More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0539 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0539  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 205 aa  414  9.999999999999999e-116  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0635  beta-lactamase domain-containing protein  62 
 
 		 204 aa  253  1.0000000000000001e-66  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.320984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0673  beta-lactamase domain-containing protein  59.31 
 
 		 206 aa  251  7e-66  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.20621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1608  beta-lactamase domain-containing protein  57.35 
 
 		 206 aa  249  3e-65  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.130416  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  42.16 
 
 		 209 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0872  beta-lactamase domain protein  36.63 
 
 		 209 aa  122  3e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.172924  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  35.47 
 
 		 212 aa  122  5e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  44.9 
 
 		 217 aa  121  7e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3171  beta-lactamase domain protein  41.09 
 
 		 211 aa  120  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.343145 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1110  metallo-beta-lactamase family protein  30.1 
 
 		 207 aa  119  3e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1637  beta-lactamase domain-containing protein  30.85 
 
 		 207 aa  118  7e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.084203  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1603  beta-lactamase domain-containing protein  30.85 
 
 		 207 aa  118  7e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0599073  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1731  beta-lactamase domain protein  39.11 
 
 		 208 aa  118  7e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00010066  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  38.24 
 
 		 208 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  38.05 
 
 		 209 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3004  beta-lactamase domain-containing protein  39.2 
 
 		 204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.985459  normal  0.107301 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  35 
 
 		 210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  32.51 
 
 		 207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3707  beta-lactamase domain-containing protein  36.68 
 
 		 209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0479  beta-lactamase domain protein  33.65 
 
 		 212 aa  112  3e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  37.13 
 
 		 211 aa  112  3e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1949  beta-lactamase domain protein  35.18 
 
 		 198 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.857141  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  34.65 
 
 		 205 aa  111  6e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3413  beta-lactamase domain protein  38.81 
 
 		 209 aa  111  9e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  35.47 
 
 		 207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  36.73 
 
 		 213 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0443  beta-lactamase domain protein  33 
 
 		 208 aa  109  3e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3563  beta-lactamase domain protein  39.8 
 
 		 218 aa  109  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  36.92 
 
 		 213 aa  108  4.0000000000000004e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3479  Beta-lactamase-like  39.29 
 
 		 218 aa  108  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2261  beta-lactamase-like protein  36.23 
 
 		 219 aa  108  4.0000000000000004e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0772  beta-lactamase domain protein  39 
 
 		 214 aa  108  6e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  36.67 
 
 		 251 aa  108  6e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2853  beta-lactamase domain protein  38.69 
 
 		 210 aa  107  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0797  beta-lactamase domain-containing protein  39.11 
 
 		 238 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.16357 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  37.76 
 
 		 209 aa  107  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  35.29 
 
 		 209 aa  106  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  34.62 
 
 		 210 aa  106  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2186  beta-lactamase domain protein  38 
 
 		 210 aa  106  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.704345 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0418  beta-lactamase domain protein  33.97 
 
 		 212 aa  106  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  32.84 
 
 		 207 aa  105  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4417  beta-lactamase domain-containing protein  37.31 
 
 		 214 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.834565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0811  beta-lactamase domain-containing protein  37 
 
 		 214 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0539  Zn-dependent hydrolase, including glyoxylase  35.05 
 
 		 210 aa  104  9e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0442594  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3631  beta-lactamase domain protein  38.78 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  35.29 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3235  metallo-beta-lactamase family protein  32.69 
 
 		 213 aa  103  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3650  beta-lactamase domain-containing protein  40.66 
 
 		 207 aa  102  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.335819  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0549  beta-lactamase domain-containing protein  33.01 
 
 		 216 aa  102  5e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141512  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5067  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 212 aa  102  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.533186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  34.8 
 
 		 214 aa  101  8e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1211  beta-lactamase domain protein  39.59 
 
 		 211 aa  101  8e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000331215  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  35.47 
 
 		 205 aa  101  9e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15320  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  38.42 
 
 		 204 aa  101  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4704  Beta-lactamase-like  34.48 
 
 		 214 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551492 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4688  hypothetical protein  35.68 
 
 		 207 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42598  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53510  hypothetical protein  35.18 
 
 		 213 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000645977 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2640  beta-lactamase domain protein  30.89 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41150  metallo beta-lactamase-like protein  37.25 
 
 		 213 aa  100  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2055  beta-lactamase domain-containing protein  35.71 
 
 		 229 aa  99.8  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4003  metallo-beta-lactamase family protein  32.85 
 
 		 209 aa  99.8  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5067  beta-lactamase domain-containing protein  37.63 
 
 		 215 aa  99.8  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.512117  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3818  beta-lactamase domain-containing protein  36.49 
 
 		 231 aa  99.4  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.419873  normal  0.0855026 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3651  beta-lactamase domain-containing protein  33.82 
 
 		 215 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03750  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  35.16 
 
 		 228 aa  99  4e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0915981 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2512  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 214 aa  99  4e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.738891  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4163  metallo-beta-lactamase family protein  32.52 
 
 		 208 aa  98.6  6e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00575624  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4485  metallo-beta-lactamase family protein  32.52 
 
 		 208 aa  98.6  6e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.859552  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4013  metallo-beta-lactamase family protein  32.37 
 
 		 209 aa  98.2  7e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.098472  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4114  beta-lactamase domain-containing protein  32.2 
 
 		 209 aa  98.2  7e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2397  putative hydrolase  36.46 
 
 		 210 aa  98.2  7e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.322158 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4375  metallo-beta-lactamase family protein  31.88 
 
 		 209 aa  98.2  8e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0786  metallo-beta-lactamase family protein  33.66 
 
 		 208 aa  97.8  9e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0221878  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4281  metallo-beta-lactamase family protein  32.37 
 
 		 209 aa  97.8  9e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3768  beta-lactamase domain protein  38.04 
 
 		 209 aa  97.8  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0366381  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1777  beta-lactamase-like protein  32.49 
 
 		 211 aa  97.4  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0321  beta-lactamase domain-containing protein  31.1 
 
 		 202 aa  97.8  1e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4341  metallo-beta-lactamase family protein  31.4 
 
 		 209 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0912  beta-lactamase domain protein  33.51 
 
 		 200 aa  96.7  2e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.330922  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2375  beta-lactamase domain protein  34.31 
 
 		 210 aa  96.7  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4394  metallo-beta-lactamase family protein  31.4 
 
 		 209 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0859  metallo-beta-lactamase family protein  31.88 
 
 		 209 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  31.28 
 
 		 210 aa  95.9  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3014  beta-lactamase domain protein  32.52 
 
 		 213 aa  96.3  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5856  beta-lactamase domain protein  38.89 
 
 		 213 aa  96.3  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.518272  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0198  beta-lactamase domain protein  33.82 
 
 		 210 aa  96.3  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2989  beta-lactamase domain-containing protein  31.73 
 
 		 209 aa  96.3  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.86043  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4164  beta-lactamase domain protein  38.12 
 
 		 205 aa  95.9  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420537  normal  0.04389 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3392  beta-lactamase domain-containing protein  39.23 
 
 		 210 aa  95.5  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.302908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3381  beta-lactamase-like protein  39.23 
 
 		 210 aa  95.5  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.302529  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3091  hydrolase  32.89 
 
 		 225 aa  95.5  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3443  beta-lactamase domain-containing protein  39.23 
 
 		 210 aa  95.5  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4155  beta-lactamase domain protein  29.95 
 
 		 212 aa  95.1  7e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000681201 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0656  beta-lactamase domain protein  37.02 
 
 		 208 aa  95.1  7e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21890  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  34.6 
 
 		 229 aa  94.7  8e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0120239 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4293  beta-lactamase domain protein  37.79 
 
 		 376 aa  94.7  9e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3768  beta-lactamase domain-containing protein  36.41 
 
 		 209 aa  94.7  9e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.905496 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12170  beta-lactamase domain protein  32.16 
 
 		 210 aa  94  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000265397  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2191  metallo-beta-lactamase family protein  30.85 
 
 		 206 aa  94.4  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12288  hypothetical protein  37.23 
 
 		 211 aa  94  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>