  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0409  beta-lactamase domain protein  54.29 
 
 		 208 aa  215  4e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.494171  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2903  beta-lactamase domain protein  58.38 
 
 		 202 aa  215  4e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0093  beta-lactamase domain protein  54.29 
 
 		 210 aa  214  5.9999999999999996e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18790  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  51.92 
 
 		 208 aa  214  9.999999999999999e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.659057 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2886  beta-lactamase domain protein  57.21 
 
 		 220 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3936  putative hydrolase  55.56 
 
 		 211 aa  211  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0909  beta-lactamase domain protein  50.7 
 
 		 213 aa  205  5e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0324643  normal  0.0194681 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15320  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  54.19 
 
 		 204 aa  204  6e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4164  beta-lactamase domain protein  52.4 
 
 		 205 aa  200  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420537  normal  0.04389 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3650  beta-lactamase domain-containing protein  53.27 
 
 		 207 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.335819  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21860  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  47.72 
 
 		 574 aa  186  3e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2999  beta-lactamase domain-containing protein  42.72 
 
 		 235 aa  160  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.658581 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2551  putative hydrolase  42.93 
 
 		 209 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.505017  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1196  beta-lactamase domain protein  38.05 
 
 		 235 aa  144  9e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.269825  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8397  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  39.81 
 
 		 238 aa  142  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.376935 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3834  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase  39.15 
 
 		 339 aa  128  6e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.537571 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2687  beta-lactamase domain protein  41.88 
 
 		 195 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0512  Zn-dependent hydrolase  33.8 
 
 		 275 aa  114  8.999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.146741  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  40.21 
 
 		 211 aa  106  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0635  beta-lactamase domain-containing protein  37.89 
 
 		 204 aa  102  4e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.320984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  35.9 
 
 		 201 aa  101  7e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  37.11 
 
 		 213 aa  100  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0673  beta-lactamase domain-containing protein  38.38 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.20621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  37.37 
 
 		 207 aa  100  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21890  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  39.66 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0120239 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  34.38 
 
 		 212 aa  100  2e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12170  beta-lactamase domain protein  32.99 
 
 		 210 aa  99.8  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000265397  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  34.21 
 
 		 251 aa  96.7  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3134  beta-lactamase domain-containing protein  35.23 
 
 		 216 aa  97.4  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275883  normal  0.0207681 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25370  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  35.79 
 
 		 207 aa  96.7  3e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.555955 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1608  beta-lactamase domain-containing protein  36.76 
 
 		 206 aa  96.3  3e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.130416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5486  beta-lactamase domain protein  35.53 
 
 		 225 aa  95.9  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000686385  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3004  beta-lactamase domain-containing protein  39.09 
 
 		 225 aa  95.9  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.057062 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0479  beta-lactamase domain protein  32.46 
 
 		 212 aa  95.5  5e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  34.55 
 
 		 210 aa  95.1  6e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  34.74 
 
 		 208 aa  95.5  6e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  36.32 
 
 		 210 aa  95.1  8e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0711  beta-lactamase domain-containing protein  36.55 
 
 		 217 aa  94.7  9e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2056  beta-lactamase domain-containing protein  35.23 
 
 		 222 aa  94.7  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.193314  normal  0.542159 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0705  beta-lactamase domain protein  36.27 
 
 		 201 aa  94  1e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  34.87 
 
 		 209 aa  94.7  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2989  beta-lactamase-like protein  38.58 
 
 		 225 aa  94  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3033  beta-lactamase domain-containing protein  38.58 
 
 		 225 aa  94  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  35.26 
 
 		 209 aa  93.2  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  36.27 
 
 		 207 aa  92.8  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3004  beta-lactamase domain-containing protein  36.13 
 
 		 204 aa  92.8  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.985459  normal  0.107301 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25780  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  35.03 
 
 		 225 aa  92.4  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3707  beta-lactamase domain-containing protein  35.68 
 
 		 209 aa  92.4  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3651  beta-lactamase domain-containing protein  36.08 
 
 		 215 aa  92  6e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6047  hydroxyacylglutathione hydrolase W  35.08 
 
 		 213 aa  90.9  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0800591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4417  beta-lactamase domain-containing protein  34.29 
 
 		 214 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.834565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2719  beta-lactamase domain protein  35.75 
 
 		 218 aa  90.9  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.227848  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1949  beta-lactamase domain protein  34.03 
 
 		 198 aa  91.3  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.857141  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  36.22 
 
 		 217 aa  90.1  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41150  metallo beta-lactamase-like protein  36.65 
 
 		 213 aa  90.1  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1108  beta-lactamase domain-containing protein  33.85 
 
 		 218 aa  90.5  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.789331  normal  0.46822 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0539  Zn-dependent hydrolase, including glyoxylase  34.52 
 
 		 210 aa  89.7  3e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0442594  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  35.64 
 
 		 210 aa  89.7  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_691  metallo-beta-lactamase  34.54 
 
 		 217 aa  89.4  3e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.664332  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3549  beta-lactamase domain-containing protein  36.18 
 
 		 225 aa  89.7  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.744565  normal  0.256716 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  34.17 
 
 		 205 aa  89.7  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3563  beta-lactamase domain protein  36.13 
 
 		 218 aa  89.4  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  32.5 
 
 		 209 aa  89.4  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2261  beta-lactamase-like protein  31.44 
 
 		 219 aa  89.4  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0539  beta-lactamase domain-containing protein  32.97 
 
 		 205 aa  89.4  4e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0811  beta-lactamase domain-containing protein  35.29 
 
 		 214 aa  89  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0785  metallo-beta-lactamase family protein  35.05 
 
 		 205 aa  89  6e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.721139  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2189  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 221 aa  89  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000613341  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  36.13 
 
 		 205 aa  88.6  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0549  beta-lactamase domain-containing protein  34.01 
 
 		 216 aa  88.6  7e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141512  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4704  Beta-lactamase-like  36.11 
 
 		 214 aa  88.6  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551492 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2000  beta-lactamase domain-containing protein  32.99 
 
 		 214 aa  88.2  9e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.506851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3479  Beta-lactamase-like  36.13 
 
 		 218 aa  88.2  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0772  beta-lactamase domain protein  35.75 
 
 		 214 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04020  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  34.2 
 
 		 222 aa  87.8  1e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.626574 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  33.68 
 
 		 207 aa  87.8  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2036  beta-lactamase domain protein  33.85 
 
 		 221 aa  86.7  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  34.87 
 
 		 205 aa  86.7  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0797  beta-lactamase domain-containing protein  33.64 
 
 		 238 aa  87  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.16357 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3171  beta-lactamase domain protein  35.6 
 
 		 211 aa  87.4  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.343145 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2926  beta-lactamase domain-containing protein  35.8 
 
 		 211 aa  87  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>