More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_21890 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_21890  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  100 
 
 
229 aa  471  1e-132  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0120239 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2719  beta-lactamase domain protein  46.05 
 
 
218 aa  170  2e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.227848  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04020  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  42.99 
 
 
222 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.626574 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25370  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  47.32 
 
 
207 aa  161  6e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.555955 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  39.42 
 
 
212 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  39.62 
 
 
211 aa  139  3e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  40 
 
 
201 aa  139  3e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  39.22 
 
 
209 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  40.89 
 
 
205 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  37.85 
 
 
205 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  37.75 
 
 
209 aa  131  6.999999999999999e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  42.54 
 
 
208 aa  131  9e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1732  beta-lactamase domain-containing protein  38.38 
 
 
214 aa  129  4.0000000000000003e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37479  normal  0.0747191 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  38.46 
 
 
207 aa  128  7.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  37.38 
 
 
213 aa  128  7.000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  37.68 
 
 
209 aa  125  5e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  36.76 
 
 
209 aa  125  6e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  37.82 
 
 
207 aa  123  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0028  beta-lactamase domain-containing protein  37.61 
 
 
220 aa  122  5e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0137537  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  37.38 
 
 
217 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  37.23 
 
 
251 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  37.32 
 
 
206 aa  120  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  38.97 
 
 
210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6103  beta-lactamase-like protein  37.02 
 
 
231 aa  118  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  36.89 
 
 
207 aa  118  6e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12170  beta-lactamase domain protein  38.22 
 
 
210 aa  118  7.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000265397  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  38.73 
 
 
205 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  37.56 
 
 
210 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1949  beta-lactamase domain protein  36.95 
 
 
208 aa  116  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2403  metallo-beta-lactamase family protein  34.7 
 
 
213 aa  115  3.9999999999999997e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  36.23 
 
 
209 aa  115  3.9999999999999997e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1902  metallo-beta-lactamase family protein  34.62 
 
 
206 aa  116  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0711  beta-lactamase domain-containing protein  34.09 
 
 
217 aa  115  6e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0479  beta-lactamase domain protein  31.9 
 
 
212 aa  115  6e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0549  beta-lactamase domain-containing protein  31.31 
 
 
216 aa  115  6.9999999999999995e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141512  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2364  beta-lactamase domain protein  34.74 
 
 
231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0656  beta-lactamase domain protein  37.82 
 
 
208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  35.64 
 
 
214 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2191  metallo-beta-lactamase family protein  34.13 
 
 
206 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3471  beta-lactamase domain protein  37.95 
 
 
206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3479  Beta-lactamase-like  35.55 
 
 
218 aa  112  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2000  beta-lactamase domain-containing protein  37.32 
 
 
214 aa  113  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.506851  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  38.92 
 
 
213 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2120  beta-lactamase domain protein  37 
 
 
231 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.316298  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0321  beta-lactamase domain-containing protein  35.58 
 
 
202 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1003  hydroxyacylglutathione hydrolase  38.67 
 
 
215 aa  112  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105674  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1062  hydroxyacylglutathione hydrolase  38.67 
 
 
215 aa  112  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2687  beta-lactamase domain protein  37.75 
 
 
195 aa  112  5e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1095  hydroxyacylglutathione hydrolase  38.67 
 
 
215 aa  112  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1112  hydroxyacylglutathione hydrolase  38.67 
 
 
215 aa  112  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347617  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3563  beta-lactamase domain protein  35.55 
 
 
218 aa  112  5e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1030  hydroxyacylglutathione hydrolase  38.67 
 
 
215 aa  112  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  hitchhiker  0.00661846 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12288  hypothetical protein  35.75 
 
 
211 aa  112  6e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3549  beta-lactamase domain-containing protein  36.23 
 
 
225 aa  112  6e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.744565  normal  0.256716 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3340  beta-lactamase domain-containing protein  35.92 
 
 
225 aa  112  6e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.154999  normal  0.696965 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12601  glyoxalase II (hydroxyacylglutathione hydrolase)  34.25 
 
 
246 aa  111  7.000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0111807  normal  0.957918 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4164  beta-lactamase domain protein  35.38 
 
 
205 aa  111  9e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420537  normal  0.04389 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  33.01 
 
 
215 aa  111  9e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0872  beta-lactamase domain protein  34.31 
 
 
209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.172924  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  37.16 
 
 
215 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_691  metallo-beta-lactamase  32.88 
 
 
217 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.664332  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10570  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  36 
 
 
218 aa  111  1.0000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.193193  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1088  metallo-beta-lactamase family protein  37.16 
 
 
215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153658  normal  0.346644 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3235  metallo-beta-lactamase family protein  34.74 
 
 
213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3650  beta-lactamase domain-containing protein  38.14 
 
 
207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.335819  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2512  beta-lactamase domain protein  33.18 
 
 
214 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.738891  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3631  beta-lactamase domain protein  35.55 
 
 
218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15320  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  36.6 
 
 
204 aa  109  3e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3722  beta-lactamase domain-containing protein  36.92 
 
 
206 aa  110  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1949  beta-lactamase domain protein  35.14 
 
 
245 aa  109  3e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00931  predicted metal-binding enzyme  37.02 
 
 
215 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  37.02 
 
 
215 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1211  beta-lactamase domain protein  35.51 
 
 
211 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000331215  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3004  beta-lactamase domain-containing protein  35.44 
 
 
225 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.057062 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  37.02 
 
 
215 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3655  beta-lactamase domain-containing protein  34.6 
 
 
211 aa  109  4.0000000000000004e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.658752  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  32.66 
 
 
210 aa  108  5e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1782  Metallo-beta-lactamase  36.36 
 
 
217 aa  108  5e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.111003  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1777  beta-lactamase-like protein  37.32 
 
 
211 aa  108  7.000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  36.61 
 
 
215 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  36.61 
 
 
215 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2375  beta-lactamase domain protein  34.15 
 
 
210 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1630  beta-lactamase-like  35.61 
 
 
232 aa  108  9.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2391  metallo-beta-lactamase family protein  37.02 
 
 
215 aa  108  9.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  36.61 
 
 
215 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0372  beta-lactamase domain-containing protein  33.95 
 
 
203 aa  107  1e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00504714  hitchhiker  0.000000000307388 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1330  beta-lactamase domain-containing protein  36.6 
 
 
205 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.422414 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2989  beta-lactamase-like protein  34.95 
 
 
225 aa  107  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1949  beta-lactamase domain protein  36.67 
 
 
198 aa  107  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.857141  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1108  beta-lactamase domain-containing protein  36.1 
 
 
218 aa  107  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.789331  normal  0.46822 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1082  beta-lactamase domain protein  36.11 
 
 
222 aa  107  1e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0443  beta-lactamase domain protein  36.26 
 
 
208 aa  107  1e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3033  beta-lactamase domain-containing protein  34.95 
 
 
225 aa  107  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2261  beta-lactamase-like protein  30.14 
 
 
219 aa  107  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1171  beta-lactamase domain protein  32.58 
 
 
303 aa  107  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.361402  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3167  beta-lactamase domain protein  35.82 
 
 
231 aa  106  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0163096  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0068  metallo-beta-lactamase superfamily protein  33.49 
 
 
212 aa  106  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0554126  normal  0.354369 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6047  hydroxyacylglutathione hydrolase W  36.1 
 
 
213 aa  106  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0800591  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3014  beta-lactamase domain protein  37.56 
 
 
213 aa  106  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.309827  normal  0.0865031 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0673  beta-lactamase domain-containing protein  37.2 
 
 
206 aa  106  4e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.20621  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>