More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5486 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5486  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 225 aa  452  1.0000000000000001e-126  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000686385  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25780  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  80.89 
 
 		 225 aa  373  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2995  beta-lactamase domain protein  60.45 
 
 		 224 aa  263  1e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00127096  decreased coverage  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2189  beta-lactamase domain protein  63.68 
 
 		 221 aa  263  2e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000613341  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3296  putative hydrolase  62.1 
 
 		 229 aa  260  1e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3114  beta-lactamase domain-containing protein  63.64 
 
 		 217 aa  260  1e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2125  putative hydrolase  64.08 
 
 		 203 aa  258  4e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3342  beta-lactamase domain-containing protein  62.73 
 
 		 217 aa  258  6e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.349184  hitchhiker  0.000156681 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6047  hydroxyacylglutathione hydrolase W  62.44 
 
 		 213 aa  256  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0800591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3134  beta-lactamase domain-containing protein  59.55 
 
 		 216 aa  253  2.0000000000000002e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275883  normal  0.0207681 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3004  beta-lactamase domain-containing protein  60.96 
 
 		 225 aa  250  1e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.057062 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11653  hypothetical protein  62.67 
 
 		 264 aa  250  1e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.908461 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2989  beta-lactamase-like protein  60.53 
 
 		 225 aa  247  9e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3033  beta-lactamase domain-containing protein  60.53 
 
 		 225 aa  247  9e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2036  beta-lactamase domain protein  60.91 
 
 		 221 aa  246  3e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2000  beta-lactamase domain-containing protein  60 
 
 		 214 aa  245  4e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.506851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1108  beta-lactamase domain-containing protein  58.18 
 
 		 218 aa  245  4e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.789331  normal  0.46822 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5619  beta-lactamase domain protein  58.3 
 
 		 218 aa  243  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0608479  normal  0.170178 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3549  beta-lactamase domain-containing protein  58.74 
 
 		 225 aa  241  6e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.744565  normal  0.256716 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3340  beta-lactamase domain-containing protein  57.46 
 
 		 225 aa  239  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.154999  normal  0.696965 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2056  beta-lactamase domain-containing protein  57.52 
 
 		 222 aa  238  6.999999999999999e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.193314  normal  0.542159 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1630  beta-lactamase-like  57.92 
 
 		 232 aa  236  2e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15140  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  57.94 
 
 		 237 aa  231  6e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.360479  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2854  beta-lactamase domain protein  54.26 
 
 		 226 aa  225  4e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0696867  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2522  beta-lactamase domain-containing protein  55.13 
 
 		 230 aa  224  7e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.344384  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20140  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  52.25 
 
 		 231 aa  209  3e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.428747 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0760  beta-lactamase domain protein  57.5 
 
 		 205 aa  208  5e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.118646  normal  0.0112974 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3771  beta-lactamase domain-containing protein  51.46 
 
 		 216 aa  201  8e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3498  beta-lactamase domain protein  51.67 
 
 		 216 aa  201  9e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0919016 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1951  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  51.49 
 
 		 238 aa  200  9.999999999999999e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2423  beta-lactamase domain protein  50 
 
 		 204 aa  169  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03910  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  46.48 
 
 		 214 aa  169  3e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0662663 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11270  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  49.53 
 
 		 226 aa  164  1.0000000000000001e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.203901  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2687  beta-lactamase domain protein  40.1 
 
 		 195 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5618  beta-lactamase domain protein  46.7 
 
 		 202 aa  146  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.541776  normal  0.23712 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0705  beta-lactamase domain protein  35.38 
 
 		 201 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  37.02 
 
 		 207 aa  117  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  35.58 
 
 		 205 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  33.82 
 
 		 205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  38.5 
 
 		 213 aa  109  3e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  35.41 
 
 		 209 aa  107  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  34.3 
 
 		 211 aa  102  5e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  34.13 
 
 		 209 aa  102  6e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03750  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  36.41 
 
 		 228 aa  100  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0915981 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  36.49 
 
 		 217 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  34.15 
 
 		 210 aa  100  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0028  beta-lactamase domain-containing protein  36.02 
 
 		 220 aa  100  3e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0137537  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1732  beta-lactamase domain-containing protein  35.03 
 
 		 214 aa  98.6  6e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37479  normal  0.0747191 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  29.95 
 
 		 210 aa  98.6  7e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0213  beta-lactamase domain-containing protein  32.69 
 
 		 214 aa  98.6  8e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.325973 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2821  beta-lactamase-like  32.61 
 
 		 237 aa  98.2  9e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2397  putative hydrolase  36.22 
 
 		 210 aa  97.8  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.322158 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1777  beta-lactamase-like protein  35.82 
 
 		 211 aa  97.8  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  33.01 
 
 		 251 aa  97.1  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3563  beta-lactamase domain protein  35.45 
 
 		 218 aa  96.7  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3706  beta-lactamase domain-containing protein  32.66 
 
 		 201 aa  97.4  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000121895  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0199  beta-lactamase domain-containing protein  33.65 
 
 		 214 aa  97.4  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604325  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0656  beta-lactamase domain protein  35.71 
 
 		 208 aa  97.4  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3479  Beta-lactamase-like  35 
 
 		 218 aa  96.7  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3388  Beta-lactamase-like  32.54 
 
 		 241 aa  95.9  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1448  beta-lactamase-like  35.53 
 
 		 216 aa  95.9  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65636  normal  0.0425697 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 205 aa  96.3  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0267  beta-lactamase domain-containing protein  32.69 
 
 		 214 aa  95.9  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21890  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  32.14 
 
 		 229 aa  95.9  5e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0120239 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  29.81 
 
 		 207 aa  95.5  6e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  33.02 
 
 		 209 aa  95.5  6e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3631  beta-lactamase domain protein  35.43 
 
 		 218 aa  95.1  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  28.91 
 
 		 201 aa  95.1  7e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0044  metallo-beta-lactamase superfamily protein  33.81 
 
 		 214 aa  95.1  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3822  metallo-beta-lactamase family protein  33.81 
 
 		 214 aa  94.7  9e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2969  metallo-beta-lactamase family protein  33.81 
 
 		 214 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2909  metallo-beta-lactamase family protein  33.81 
 
 		 214 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.457315  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1632  metallo-beta-lactamase family protein  33.81 
 
 		 214 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3903  metallo-beta-lactamase family protein  33.81 
 
 		 214 aa  94.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3400  metallo-beta-lactamase family protein  33.81 
 
 		 214 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00696268  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0194  beta-lactamase domain-containing protein  32.69 
 
 		 214 aa  94.4  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113604  hitchhiker  0.00000000306881 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3151  metallo-beta-lactamase family protein  32.86 
 
 		 214 aa  94  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0285  beta-lactamase domain-containing protein  32.21 
 
 		 214 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394027  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  28.99 
 
 		 206 aa  93.6  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1330  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 205 aa  92.8  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.422414 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0215  beta-lactamase domain-containing protein  30.95 
 
 		 215 aa  93.2  3e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.755925 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  33.64 
 
 		 209 aa  92.4  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3484  beta-lactamase-like protein  39.67 
 
 		 248 aa  92.4  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5067  beta-lactamase domain-containing protein  33.67 
 
 		 215 aa  92  7e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.512117  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3936  putative hydrolase  37.56 
 
 		 211 aa  92  7e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  33.66 
 
 		 213 aa  91.7  8e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  28.16 
 
 		 212 aa  91.7  8e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0711  beta-lactamase domain-containing protein  33.66 
 
 		 217 aa  90.1  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  32.21 
 
 		 208 aa  90.5  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2524  beta-lactamase domain-containing protein  32.54 
 
 		 215 aa  90.9  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4317  putative metallo-beta-lactamase family protein  32.38 
 
 		 214 aa  89.7  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1819  beta-lactamase domain-containing protein  34.74 
 
 		 204 aa  89.7  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0368429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  29.47 
 
 		 207 aa  90.1  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1095  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.84 
 
 		 215 aa  89.4  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1003  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.84 
 
 		 215 aa  89.4  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105674  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1062  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.84 
 
 		 215 aa  89.4  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1030  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.84 
 
 		 215 aa  89.4  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  hitchhiker  0.00661846 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1112  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.84 
 
 		 215 aa  89.4  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0321  beta-lactamase domain-containing protein  31.16 
 
 		 202 aa  89  5e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4163  metallo-beta-lactamase family protein  28.85 
 
 		 208 aa  88.6  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00575624  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>