More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0705 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0705  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 201 aa  402  1e-111  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2995  beta-lactamase domain protein  40.2 
 
 		 224 aa  132  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00127096  decreased coverage  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3134  beta-lactamase domain-containing protein  36.71 
 
 		 216 aa  132  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275883  normal  0.0207681 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6047  hydroxyacylglutathione hydrolase W  38.83 
 
 		 213 aa  129  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0800591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2125  putative hydrolase  38 
 
 		 203 aa  128  5.0000000000000004e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2854  beta-lactamase domain protein  38.61 
 
 		 226 aa  128  5.0000000000000004e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0696867  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2000  beta-lactamase domain-containing protein  37.07 
 
 		 214 aa  128  7.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.506851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25780  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  37.56 
 
 		 225 aa  127  9.000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20140  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  36.04 
 
 		 231 aa  125  4.0000000000000003e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.428747 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3342  beta-lactamase domain-containing protein  35.58 
 
 		 217 aa  125  4.0000000000000003e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.349184  hitchhiker  0.000156681 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2687  beta-lactamase domain protein  43.62 
 
 		 195 aa  124  9e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3114  beta-lactamase domain-containing protein  35.1 
 
 		 217 aa  124  9e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1630  beta-lactamase-like  36.19 
 
 		 232 aa  123  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2056  beta-lactamase domain-containing protein  36.67 
 
 		 222 aa  123  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.193314  normal  0.542159 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2036  beta-lactamase domain protein  34.29 
 
 		 221 aa  122  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5619  beta-lactamase domain protein  38.57 
 
 		 218 aa  122  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0608479  normal  0.170178 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2423  beta-lactamase domain protein  38.69 
 
 		 204 aa  120  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3296  putative hydrolase  34.93 
 
 		 229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5486  beta-lactamase domain protein  35.38 
 
 		 225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000686385  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2189  beta-lactamase domain protein  34.27 
 
 		 221 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000613341  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1108  beta-lactamase domain-containing protein  35.71 
 
 		 218 aa  115  3e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.789331  normal  0.46822 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3004  beta-lactamase domain-containing protein  38.05 
 
 		 225 aa  116  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.057062 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2397  putative hydrolase  40.43 
 
 		 210 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.322158 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0656  beta-lactamase domain protein  40.53 
 
 		 208 aa  115  5e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0760  beta-lactamase domain protein  38.42 
 
 		 205 aa  115  6e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.118646  normal  0.0112974 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2989  beta-lactamase-like protein  37.56 
 
 		 225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3033  beta-lactamase domain-containing protein  37.56 
 
 		 225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0909  beta-lactamase domain protein  40.62 
 
 		 213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0324643  normal  0.0194681 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2522  beta-lactamase domain-containing protein  35.02 
 
 		 230 aa  111  9e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.344384  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03910  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  33.8 
 
 		 214 aa  110  1.0000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0662663 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3549  beta-lactamase domain-containing protein  38.14 
 
 		 225 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.744565  normal  0.256716 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3768  beta-lactamase domain protein  39.15 
 
 		 209 aa  109  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0366381  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3771  beta-lactamase domain-containing protein  36.15 
 
 		 216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1330  beta-lactamase domain-containing protein  40.96 
 
 		 205 aa  109  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.422414 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1951  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  34.96 
 
 		 238 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0409  beta-lactamase domain protein  38.5 
 
 		 208 aa  107  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.494171  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3722  beta-lactamase domain-containing protein  39.23 
 
 		 206 aa  106  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18790  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  37.37 
 
 		 208 aa  106  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.659057 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3936  putative hydrolase  38.34 
 
 		 211 aa  105  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3340  beta-lactamase domain-containing protein  34.67 
 
 		 225 aa  105  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.154999  normal  0.696965 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11653  hypothetical protein  37.11 
 
 		 264 aa  104  8e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.908461 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03750  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  36.02 
 
 		 228 aa  104  1e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0915981 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10570  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  34.62 
 
 		 218 aa  103  1e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.193193  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3471  beta-lactamase domain protein  36.76 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2453  beta-lactamase domain protein  39.27 
 
 		 207 aa  102  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000197435  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15320  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  37.91 
 
 		 204 aa  102  4e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3498  beta-lactamase domain protein  32.86 
 
 		 216 aa  101  6e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0919016 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4164  beta-lactamase domain protein  38.25 
 
 		 205 aa  101  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420537  normal  0.04389 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0093  beta-lactamase domain protein  37.1 
 
 		 210 aa  100  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3381  beta-lactamase-like protein  38.83 
 
 		 210 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.302529  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3650  beta-lactamase domain-containing protein  36.81 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.335819  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3443  beta-lactamase domain-containing protein  38.83 
 
 		 210 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3392  beta-lactamase domain-containing protein  38.83 
 
 		 210 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.302908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04020  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  34.63 
 
 		 222 aa  99  4e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.626574 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1402  beta-lactamase domain-containing protein  38.46 
 
 		 204 aa  97.8  9e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.147744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21860  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  36.56 
 
 		 574 aa  97.4  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3768  beta-lactamase domain-containing protein  37.77 
 
 		 209 aa  96.7  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.905496 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  36.63 
 
 		 207 aa  96.3  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2765  beta-lactamase domain-containing protein  37.23 
 
 		 209 aa  95.1  6e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.268698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2853  beta-lactamase domain protein  34.63 
 
 		 210 aa  94.7  7e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4760  beta-lactamase domain protein  39.23 
 
 		 202 aa  95.1  7e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5067  beta-lactamase domain-containing protein  36.13 
 
 		 215 aa  94.7  8e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.512117  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2903  beta-lactamase domain protein  39.33 
 
 		 202 aa  94.4  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1448  beta-lactamase-like  36.27 
 
 		 216 aa  94  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65636  normal  0.0425697 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15140  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  35.09 
 
 		 237 aa  92.8  3e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.360479  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12288  hypothetical protein  36.98 
 
 		 211 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  32.67 
 
 		 207 aa  90.9  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  30.05 
 
 		 201 aa  91.3  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11270  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  36.42 
 
 		 226 aa  89  4e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.203901  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25370  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  31.84 
 
 		 207 aa  88.6  5e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.555955 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2719  beta-lactamase domain protein  32.86 
 
 		 218 aa  88.6  5e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.227848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2886  beta-lactamase domain protein  37.5 
 
 		 220 aa  87.8  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  34.12 
 
 		 210 aa  87  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1728  beta-lactamase domain-containing protein  32.43 
 
 		 215 aa  85.9  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3707  beta-lactamase domain-containing protein  33.83 
 
 		 209 aa  85.9  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0451  beta-lactamase domain protein  33.17 
 
 		 213 aa  85.1  6e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0872  beta-lactamase domain protein  30.88 
 
 		 209 aa  84  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.172924  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0786  metallo-beta-lactamase family protein  32.66 
 
 		 208 aa  84  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0221878  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2370  beta-lactamase-like  32.66 
 
 		 245 aa  84  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3014  beta-lactamase domain protein  33 
 
 		 213 aa  83.6  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.309827  normal  0.0865031 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1110  metallo-beta-lactamase family protein  28.5 
 
 		 207 aa  83.2  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21890  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  31.25 
 
 		 229 aa  82.8  0.000000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0120239 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3706  beta-lactamase domain-containing protein  31.67 
 
 		 201 aa  82.4  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000121895  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  30.05 
 
 		 206 aa  82  0.000000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  29.8 
 
 		 211 aa  82  0.000000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1603  beta-lactamase domain-containing protein  28.86 
 
 		 207 aa  81.3  0.000000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0599073  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1637  beta-lactamase domain-containing protein  28.86 
 
 		 207 aa  81.3  0.000000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.084203  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  30.73 
 
 		 213 aa  80.9  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3413  beta-lactamase domain protein  32.81 
 
 		 209 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  29.56 
 
 		 214 aa  80.9  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3563  beta-lactamase domain protein  35.15 
 
 		 218 aa  80.9  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  29.21 
 
 		 208 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2524  beta-lactamase domain-containing protein  32.14 
 
 		 215 aa  80.1  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2375  beta-lactamase domain protein  31.82 
 
 		 210 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0841  Beta-lactamase-like  30.46 
 
 		 213 aa  79.7  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0225813 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1522  Beta-lactamase-like  32.21 
 
 		 214 aa  79.3  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3479  Beta-lactamase-like  33.65 
 
 		 218 aa  79.7  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2999  beta-lactamase domain-containing protein  30.48 
 
 		 235 aa  79.7  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.658581 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02708  hypothetical protein  30.48 
 
 		 218 aa  79  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3631  beta-lactamase domain protein  34.93 
 
 		 218 aa  79  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>