More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3768 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3768  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 209 aa  414  9.999999999999999e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0366381  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2397  putative hydrolase  65.7 
 
 		 210 aa  282  3.0000000000000004e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.322158 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15320  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  70.3 
 
 		 204 aa  281  6.000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0656  beta-lactamase domain protein  66.83 
 
 		 208 aa  278  5e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3650  beta-lactamase domain-containing protein  70.5 
 
 		 207 aa  270  1e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.335819  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2453  beta-lactamase domain protein  62.14 
 
 		 207 aa  260  1e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000197435  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0909  beta-lactamase domain protein  64.19 
 
 		 213 aa  259  2e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0324643  normal  0.0194681 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4164  beta-lactamase domain protein  65.2 
 
 		 205 aa  259  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420537  normal  0.04389 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4760  beta-lactamase domain protein  62.94 
 
 		 202 aa  257  9e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10570  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  58.53 
 
 		 218 aa  256  1e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.193193  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1330  beta-lactamase domain-containing protein  60.98 
 
 		 205 aa  253  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.422414 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2903  beta-lactamase domain protein  60.2 
 
 		 202 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3768  beta-lactamase domain-containing protein  60.58 
 
 		 209 aa  250  1e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.905496 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21860  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  60.49 
 
 		 574 aa  249  2e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12288  hypothetical protein  59.24 
 
 		 211 aa  246  1e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2765  beta-lactamase domain-containing protein  59.13 
 
 		 209 aa  246  2e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.268698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3722  beta-lactamase domain-containing protein  56.72 
 
 		 206 aa  243  9.999999999999999e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18790  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  56.59 
 
 		 208 aa  241  6e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.659057 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0093  beta-lactamase domain protein  56.73 
 
 		 210 aa  241  6e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3381  beta-lactamase-like protein  57.56 
 
 		 210 aa  240  1e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.302529  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3443  beta-lactamase domain-containing protein  57.56 
 
 		 210 aa  240  1e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3392  beta-lactamase domain-containing protein  57.56 
 
 		 210 aa  240  1e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.302908  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0409  beta-lactamase domain protein  55.5 
 
 		 208 aa  239  2.9999999999999997e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.494171  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2886  beta-lactamase domain protein  58 
 
 		 220 aa  234  6e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03750  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  55.83 
 
 		 228 aa  234  9e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0915981 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3471  beta-lactamase domain protein  54.73 
 
 		 206 aa  230  9e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1402  beta-lactamase domain-containing protein  56.65 
 
 		 204 aa  228  6e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.147744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5067  beta-lactamase domain-containing protein  54.81 
 
 		 215 aa  222  3e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.512117  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1448  beta-lactamase-like  53.59 
 
 		 216 aa  220  9.999999999999999e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65636  normal  0.0425697 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3936  putative hydrolase  55.78 
 
 		 211 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2999  beta-lactamase domain-containing protein  41.26 
 
 		 235 aa  160  1e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.658581 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2551  putative hydrolase  43.01 
 
 		 209 aa  153  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.505017  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2687  beta-lactamase domain protein  44.5 
 
 		 195 aa  144  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1196  beta-lactamase domain protein  36.73 
 
 		 235 aa  141  9e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.269825  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8397  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  38.35 
 
 		 238 aa  135  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.376935 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3834  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase  36.87 
 
 		 339 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.537571 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0512  Zn-dependent hydrolase  33.5 
 
 		 275 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.146741  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1108  beta-lactamase domain-containing protein  39.38 
 
 		 218 aa  118  6e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.789331  normal  0.46822 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  39.06 
 
 		 214 aa  115  6e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2261  beta-lactamase-like protein  38.02 
 
 		 219 aa  112  3e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  38.95 
 
 		 208 aa  112  5e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  37.89 
 
 		 210 aa  112  5e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6047  hydroxyacylglutathione hydrolase W  38.22 
 
 		 213 aa  111  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0800591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  37.63 
 
 		 211 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0479  beta-lactamase domain protein  32.26 
 
 		 212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0705  beta-lactamase domain protein  39.15 
 
 		 201 aa  109  3e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  36.32 
 
 		 251 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  35.48 
 
 		 212 aa  106  2e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3651  beta-lactamase domain-containing protein  37.62 
 
 		 215 aa  106  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4704  Beta-lactamase-like  36.84 
 
 		 214 aa  105  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551492 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3004  beta-lactamase domain-containing protein  38.19 
 
 		 225 aa  104  8e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.057062 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12170  beta-lactamase domain protein  35.48 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000265397  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2989  beta-lactamase-like protein  38.19 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1731  beta-lactamase domain protein  34.18 
 
 		 208 aa  103  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00010066  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3033  beta-lactamase domain-containing protein  38.19 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  35.26 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0772  beta-lactamase domain protein  37.89 
 
 		 214 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6103  beta-lactamase-like protein  35.89 
 
 		 231 aa  102  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  37.24 
 
 		 209 aa  102  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0673  beta-lactamase domain-containing protein  38.33 
 
 		 206 aa  101  7e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.20621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0549  beta-lactamase domain-containing protein  34.34 
 
 		 216 aa  101  7e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141512  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  36.32 
 
 		 209 aa  101  8e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4417  beta-lactamase domain-containing protein  35.92 
 
 		 214 aa  101  9e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.834565  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2000  beta-lactamase domain-containing protein  36.84 
 
 		 214 aa  100  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.506851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2512  beta-lactamase domain protein  34.52 
 
 		 214 aa  100  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.738891  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0797  beta-lactamase domain-containing protein  37.31 
 
 		 238 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.16357 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0418  beta-lactamase domain protein  32.99 
 
 		 212 aa  100  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0811  beta-lactamase domain-containing protein  36.32 
 
 		 214 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1630  beta-lactamase-like  34.27 
 
 		 232 aa  99.8  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1171  beta-lactamase domain protein  34.39 
 
 		 303 aa  99.8  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.361402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  34.21 
 
 		 207 aa  99.8  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2036  beta-lactamase domain protein  36.6 
 
 		 221 aa  99  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2055  beta-lactamase domain-containing protein  37.69 
 
 		 229 aa  99.4  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1608  beta-lactamase domain-containing protein  38.46 
 
 		 206 aa  99.4  4e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.130416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  35.83 
 
 		 210 aa  99  4e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0859  metallo-beta-lactamase family protein  31.22 
 
 		 209 aa  99  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  32.98 
 
 		 207 aa  99  5e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4375  metallo-beta-lactamase family protein  31.22 
 
 		 209 aa  98.6  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3413  beta-lactamase domain protein  35.53 
 
 		 209 aa  98.6  6e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3707  beta-lactamase domain-containing protein  36.84 
 
 		 209 aa  98.6  6e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107683  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1949  beta-lactamase domain protein  34.57 
 
 		 198 aa  98.6  6e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.857141  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  37.06 
 
 		 205 aa  98.6  6e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3134  beta-lactamase domain-containing protein  34.72 
 
 		 216 aa  98.2  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275883  normal  0.0207681 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4688  hypothetical protein  35.79 
 
 		 207 aa  98.2  7e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42598  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2926  beta-lactamase domain-containing protein  39.02 
 
 		 211 aa  98.2  8e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2056  beta-lactamase domain-containing protein  33.51 
 
 		 222 aa  98.2  8e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.193314  normal  0.542159 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4003  metallo-beta-lactamase family protein  30.73 
 
 		 209 aa  97.8  9e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4163  metallo-beta-lactamase family protein  30.37 
 
 		 208 aa  97.4  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00575624  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4110  Hydroxyacylglutathione hydrolase  36.47 
 
 		 226 aa  97.4  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119244  normal  0.0132289 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41150  metallo beta-lactamase-like protein  36.82 
 
 		 213 aa  97.4  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4485  metallo-beta-lactamase family protein  30.37 
 
 		 208 aa  97.4  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.859552  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  37 
 
 		 217 aa  97.4  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0539  beta-lactamase domain-containing protein  38.04 
 
 		 205 aa  97.8  1e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3549  beta-lactamase domain-containing protein  36.68 
 
 		 225 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.744565  normal  0.256716 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2989  beta-lactamase domain-containing protein  31.25 
 
 		 209 aa  96.7  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.86043  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3296  putative hydrolase  36.55 
 
 		 229 aa  97.1  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  36.6 
 
 		 215 aa  97.1  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  35.83 
 
 		 209 aa  96.3  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3004  beta-lactamase domain-containing protein  39.18 
 
 		 204 aa  95.9  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.985459  normal  0.107301 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2853  beta-lactamase domain protein  34.22 
 
 		 210 aa  96.3  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>