More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0760 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0760  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 205 aa  394  1e-109  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.118646  normal  0.0112974 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20140  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  61.72 
 
 		 231 aa  238  6.999999999999999e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.428747 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3498  beta-lactamase domain protein  55.77 
 
 		 216 aa  218  6e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0919016 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2125  putative hydrolase  59.18 
 
 		 203 aa  216  2e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2189  beta-lactamase domain protein  57.79 
 
 		 221 aa  209  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000613341  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3771  beta-lactamase domain-containing protein  55.72 
 
 		 216 aa  209  2e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3342  beta-lactamase domain-containing protein  58.76 
 
 		 217 aa  209  3e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.349184  hitchhiker  0.000156681 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5486  beta-lactamase domain protein  57.5 
 
 		 225 aa  208  4e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000686385  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5619  beta-lactamase domain protein  55.78 
 
 		 218 aa  208  5e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0608479  normal  0.170178 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3114  beta-lactamase domain-containing protein  58.67 
 
 		 217 aa  208  5e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2000  beta-lactamase domain-containing protein  56.19 
 
 		 214 aa  205  4e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.506851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6047  hydroxyacylglutathione hydrolase W  56 
 
 		 213 aa  199  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0800591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1108  beta-lactamase domain-containing protein  57.81 
 
 		 218 aa  199  3e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.789331  normal  0.46822 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2056  beta-lactamase domain-containing protein  57.65 
 
 		 222 aa  197  9e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.193314  normal  0.542159 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3296  putative hydrolase  58.12 
 
 		 229 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15140  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  57.08 
 
 		 237 aa  196  2.0000000000000003e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.360479  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2989  beta-lactamase-like protein  55.45 
 
 		 225 aa  196  3e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3033  beta-lactamase domain-containing protein  55.45 
 
 		 225 aa  196  3e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3004  beta-lactamase domain-containing protein  54.95 
 
 		 225 aa  195  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.057062 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3340  beta-lactamase domain-containing protein  57.29 
 
 		 225 aa  194  7e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.154999  normal  0.696965 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25780  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  52.5 
 
 		 225 aa  194  1e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1630  beta-lactamase-like  55.33 
 
 		 232 aa  191  8e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1951  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  60 
 
 		 238 aa  190  1e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2995  beta-lactamase domain protein  53.3 
 
 		 224 aa  189  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00127096  decreased coverage  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3549  beta-lactamase domain-containing protein  55.9 
 
 		 225 aa  189  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.744565  normal  0.256716 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2854  beta-lactamase domain protein  53.3 
 
 		 226 aa  189  4e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0696867  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11270  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  55.61 
 
 		 226 aa  187  9e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.203901  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2522  beta-lactamase domain-containing protein  55.38 
 
 		 230 aa  187  9e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.344384  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3134  beta-lactamase domain-containing protein  53.06 
 
 		 216 aa  186  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275883  normal  0.0207681 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11653  hypothetical protein  55.88 
 
 		 264 aa  183  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.908461 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2036  beta-lactamase domain protein  53.3 
 
 		 221 aa  183  1.0000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2423  beta-lactamase domain protein  50.24 
 
 		 204 aa  169  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03910  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  50.75 
 
 		 214 aa  162  2.0000000000000002e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0662663 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2687  beta-lactamase domain protein  43.3 
 
 		 195 aa  142  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0705  beta-lactamase domain protein  38.42 
 
 		 201 aa  115  6e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  35.61 
 
 		 207 aa  107  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  31.71 
 
 		 207 aa  105  4e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  33.17 
 
 		 205 aa  102  6e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  34.45 
 
 		 209 aa  101  8e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2719  beta-lactamase domain protein  32.06 
 
 		 218 aa  100  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.227848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21890  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  34.85 
 
 		 229 aa  97.4  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0120239 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  34.16 
 
 		 211 aa  94.4  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  32.84 
 
 		 209 aa  93.6  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  29.19 
 
 		 205 aa  92.4  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  31.25 
 
 		 205 aa  92  6e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5618  beta-lactamase domain protein  40.43 
 
 		 202 aa  91.7  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.541776  normal  0.23712 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0215  beta-lactamase domain-containing protein  32.54 
 
 		 215 aa  90.5  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.755925 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  37.81 
 
 		 217 aa  90.1  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  29.47 
 
 		 201 aa  89.7  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  31.92 
 
 		 251 aa  89.7  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  30.05 
 
 		 210 aa  89.7  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3479  Beta-lactamase-like  37.13 
 
 		 218 aa  89  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0656  beta-lactamase domain protein  40.96 
 
 		 208 aa  89.4  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2397  putative hydrolase  37.63 
 
 		 210 aa  88.6  6e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.322158 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3563  beta-lactamase domain protein  37.62 
 
 		 218 aa  88.6  6e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  29.52 
 
 		 207 aa  87.8  9e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1975  metallo-beta-lactamase superfamily protein  36 
 
 		 215 aa  86.7  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0642346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  33.64 
 
 		 214 aa  85.9  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2561  metallo-beta-lactamase family protein  36 
 
 		 215 aa  85.9  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000219407  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2652  beta-lactamase domain-containing protein  36 
 
 		 215 aa  85.9  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0560187  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  27.83 
 
 		 206 aa  84.7  8e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3631  beta-lactamase domain protein  36.14 
 
 		 218 aa  84.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1330  beta-lactamase domain-containing protein  33.81 
 
 		 205 aa  84  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.422414 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  31.25 
 
 		 209 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04020  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  32.65 
 
 		 222 aa  83.2  0.000000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.626574 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3707  beta-lactamase domain-containing protein  33.01 
 
 		 209 aa  83.6  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  30.77 
 
 		 209 aa  82.8  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  32.49 
 
 		 213 aa  82.8  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0536  beta-lactamase domain protein  34.18 
 
 		 226 aa  82  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0161694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  33.02 
 
 		 213 aa  82.4  0.000000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2261  beta-lactamase-like protein  32.99 
 
 		 219 aa  80.9  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  31.71 
 
 		 208 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  29.25 
 
 		 210 aa  81.3  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3076  metallo-beta-lactamase family protein  36.27 
 
 		 207 aa  80.1  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000251801  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1339  beta-lactamase-like protein  35.54 
 
 		 192 aa  80.1  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12170  beta-lactamase domain protein  29.77 
 
 		 210 aa  79.7  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000265397  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3655  beta-lactamase domain-containing protein  33.17 
 
 		 211 aa  79.7  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.658752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0786  metallo-beta-lactamase family protein  32.85 
 
 		 208 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0221878  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18790  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  32.7 
 
 		 208 aa  79.3  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.659057 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1732  beta-lactamase domain-containing protein  31.58 
 
 		 214 aa  79.3  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37479  normal  0.0747191 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3471  beta-lactamase domain protein  31.86 
 
 		 206 aa  79.3  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03750  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  35.63 
 
 		 228 aa  79.3  0.00000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0915981 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1095  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.16 
 
 		 215 aa  79.3  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2453  beta-lactamase domain protein  38.75 
 
 		 207 aa  79.3  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000197435  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1062  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.16 
 
 		 215 aa  79.3  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1112  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.16 
 
 		 215 aa  79.3  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1030  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.16 
 
 		 215 aa  79.3  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  hitchhiker  0.00661846 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1003  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.16 
 
 		 215 aa  79.3  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105674  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0213  beta-lactamase domain-containing protein  31.53 
 
 		 214 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.325973 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1043  Hydroxyacylglutathione hydrolase  31.52 
 
 		 235 aa  79  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5067  beta-lactamase domain-containing protein  34.3 
 
 		 215 aa  78.6  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.512117  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0028  beta-lactamase domain-containing protein  32.11 
 
 		 220 aa  78.6  0.00000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0137537  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2391  metallo-beta-lactamase family protein  32.63 
 
 		 215 aa  78.6  0.00000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3014  beta-lactamase domain protein  26.89 
 
 		 213 aa  77.8  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12288  hypothetical protein  37.71 
 
 		 211 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0451  beta-lactamase domain protein  30.58 
 
 		 213 aa  77.4  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1088  metallo-beta-lactamase family protein  32.11 
 
 		 215 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153658  normal  0.346644 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0199  beta-lactamase domain-containing protein  32.35 
 
 		 214 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604325  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  32.11 
 
 		 215 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1728  beta-lactamase domain-containing protein  33.17 
 
 		 215 aa  77.4  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>