More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3296 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3296  putative hydrolase  100 
 
 		 229 aa  457  9.999999999999999e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2125  putative hydrolase  78.33 
 
 		 203 aa  324  8.000000000000001e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2189  beta-lactamase domain protein  68.78 
 
 		 221 aa  295  4e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000613341  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6047  hydroxyacylglutathione hydrolase W  64.68 
 
 		 213 aa  275  5e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0800591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1108  beta-lactamase domain-containing protein  64.68 
 
 		 218 aa  275  6e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.789331  normal  0.46822 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2000  beta-lactamase domain-containing protein  63.76 
 
 		 214 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.506851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25780  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  64.38 
 
 		 225 aa  271  5.000000000000001e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3342  beta-lactamase domain-containing protein  64.68 
 
 		 217 aa  271  7e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.349184  hitchhiker  0.000156681 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2056  beta-lactamase domain-containing protein  62.9 
 
 		 222 aa  269  2.9999999999999997e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.193314  normal  0.542159 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3114  beta-lactamase domain-containing protein  63.3 
 
 		 217 aa  269  2.9999999999999997e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1630  beta-lactamase-like  60.89 
 
 		 232 aa  268  5.9999999999999995e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2036  beta-lactamase domain protein  64.55 
 
 		 221 aa  265  4e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5486  beta-lactamase domain protein  62.1 
 
 		 225 aa  260  1e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000686385  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3134  beta-lactamase domain-containing protein  59.45 
 
 		 216 aa  256  2e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275883  normal  0.0207681 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2995  beta-lactamase domain protein  58.9 
 
 		 224 aa  245  4.9999999999999997e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00127096  decreased coverage  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5619  beta-lactamase domain protein  57.87 
 
 		 218 aa  238  4e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0608479  normal  0.170178 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2522  beta-lactamase domain-containing protein  57.59 
 
 		 230 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.344384  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3549  beta-lactamase domain-containing protein  58.25 
 
 		 225 aa  227  1e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.744565  normal  0.256716 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3340  beta-lactamase domain-containing protein  57.28 
 
 		 225 aa  227  1e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.154999  normal  0.696965 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2989  beta-lactamase-like protein  56.8 
 
 		 225 aa  222  3e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3033  beta-lactamase domain-containing protein  56.8 
 
 		 225 aa  222  3e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3004  beta-lactamase domain-containing protein  56.31 
 
 		 225 aa  221  8e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.057062 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11653  hypothetical protein  57.35 
 
 		 264 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.908461 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20140  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  52.38 
 
 		 231 aa  210  1e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.428747 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2854  beta-lactamase domain protein  50.92 
 
 		 226 aa  208  6e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0696867  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3498  beta-lactamase domain protein  52.83 
 
 		 216 aa  201  6e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0919016 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0760  beta-lactamase domain protein  58.12 
 
 		 205 aa  197  1.0000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.118646  normal  0.0112974 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15140  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  54.08 
 
 		 237 aa  196  2.0000000000000003e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.360479  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3771  beta-lactamase domain-containing protein  51.46 
 
 		 216 aa  194  1e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2423  beta-lactamase domain protein  52.76 
 
 		 204 aa  184  1.0000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1951  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  50.21 
 
 		 238 aa  172  5e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11270  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  51.82 
 
 		 226 aa  166  2e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.203901  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5618  beta-lactamase domain protein  45.71 
 
 		 202 aa  157  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.541776  normal  0.23712 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03910  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  45.54 
 
 		 214 aa  156  3e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0662663 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2687  beta-lactamase domain protein  38.31 
 
 		 195 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0705  beta-lactamase domain protein  34.93 
 
 		 201 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3479  Beta-lactamase-like  39.91 
 
 		 218 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3563  beta-lactamase domain protein  39.91 
 
 		 218 aa  106  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  38.43 
 
 		 213 aa  105  4e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  36.89 
 
 		 207 aa  105  5e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  35.12 
 
 		 209 aa  105  6e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  38.53 
 
 		 217 aa  105  6e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21890  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  36.54 
 
 		 229 aa  105  8e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0120239 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  37.07 
 
 		 211 aa  104  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2397  putative hydrolase  37.06 
 
 		 210 aa  104  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.322158 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  33.98 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  35.61 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0093  beta-lactamase domain protein  36.92 
 
 		 210 aa  103  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03750  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  37.82 
 
 		 228 aa  103  3e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0915981 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1819  beta-lactamase domain-containing protein  37.78 
 
 		 204 aa  103  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0368429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3631  beta-lactamase domain protein  38.99 
 
 		 218 aa  102  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0125  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  33.68 
 
 		 218 aa  101  1e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.477047  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  32.69 
 
 		 201 aa  99.4  5e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  31.4 
 
 		 205 aa  99  6e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0409  beta-lactamase domain protein  36.79 
 
 		 208 aa  98.6  6e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.494171  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1330  beta-lactamase domain-containing protein  35.2 
 
 		 205 aa  98.6  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.422414 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  33.17 
 
 		 206 aa  98.2  9e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  33.5 
 
 		 209 aa  97.4  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3768  beta-lactamase domain protein  36.55 
 
 		 209 aa  97.1  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0366381  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3655  beta-lactamase domain-containing protein  37.86 
 
 		 211 aa  96.3  4e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.658752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  31.25 
 
 		 207 aa  96.3  4e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  35.29 
 
 		 213 aa  95.9  5e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3936  putative hydrolase  35.81 
 
 		 211 aa  94.7  9e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15320  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  37.77 
 
 		 204 aa  94.7  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3707  beta-lactamase domain-containing protein  34.5 
 
 		 209 aa  93.6  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18790  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  33.33 
 
 		 208 aa  93.2  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.659057 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2453  beta-lactamase domain protein  37.88 
 
 		 207 aa  92.8  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000197435  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3706  beta-lactamase domain-containing protein  30.26 
 
 		 201 aa  92.8  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000121895  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0673  beta-lactamase domain-containing protein  39.7 
 
 		 206 aa  92.8  4e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.20621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  33.33 
 
 		 214 aa  92  6e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  31.13 
 
 		 251 aa  92  7e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0656  beta-lactamase domain protein  35.57 
 
 		 208 aa  91.7  8e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0786  metallo-beta-lactamase family protein  31.46 
 
 		 208 aa  91.7  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0221878  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  32.84 
 
 		 210 aa  91.3  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0785  metallo-beta-lactamase family protein  33.33 
 
 		 205 aa  90.1  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.721139  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0028  beta-lactamase domain-containing protein  34.87 
 
 		 220 aa  90.1  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0137537  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10570  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  32.84 
 
 		 218 aa  90.5  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.193193  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4164  beta-lactamase domain protein  35.26 
 
 		 205 aa  89.7  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420537  normal  0.04389 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04020  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  33.33 
 
 		 222 aa  90.1  3e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.626574 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0909  beta-lactamase domain protein  37.37 
 
 		 213 aa  89.4  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0324643  normal  0.0194681 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_691  metallo-beta-lactamase  32.84 
 
 		 217 aa  89  6e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.664332  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2738  beta-lactamase domain-containing protein  36.61 
 
 		 205 aa  88.6  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0711  beta-lactamase domain-containing protein  32.34 
 
 		 217 aa  88.6  8e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3413  beta-lactamase domain protein  32.39 
 
 		 209 aa  87.8  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  32.69 
 
 		 208 aa  87.4  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0479  beta-lactamase domain protein  30 
 
 		 212 aa  87.4  2e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4110  Hydroxyacylglutathione hydrolase  32.14 
 
 		 226 aa  87.4  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119244  normal  0.0132289 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0215  beta-lactamase domain-containing protein  30.43 
 
 		 215 aa  87  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.755925 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2719  beta-lactamase domain protein  31.25 
 
 		 218 aa  86.7  3e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.227848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  29.81 
 
 		 207 aa  86.3  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5067  beta-lactamase domain-containing protein  31.98 
 
 		 215 aa  85.9  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.512117  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1522  Beta-lactamase-like  32.52 
 
 		 214 aa  85.1  7e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3014  beta-lactamase domain protein  35.12 
 
 		 213 aa  85.1  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.309827  normal  0.0865031 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0394  putative metallo-beta-lactamase family protein  32.34 
 
 		 215 aa  85.1  9e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1448  beta-lactamase-like  33.85 
 
 		 216 aa  84.7  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65636  normal  0.0425697 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3650  beta-lactamase domain-containing protein  34.39 
 
 		 207 aa  84.3  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.335819  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12288  hypothetical protein  35.35 
 
 		 211 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1732  beta-lactamase domain-containing protein  32.82 
 
 		 214 aa  84  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37479  normal  0.0747191 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2853  beta-lactamase domain protein  32.38 
 
 		 210 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1949  beta-lactamase domain protein  29.95 
 
 		 208 aa  83.6  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>