More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1630 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1630  beta-lactamase-like  100 
 
 		 232 aa  466  9.999999999999999e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2056  beta-lactamase domain-containing protein  79.63 
 
 		 222 aa  346  1e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.193314  normal  0.542159 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1108  beta-lactamase domain-containing protein  66.2 
 
 		 218 aa  288  4e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.789331  normal  0.46822 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2189  beta-lactamase domain protein  65.3 
 
 		 221 aa  283  1.0000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000613341  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5619  beta-lactamase domain protein  65.9 
 
 		 218 aa  274  9e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0608479  normal  0.170178 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3296  putative hydrolase  60.89 
 
 		 229 aa  268  5.9999999999999995e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2000  beta-lactamase domain-containing protein  60.65 
 
 		 214 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.506851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3114  beta-lactamase domain-containing protein  63.43 
 
 		 217 aa  263  2e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3342  beta-lactamase domain-containing protein  62.5 
 
 		 217 aa  261  6.999999999999999e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.349184  hitchhiker  0.000156681 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2522  beta-lactamase domain-containing protein  62.67 
 
 		 230 aa  260  1e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.344384  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6047  hydroxyacylglutathione hydrolase W  59.72 
 
 		 213 aa  256  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0800591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2036  beta-lactamase domain protein  61.09 
 
 		 221 aa  255  5e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2125  putative hydrolase  63.24 
 
 		 203 aa  250  2e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3134  beta-lactamase domain-containing protein  57.6 
 
 		 216 aa  241  7.999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275883  normal  0.0207681 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25780  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  57.92 
 
 		 225 aa  238  5e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5486  beta-lactamase domain protein  57.92 
 
 		 225 aa  236  3e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000686385  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2995  beta-lactamase domain protein  55.2 
 
 		 224 aa  226  2e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00127096  decreased coverage  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15140  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  54.08 
 
 		 237 aa  218  7.999999999999999e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.360479  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2989  beta-lactamase-like protein  55.2 
 
 		 225 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3033  beta-lactamase domain-containing protein  55.2 
 
 		 225 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3004  beta-lactamase domain-containing protein  54.75 
 
 		 225 aa  211  9e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.057062 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3549  beta-lactamase domain-containing protein  53.15 
 
 		 225 aa  206  4e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.744565  normal  0.256716 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20140  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  50 
 
 		 231 aa  202  2e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.428747 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11653  hypothetical protein  54.3 
 
 		 264 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.908461 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3340  beta-lactamase domain-containing protein  51.58 
 
 		 225 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.154999  normal  0.696965 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2854  beta-lactamase domain protein  50.68 
 
 		 226 aa  196  3e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0696867  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3498  beta-lactamase domain protein  49.05 
 
 		 216 aa  196  3e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0919016 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0760  beta-lactamase domain protein  55.33 
 
 		 205 aa  191  1e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.118646  normal  0.0112974 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3771  beta-lactamase domain-containing protein  46.01 
 
 		 216 aa  182  6e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2423  beta-lactamase domain protein  50.99 
 
 		 204 aa  172  5e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1951  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  49.15 
 
 		 238 aa  171  6.999999999999999e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2687  beta-lactamase domain protein  40.8 
 
 		 195 aa  160  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11270  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  45.79 
 
 		 226 aa  155  4e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.203901  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5618  beta-lactamase domain protein  47.8 
 
 		 202 aa  151  8e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.541776  normal  0.23712 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03910  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  40.19 
 
 		 214 aa  136  2e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0662663 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0705  beta-lactamase domain protein  36.19 
 
 		 201 aa  123  2e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0093  beta-lactamase domain protein  36.65 
 
 		 210 aa  112  4.0000000000000004e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1330  beta-lactamase domain-containing protein  34.55 
 
 		 205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.422414 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21890  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  35.61 
 
 		 229 aa  108  9.000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0120239 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  35.75 
 
 		 207 aa  108  9.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2397  putative hydrolase  38.55 
 
 		 210 aa  108  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.322158 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0656  beta-lactamase domain protein  35.42 
 
 		 208 aa  106  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  33.17 
 
 		 210 aa  107  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  33.66 
 
 		 211 aa  106  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0409  beta-lactamase domain protein  36.13 
 
 		 208 aa  105  6e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.494171  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1819  beta-lactamase domain-containing protein  34.36 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0368429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12288  hypothetical protein  34.9 
 
 		 211 aa  102  7e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4110  Hydroxyacylglutathione hydrolase  33.5 
 
 		 226 aa  102  7e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119244  normal  0.0132289 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15320  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  36.02 
 
 		 204 aa  100  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  32.69 
 
 		 209 aa  100  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18790  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  32.12 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.659057 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10570  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  32.5 
 
 		 218 aa  99.8  3e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.193193  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3768  beta-lactamase domain protein  34.27 
 
 		 209 aa  99.8  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0366381  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4164  beta-lactamase domain protein  35.11 
 
 		 205 aa  99.4  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420537  normal  0.04389 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  34.56 
 
 		 213 aa  98.6  8e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0909  beta-lactamase domain protein  36.26 
 
 		 213 aa  98.2  9e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0324643  normal  0.0194681 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2453  beta-lactamase domain protein  35.23 
 
 		 207 aa  97.1  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000197435  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  33.17 
 
 		 208 aa  97.4  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3650  beta-lactamase domain-containing protein  36.9 
 
 		 207 aa  96.7  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.335819  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3768  beta-lactamase domain-containing protein  34.03 
 
 		 209 aa  96.3  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.905496 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  30.43 
 
 		 205 aa  95.9  5e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1732  beta-lactamase domain-containing protein  32.99 
 
 		 214 aa  95.9  5e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37479  normal  0.0747191 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03750  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  32.46 
 
 		 228 aa  95.1  9e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0915981 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3936  putative hydrolase  35.59 
 
 		 211 aa  94.4  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3655  beta-lactamase domain-containing protein  34.17 
 
 		 211 aa  94  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.658752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  34.56 
 
 		 217 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  31.71 
 
 		 205 aa  93.6  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3381  beta-lactamase-like protein  35.59 
 
 		 210 aa  92.8  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.302529  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3443  beta-lactamase domain-containing protein  35.59 
 
 		 210 aa  92.8  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3392  beta-lactamase domain-containing protein  35.59 
 
 		 210 aa  92.8  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.302908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  31.19 
 
 		 213 aa  92  6e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5067  beta-lactamase domain-containing protein  33.17 
 
 		 215 aa  90.9  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.512117  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2765  beta-lactamase domain-containing protein  34.46 
 
 		 209 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.268698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3706  beta-lactamase domain-containing protein  30.1 
 
 		 201 aa  90.9  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000121895  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  30.43 
 
 		 207 aa  91.3  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04020  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  32.04 
 
 		 222 aa  91.3  1e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.626574 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3563  beta-lactamase domain protein  33.94 
 
 		 218 aa  90.5  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  31 
 
 		 209 aa  89.4  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3479  Beta-lactamase-like  33.49 
 
 		 218 aa  89  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3334  Beta-lactamase-like  37.5 
 
 		 245 aa  88.6  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.973711  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3722  beta-lactamase domain-containing protein  30.48 
 
 		 206 aa  88.6  7e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  30.43 
 
 		 251 aa  88.6  8e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  31.28 
 
 		 207 aa  88.6  8e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0673  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 206 aa  87.4  2e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.20621  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1782  beta-lactamase domain protein  33.49 
 
 		 215 aa  87  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00356762  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0125  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  31.61 
 
 		 218 aa  86.3  4e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.477047  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2738  beta-lactamase domain-containing protein  33.51 
 
 		 205 aa  86.3  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0539  beta-lactamase domain-containing protein  35.86 
 
 		 205 aa  85.9  5e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3413  beta-lactamase domain protein  29.58 
 
 		 209 aa  85.5  6e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1402  beta-lactamase domain-containing protein  32.98 
 
 		 204 aa  85.5  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.147744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3471  beta-lactamase domain protein  29.95 
 
 		 206 aa  85.5  7e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2719  beta-lactamase domain protein  30.48 
 
 		 218 aa  85.1  8e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.227848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1448  beta-lactamase-like  32.12 
 
 		 216 aa  85.1  9e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65636  normal  0.0425697 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21860  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  33.88 
 
 		 574 aa  85.1  9e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  27.8 
 
 		 206 aa  84.3  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  28.04 
 
 		 201 aa  83.6  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3484  beta-lactamase-like protein  35.71 
 
 		 248 aa  82.8  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  29.47 
 
 		 214 aa  82.8  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25370  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  30.66 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.555955 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3631  beta-lactamase domain protein  31.98 
 
 		 218 aa  82.4  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>