246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3834 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3834  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase  100 
 
 		 339 aa  664    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.537571 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0512  Zn-dependent hydrolase  51.28 
 
 		 275 aa  265  5.999999999999999e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.146741  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2999  beta-lactamase domain-containing protein  45.32 
 
 		 235 aa  172  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.658581 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1196  beta-lactamase domain protein  39.91 
 
 		 235 aa  159  8e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.269825  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8397  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  42.36 
 
 		 238 aa  152  7e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.376935 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0656  beta-lactamase domain protein  38.73 
 
 		 208 aa  149  5e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2397  putative hydrolase  39.41 
 
 		 210 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.322158 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18790  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  38.42 
 
 		 208 aa  145  9e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.659057 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1402  beta-lactamase domain-containing protein  39.8 
 
 		 204 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.147744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3381  beta-lactamase-like protein  39.41 
 
 		 210 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.302529  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3443  beta-lactamase domain-containing protein  39.41 
 
 		 210 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3392  beta-lactamase domain-containing protein  39.41 
 
 		 210 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.302908  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3936  putative hydrolase  38.65 
 
 		 211 aa  137  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03750  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  36.95 
 
 		 228 aa  135  7.000000000000001e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0915981 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0093  beta-lactamase domain protein  37.32 
 
 		 210 aa  134  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15320  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  38.5 
 
 		 204 aa  133  3e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1330  beta-lactamase domain-containing protein  37.93 
 
 		 205 aa  131  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.422414 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2765  beta-lactamase domain-containing protein  37.25 
 
 		 209 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.268698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3768  beta-lactamase domain protein  36.87 
 
 		 209 aa  131  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0366381  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0409  beta-lactamase domain protein  36.63 
 
 		 208 aa  130  3e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.494171  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3722  beta-lactamase domain-containing protein  39.49 
 
 		 206 aa  128  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3650  beta-lactamase domain-containing protein  37.31 
 
 		 207 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.335819  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1448  beta-lactamase-like  39.15 
 
 		 216 aa  127  3e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65636  normal  0.0425697 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3768  beta-lactamase domain-containing protein  37.25 
 
 		 209 aa  127  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.905496 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4164  beta-lactamase domain protein  40.31 
 
 		 205 aa  126  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420537  normal  0.04389 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5067  beta-lactamase domain-containing protein  37.56 
 
 		 215 aa  125  8.000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.512117  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0909  beta-lactamase domain protein  35.58 
 
 		 213 aa  125  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0324643  normal  0.0194681 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12288  hypothetical protein  37.68 
 
 		 211 aa  124  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3471  beta-lactamase domain protein  38.46 
 
 		 206 aa  123  6e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21860  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  36.04 
 
 		 574 aa  122  9.999999999999999e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10570  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  34.74 
 
 		 218 aa  119  7.999999999999999e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.193193  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2886  beta-lactamase domain protein  38.27 
 
 		 220 aa  119  9e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2453  beta-lactamase domain protein  37.93 
 
 		 207 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000197435  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2903  beta-lactamase domain protein  35.35 
 
 		 202 aa  114  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4760  beta-lactamase domain protein  35.9 
 
 		 202 aa  112  7.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2551  putative hydrolase  38.04 
 
 		 209 aa  102  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.505017  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3171  beta-lactamase domain protein  36.22 
 
 		 211 aa  83.2  0.000000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.343145 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4003  metallo-beta-lactamase family protein  27.18 
 
 		 209 aa  82  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0198  beta-lactamase domain protein  30.37 
 
 		 210 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4013  metallo-beta-lactamase family protein  26.67 
 
 		 209 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.098472  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4163  metallo-beta-lactamase family protein  26.8 
 
 		 208 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00575624  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4485  metallo-beta-lactamase family protein  26.8 
 
 		 208 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.859552  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4281  metallo-beta-lactamase family protein  26.67 
 
 		 209 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2989  beta-lactamase domain-containing protein  27.18 
 
 		 209 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.86043  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4341  metallo-beta-lactamase family protein  26.15 
 
 		 209 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4394  metallo-beta-lactamase family protein  26.15 
 
 		 209 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4375  metallo-beta-lactamase family protein  26.15 
 
 		 209 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0859  metallo-beta-lactamase family protein  26.15 
 
 		 209 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2375  beta-lactamase domain protein  31.09 
 
 		 210 aa  79  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4114  beta-lactamase domain-containing protein  25.64 
 
 		 209 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2261  beta-lactamase-like protein  29.59 
 
 		 219 aa  74.3  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2687  beta-lactamase domain protein  31.05 
 
 		 195 aa  73.9  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3004  beta-lactamase domain-containing protein  32.12 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.985459  normal  0.107301 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  27.18 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  29.32 
 
 		 215 aa  68.6  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0673  beta-lactamase domain-containing protein  31.22 
 
 		 206 aa  68.6  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.20621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0539  beta-lactamase domain-containing protein  30.94 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  28.57 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1637  beta-lactamase domain-containing protein  26.94 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.084203  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1603  beta-lactamase domain-containing protein  26.94 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0599073  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0479  beta-lactamase domain protein  25.56 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  28.5 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3014  beta-lactamase domain protein  30.37 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.309827  normal  0.0865031 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6047  hydroxyacylglutathione hydrolase W  27.89 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0800591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12170  beta-lactamase domain protein  25.52 
 
 		 210 aa  62.4  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000265397  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0215  beta-lactamase domain-containing protein  27.46 
 
 		 215 aa  62.4  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.755925 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0068  metallo-beta-lactamase superfamily protein  25.77 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0554126  normal  0.354369 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1949  beta-lactamase domain protein  28.12 
 
 		 198 aa  61.2  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.857141  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3413  beta-lactamase domain protein  28.79 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  27.36 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0443  beta-lactamase domain protein  28.43 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0635  beta-lactamase domain-containing protein  31.25 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.320984  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1110  metallo-beta-lactamase family protein  25.77 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  27.08 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0899  conserved hypothetical protein, putative hydrolase (metallo-beta-lactamase family)  24.73 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.585968  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4155  beta-lactamase domain protein  25.12 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000681201 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0630  hypothetical protein  24.42 
 
 		 214 aa  57  0.0000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0841  Beta-lactamase-like  28.41 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0225813 
 
 
-
 
NC_002950  PG1306  metallo-beta-lactamase family protein  28.93 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1201  metallo-beta-lactamase family protein  24.19 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  28.09 
 
 		 213 aa  55.8  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25370  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  28.12 
 
 		 207 aa  55.8  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.555955 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3235  metallo-beta-lactamase family protein  23.35 
 
 		 213 aa  55.5  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1635  beta-lactamase domain-containing protein  26.44 
 
 		 214 aa  55.5  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.702342  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5067  beta-lactamase domain protein  25.96 
 
 		 212 aa  54.7  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.533186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3433  beta-lactamase-like protein  26.2 
 
 		 222 aa  55.1  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  24.24 
 
 		 209 aa  55.1  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  29.08 
 
 		 210 aa  54.7  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0922  beta-lactamase domain-containing protein  29.9 
 
 		 298 aa  54.7  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.470849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  25.5 
 
 		 205 aa  54.7  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0705  beta-lactamase domain protein  27.51 
 
 		 201 aa  55.1  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  25.29 
 
 		 215 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  24.5 
 
 		 205 aa  54.3  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  25.29 
 
 		 215 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  25.29 
 
 		 215 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  25.29 
 
 		 215 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1782  Metallo-beta-lactamase  28.65 
 
 		 217 aa  53.9  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.111003  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  27.6 
 
 		 209 aa  53.9  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1731  beta-lactamase domain protein  28.06 
 
 		 208 aa  53.9  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00010066  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>