More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12288 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12288  hypothetical protein  100 
 
 
211 aa  419  1e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3381  beta-lactamase-like protein  81.73 
 
 
210 aa  348  3e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.302529  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3392  beta-lactamase domain-containing protein  81.73 
 
 
210 aa  348  3e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.302908  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3443  beta-lactamase domain-containing protein  81.73 
 
 
210 aa  348  3e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3768  beta-lactamase domain-containing protein  81.25 
 
 
209 aa  345  2e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.905496 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2765  beta-lactamase domain-containing protein  78.85 
 
 
209 aa  338  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.268698  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0409  beta-lactamase domain protein  63.77 
 
 
208 aa  267  1e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.494171  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0656  beta-lactamase domain protein  62.33 
 
 
208 aa  261  4.999999999999999e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1330  beta-lactamase domain-containing protein  60.58 
 
 
205 aa  258  3e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.422414 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2397  putative hydrolase  60.66 
 
 
210 aa  257  9e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.322158 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0093  beta-lactamase domain protein  57.97 
 
 
210 aa  246  1e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3768  beta-lactamase domain protein  59.24 
 
 
209 aa  246  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0366381  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10570  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  57.34 
 
 
218 aa  245  4e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.193193  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18790  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  55.66 
 
 
208 aa  237  1e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.659057 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0909  beta-lactamase domain protein  57.21 
 
 
213 aa  236  2e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0324643  normal  0.0194681 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1402  beta-lactamase domain-containing protein  59.3 
 
 
204 aa  235  3e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.147744  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2453  beta-lactamase domain protein  58.85 
 
 
207 aa  235  3e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000197435  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3722  beta-lactamase domain-containing protein  59.39 
 
 
206 aa  233  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5067  beta-lactamase domain-containing protein  58.37 
 
 
215 aa  232  3e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.512117  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4760  beta-lactamase domain protein  59 
 
 
202 aa  229  2e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03750  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  54.33 
 
 
228 aa  229  2e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0915981 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1448  beta-lactamase-like  56.67 
 
 
216 aa  228  5e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65636  normal  0.0425697 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3471  beta-lactamase domain protein  56.85 
 
 
206 aa  226  2e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2903  beta-lactamase domain protein  56.37 
 
 
202 aa  223  1e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21860  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  55.28 
 
 
574 aa  215  4e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3650  beta-lactamase domain-containing protein  56.22 
 
 
207 aa  214  5.9999999999999996e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.335819  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15320  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  55.34 
 
 
204 aa  214  5.9999999999999996e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4164  beta-lactamase domain protein  53.77 
 
 
205 aa  209  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420537  normal  0.04389 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2886  beta-lactamase domain protein  53.92 
 
 
220 aa  208  4e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3936  putative hydrolase  50.48 
 
 
211 aa  202  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2999  beta-lactamase domain-containing protein  43.6 
 
 
235 aa  159  4e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.658581 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1196  beta-lactamase domain protein  39.04 
 
 
235 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.269825  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2551  putative hydrolase  42.78 
 
 
209 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.505017  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8397  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  41.83 
 
 
238 aa  145  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.376935 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2687  beta-lactamase domain protein  44.5 
 
 
195 aa  142  4e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0512  Zn-dependent hydrolase  36.67 
 
 
275 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.146741  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3834  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase  37.68 
 
 
339 aa  125  5e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.537571 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  37.56 
 
 
211 aa  116  3e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21890  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  35.75 
 
 
229 aa  112  5e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0120239 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6103  beta-lactamase-like protein  38.54 
 
 
231 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1108  beta-lactamase domain-containing protein  36.65 
 
 
218 aa  105  4e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.789331  normal  0.46822 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25370  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  37.31 
 
 
207 aa  103  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.555955 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  36.73 
 
 
217 aa  102  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2055  beta-lactamase domain-containing protein  37.56 
 
 
229 aa  102  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1630  beta-lactamase-like  34.9 
 
 
232 aa  102  6e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  34.9 
 
 
201 aa  101  7e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0479  beta-lactamase domain protein  31.63 
 
 
212 aa  101  8e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  34.95 
 
 
205 aa  100  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1949  beta-lactamase domain protein  31 
 
 
208 aa  100  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6047  hydroxyacylglutathione hydrolase W  35.6 
 
 
213 aa  100  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0800591  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2056  beta-lactamase domain-containing protein  36.65 
 
 
222 aa  101  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.193314  normal  0.542159 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2036  beta-lactamase domain protein  37.76 
 
 
221 aa  100  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  36.26 
 
 
209 aa  99  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  33.51 
 
 
212 aa  98.2  7e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  36.92 
 
 
213 aa  97.4  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  36.65 
 
 
210 aa  97.8  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2719  beta-lactamase domain protein  35.57 
 
 
218 aa  97.4  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.227848  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  32.82 
 
 
207 aa  97.1  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3479  Beta-lactamase-like  38.34 
 
 
218 aa  95.5  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  33.18 
 
 
214 aa  95.5  5e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3563  beta-lactamase domain protein  37.82 
 
 
218 aa  95.5  5e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12170  beta-lactamase domain protein  32.35 
 
 
210 aa  94.4  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000265397  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2189  beta-lactamase domain protein  35.23 
 
 
221 aa  94  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000613341  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3771  beta-lactamase domain-containing protein  35.85 
 
 
216 aa  93.6  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0539  beta-lactamase domain-containing protein  37.23 
 
 
205 aa  94  2e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3549  beta-lactamase domain-containing protein  37.06 
 
 
225 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.744565  normal  0.256716 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2000  beta-lactamase domain-containing protein  32.12 
 
 
214 aa  93.2  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.506851  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2120  beta-lactamase domain protein  36 
 
 
231 aa  92.8  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.316298  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  31.41 
 
 
210 aa  92.8  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4110  Hydroxyacylglutathione hydrolase  37.11 
 
 
226 aa  92.4  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119244  normal  0.0132289 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0673  beta-lactamase domain-containing protein  36.81 
 
 
206 aa  92  6e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.20621  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0635  beta-lactamase domain-containing protein  36.17 
 
 
204 aa  91.3  9e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.320984  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3342  beta-lactamase domain-containing protein  33.85 
 
 
217 aa  90.9  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.349184  hitchhiker  0.000156681 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0705  beta-lactamase domain protein  36.98 
 
 
201 aa  90.9  1e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1817  beta-lactamase domain protein  30.81 
 
 
208 aa  90.5  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000015217  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  31.9 
 
 
210 aa  90.1  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3340  beta-lactamase domain-containing protein  36.04 
 
 
225 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.154999  normal  0.696965 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3004  beta-lactamase domain-containing protein  36.04 
 
 
225 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.057062 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1082  beta-lactamase domain protein  36.23 
 
 
222 aa  89.4  4e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3413  beta-lactamase domain protein  32.18 
 
 
209 aa  89.4  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1949  beta-lactamase domain protein  30.61 
 
 
198 aa  89  5e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.857141  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3114  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
217 aa  89  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0372  beta-lactamase domain-containing protein  35.16 
 
 
203 aa  89  5e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00504714  hitchhiker  0.000000000307388 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3631  beta-lactamase domain protein  37.11 
 
 
218 aa  89  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0549  beta-lactamase domain-containing protein  31 
 
 
216 aa  88.6  7e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141512  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3134  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
216 aa  87.8  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275883  normal  0.0207681 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3498  beta-lactamase domain protein  34.29 
 
 
216 aa  87.8  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0919016 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1731  beta-lactamase domain protein  34.03 
 
 
208 aa  87.4  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00010066  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
215 aa  87.8  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1110  metallo-beta-lactamase family protein  28.86 
 
 
207 aa  87  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04020  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  36.08 
 
 
222 aa  87  2e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.626574 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0418  beta-lactamase domain protein  31.82 
 
 
212 aa  87.4  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1637  beta-lactamase domain-containing protein  29.29 
 
 
207 aa  87  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.084203  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1819  beta-lactamase domain-containing protein  34.03 
 
 
204 aa  87  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0368429  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5619  beta-lactamase domain protein  35.6 
 
 
218 aa  86.7  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0608479  normal  0.170178 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1603  beta-lactamase domain-containing protein  29.29 
 
 
207 aa  87  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0599073  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2261  beta-lactamase-like protein  30.37 
 
 
219 aa  87  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11653  hypothetical protein  36.04 
 
 
264 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.908461 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  33.5 
 
 
208 aa  87.4  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3707  beta-lactamase domain-containing protein  33.67 
 
 
209 aa  86.7  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107683  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>