More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_3004 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_3004  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
225 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.057062 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2989  beta-lactamase-like protein  99.11 
 
 
225 aa  447  1e-125  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3033  beta-lactamase domain-containing protein  99.11 
 
 
225 aa  447  1e-125  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3549  beta-lactamase domain-containing protein  80 
 
 
225 aa  375  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.744565  normal  0.256716 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3340  beta-lactamase domain-containing protein  80.44 
 
 
225 aa  368  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.154999  normal  0.696965 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11653  hypothetical protein  79.56 
 
 
264 aa  345  5e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.908461 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2854  beta-lactamase domain protein  65.92 
 
 
226 aa  288  3e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0696867  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25780  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  62.28 
 
 
225 aa  256  2e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5486  beta-lactamase domain protein  60.96 
 
 
225 aa  250  1e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000686385  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2125  putative hydrolase  59.22 
 
 
203 aa  232  3e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2189  beta-lactamase domain protein  56.73 
 
 
221 aa  224  7e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000613341  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6047  hydroxyacylglutathione hydrolase W  57.73 
 
 
213 aa  224  8e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0800591  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2423  beta-lactamase domain protein  59.71 
 
 
204 aa  221  6e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3296  putative hydrolase  56.31 
 
 
229 aa  221  8e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2000  beta-lactamase domain-containing protein  56.52 
 
 
214 aa  218  3.9999999999999997e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.506851  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2995  beta-lactamase domain protein  54.5 
 
 
224 aa  214  8e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00127096  decreased coverage  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5619  beta-lactamase domain protein  54.3 
 
 
218 aa  211  7.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0608479  normal  0.170178 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1630  beta-lactamase-like  54.75 
 
 
232 aa  211  9e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2056  beta-lactamase domain-containing protein  53.64 
 
 
222 aa  211  9e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.193314  normal  0.542159 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3342  beta-lactamase domain-containing protein  53.64 
 
 
217 aa  207  1e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.349184  hitchhiker  0.000156681 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3114  beta-lactamase domain-containing protein  54.55 
 
 
217 aa  205  4e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2036  beta-lactamase domain protein  51.36 
 
 
221 aa  205  4e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1108  beta-lactamase domain-containing protein  52.66 
 
 
218 aa  204  1e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.789331  normal  0.46822 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3498  beta-lactamase domain protein  52.13 
 
 
216 aa  199  3.9999999999999996e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0919016 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3134  beta-lactamase domain-containing protein  51.36 
 
 
216 aa  197  9e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275883  normal  0.0207681 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20140  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  54.55 
 
 
231 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.428747 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15140  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  55.65 
 
 
237 aa  195  4.0000000000000005e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.360479  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0760  beta-lactamase domain protein  54.95 
 
 
205 aa  195  6e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.118646  normal  0.0112974 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3771  beta-lactamase domain-containing protein  51.69 
 
 
216 aa  193  1e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1951  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  53.59 
 
 
238 aa  187  1e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2522  beta-lactamase domain-containing protein  48.9 
 
 
230 aa  181  6e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.344384  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11270  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  50.88 
 
 
226 aa  178  4.999999999999999e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.203901  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03910  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  46.7 
 
 
214 aa  164  6.9999999999999995e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0662663 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2687  beta-lactamase domain protein  42.23 
 
 
195 aa  149  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  39.02 
 
 
211 aa  122  5e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  35.47 
 
 
210 aa  116  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0705  beta-lactamase domain protein  38.05 
 
 
201 aa  116  3.9999999999999997e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  34.98 
 
 
210 aa  111  7.000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3722  beta-lactamase domain-containing protein  38.74 
 
 
206 aa  111  9e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  37.31 
 
 
207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0656  beta-lactamase domain protein  39.8 
 
 
208 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3014  beta-lactamase domain protein  36.1 
 
 
213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.309827  normal  0.0865031 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2397  putative hydrolase  40.4 
 
 
210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.322158 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  34.16 
 
 
209 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21890  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  35.44 
 
 
229 aa  109  4.0000000000000004e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0120239 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  34.48 
 
 
209 aa  108  6e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  32.68 
 
 
207 aa  107  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  33.82 
 
 
208 aa  107  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  33.17 
 
 
205 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10570  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  34.98 
 
 
218 aa  106  3e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.193193  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  33 
 
 
201 aa  106  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  31.71 
 
 
206 aa  105  6e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  38.03 
 
 
217 aa  105  7e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3768  beta-lactamase domain protein  38.19 
 
 
209 aa  104  9e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0366381  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1755  beta-lactamase domain-containing protein  34.13 
 
 
235 aa  104  9e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.622383  normal  0.422321 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5856  beta-lactamase domain protein  34.76 
 
 
213 aa  104  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.518272  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0451  beta-lactamase domain protein  34.62 
 
 
213 aa  103  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5618  beta-lactamase domain protein  42.19 
 
 
202 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.541776  normal  0.23712 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12170  beta-lactamase domain protein  35.47 
 
 
210 aa  102  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000265397  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  33 
 
 
205 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  33.01 
 
 
207 aa  103  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3479  Beta-lactamase-like  35.68 
 
 
218 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5335  beta-lactamase domain-containing protein  35.24 
 
 
213 aa  102  7e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.311932  normal  0.0822687 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1330  beta-lactamase domain-containing protein  38 
 
 
205 aa  101  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.422414 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0841  Beta-lactamase-like  33.17 
 
 
213 aa  101  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0225813 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  33 
 
 
213 aa  100  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0786  metallo-beta-lactamase family protein  36.74 
 
 
208 aa  99.8  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0221878  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  32.68 
 
 
215 aa  99.8  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  32.68 
 
 
215 aa  99.8  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2391  metallo-beta-lactamase family protein  32.68 
 
 
215 aa  99.8  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  32.68 
 
 
215 aa  99.8  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3563  beta-lactamase domain protein  35.21 
 
 
218 aa  99.8  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00931  predicted metal-binding enzyme  32.2 
 
 
215 aa  99.4  4e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  32.2 
 
 
215 aa  99.4  4e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  32.2 
 
 
215 aa  99.4  4e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0711  beta-lactamase domain-containing protein  33.99 
 
 
217 aa  99  5e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1088  metallo-beta-lactamase family protein  32.68 
 
 
215 aa  99  5e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153658  normal  0.346644 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2261  beta-lactamase-like protein  35.27 
 
 
219 aa  99  5e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0228  beta-lactamase domain-containing protein  34.6 
 
 
212 aa  99  5e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3471  beta-lactamase domain protein  35.6 
 
 
206 aa  99  6e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  31.86 
 
 
251 aa  99  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  32.68 
 
 
215 aa  98.6  7e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0317  beta-lactamase domain-containing protein  33.81 
 
 
214 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.605621  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  32.5 
 
 
209 aa  97.8  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0220  beta-lactamase domain protein  33.03 
 
 
212 aa  97.1  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0785  metallo-beta-lactamase family protein  33.5 
 
 
205 aa  97.4  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.721139  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1306  metallo-beta-lactamase family protein  36 
 
 
214 aa  97.4  2e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1777  beta-lactamase-like protein  33.5 
 
 
211 aa  97.1  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3631  beta-lactamase domain protein  34.74 
 
 
218 aa  97.1  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1662  beta-lactamase domain protein  32.68 
 
 
212 aa  97.1  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1732  beta-lactamase domain-containing protein  35.38 
 
 
214 aa  97.1  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37479  normal  0.0747191 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0215  beta-lactamase domain-containing protein  30.1 
 
 
215 aa  97.4  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.755925 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0394  putative metallo-beta-lactamase family protein  33.5 
 
 
215 aa  96.7  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0890  glyoxylase II family protein  33.17 
 
 
218 aa  95.9  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000389063  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  32.52 
 
 
214 aa  96.3  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  31.34 
 
 
212 aa  95.5  5e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1448  beta-lactamase-like  39.09 
 
 
216 aa  95.9  5e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65636  normal  0.0425697 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_691  metallo-beta-lactamase  31.53 
 
 
217 aa  95.9  5e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.664332  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2853  beta-lactamase domain protein  34.74 
 
 
210 aa  95.5  5e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2370  beta-lactamase-like  31.58 
 
 
245 aa  95.5  6e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>